Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_05864
Subject:
XM_011250520.2
Aligned Length:
3115
Identities:
2512
Gaps:
92

Alignment

Query    1  ATGGGCCGTGGGGCTGGCCGTGAGTACTCACC-TGCCGCCACCACGGCAG--------AGA----ATGGGGGCG  61
            |||||...|||   |||...|||...|| ||| ||.|||||||.| ||||        |||    |.|.|..||
Sbjct    1  ATGGGGTCTGG---TGGTTCTGACAGCT-ACCGTGTCGCCACCTC-GCAGGACAAAAAAGATGACAAGAGCTCG  69

Query   62  -GCAAGAAGAAACAG-AAGGAGAA---------GGAACTGGATGAGCTGAAGAAGGAGGTGGCAATGGATGACC  124
             .|||||||    || ||||..||         |||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||...||.|
Sbjct   70  CCCAAGAAG----AGCAAGGCCAAAGAGCGCCGGGACCTGGATGACCTCAAGAAGGAAGTGGCTATGACAGAGC  139

Query  125  ACAAGCTGTCCTTGGATGAGCTGGGCCGCAAATACCA-AGTGGACCT--GTCCAAGGGCCTCACCAAC-CAG-C  193
            |||||.||||..|.||.|||.|..||||.||||||.| |.||  .||  ||.| ||||.||.||  || ||| .
Sbjct  140  ACAAGATGTCAGTAGAAGAGGTCTGCCGGAAATACAATACTG--ACTGCGTGC-AGGGTCTGAC--ACACAGTA  208

Query  194  GGGCTCAGGACGTTCTGGCTCGAGATGGGCCCAACGCCCTCACACCACCTCCCACAACCCCTGAGTGGGTCAAG  267
            ..||.|||||..|.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct  209  AAGCCCAGGAGATCCTAGCCCGGGATGGGCCTAACGCCCTCACACCACCGCCCACCACCCCAGAATGGGTCAAG  282

Query  268  TTCTGCCGTCAGCTTTTCGGGGGGTTCTCCATCCTGCTGTGGATTGGGGCTATCCTCTGCTTCCTGGCCTACGG  341
            ||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  283  TTCTGCCGGCAGCTGTTTGGTGGCTTCTCTATCCTGCTGTGGATCGGGGCAATCCTTTGCTTCCTGGCCTATGG  356

Query  342  CATCCAGGCTGCCATGGAGGATGAACCATCCAACGACAATCTATATCTGGGTGTGGTGCTGGCAGCTGTGGTCA  415
            |||||||||.|..|.|||||||||.||.|||...||||||||.||.|||||..|.||||||||.||.||.||.|
Sbjct  357  CATCCAGGCAGGGACGGAGGATGACCCTTCCGGTGACAATCTGTACCTGGGCATAGTGCTGGCCGCAGTCGTGA  430

Query  416  TTGTCACTGGCTGCTTCTCCTACTACCAGGAGGCCAAGAGCTCCAAGATCATGGATTCCTTCAAGAACATGGTA  489
            |..||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  431  TCATCACCGGCTGCTTCTCCTACTACCAAGAAGCCAAGAGTTCTAAGATCATGGAGTCCTTCAAGAACATGGTC  504

Query  490  CCTCAGCAAGCCCTTGTGATCCGGGAGGGAGAGAAGATGCAGATCAACGCAGAGGAAGTGGTGGTGGGAGACCT  563
            ||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.|.||.||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  505  CCCCAGCAAGCCCTTGTGATCCGGGAAGGTGAAAAGATGCAGGTGAATGCGGAGGAGGTGGTGGTCGGGGACCT  578

Query  564  GGTGGAGGTGAAGGGTGGAGACCGCGTCCCTGCTGACCTCCGGATCATCTCTTCTCATGGCTGTAAGGTGGATA  637
            |||||||.|.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||||..|.||||||||.||||||||.|
Sbjct  579  GGTGGAGATCAAGGGTGGTGACCGGGTGCCAGCTGACCTGCGCATCATCTCGGCCCATGGCTGCAAGGTGGACA  652

Query  638  ACTCATCCTTAACAGGAGAGTCGGAGCCCCAGACCCGCTCCCCCGAGTTCACCCATGAGAACCCCCTGGAGACC  711
            ||||.|||.|.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|.|||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct  653  ACTCCTCCCTGACTGGCGAATCTGAGCCTCAGACCCGCTCCCCGGACTGCACACACGACAACCCCCTGGAGACT  726

Query  712  CGCAATATCTGTTTCTTCTCCACCAACTGTGTTGAAGGCACTGCCAGGGGCATTGTGATTGCCACAGGAGACCG  785
            ||.||.|||...|||||.|||||||||||.||.||||||||.||..||||..|.|||.|.||||||||.|||||
Sbjct  727  CGGAACATCACCTTCTTTTCCACCAACTGCGTGGAAGGCACCGCTCGGGGTGTGGTGGTAGCCACAGGTGACCG  800

Query  786  GACGGTGATGGGCCGCATAGCTACTCTCGCCTCAGGCCTGGAGGTTGGGC-GGACACCCATAGCAATGGAGATT  858
            .||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||.|||||| ||||| .|||.|||||.||.||.||||||
Sbjct  801  CACCGTCATGGGCCGCATTGCCACCCTGGCCTCGGGCTTGGAGG-TGGGCAAGACGCCCATCGCCATTGAGATT  873

Query  859  GAACACTTCATCCAGCTGATCACAGGGGTCGCTGTATTCCTGGGGGTCTCCTTCTTCGTGCTCTCCCTCATCCT  932
            ||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.||
Sbjct  874  GAGCATTTCATCCAGCTCATTACGGGCGTGGCCGTGTTCCTGGGCGTGTCCTTCTTCATCCTCTCTCTCATTCT  947

Query  933  GGGCTACAGCTGGCTGGAGGCAGTCATCTTCCTCATCGGCATCATAGTGGCCAACGTGCCTGAGGGGCTTCTGG  1006
            |||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  948  GGGTTACACCTGGCTCGAGGCAGTCATCTTCCTCATCGGCATCATTGTGGCCAATGTCCCAGAGGGGCTGCTGG  1021

Query 1007  CCACTGTCACTGTGTGCCTGACCCTGACAGCCAAGCGCATGGCACGGAAGAACTGCCTGGTGAAGAACCTGGAG  1080
            |.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022  CTACTGTCACGGTGTGTCTGACGCTGACCGCCAAGCGCATGGCTCGCAAGAACTGCCTGGTGAAGAACCTGGAG  1095

Query 1081  GCGGTGGAGACGCTGGGCTCCACGTCCACCATCTGCTCGGACAAGACGGGCACCCTCACCAAGAACCGCATGAC  1154
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 1096  GCGGTGGAGACGCTGGGCTCCACGTCCACCATCTGCTCGGACAAGACCGGCACTCTCACCCAGAACCGCATGAC  1169

Query 1155  CGTCGCCCACATGTGGTTCGACAACCAAATCCATGAGGCTGACACCACCGAAGATCAGTCTGGGGCCACTTTTG  1228
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||.||.||||.|
Sbjct 1170  CGTCGCCCACATGTGGTTTGACAACCAGATCCACGAGGCAGACACCACAGAGGATCAGTCAGGGACCTCTTTCG  1243

Query 1229  ACAAACGATCCCCTACGTGGACGGCCCTGTCTCGAATTGCTGGTCTCTGCAACCGCGCCGTCTTCAAGGCAGGA  1302
            ||||..|.||.|..||.|||..|||||||||.|..||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||..||.
Sbjct 1244  ACAAGAGCTCACACACCTGGGTGGCCCTGTCCCACATCGCCGGGCTCTGCAACCGGGCCGTCTTCAAGGGCGGG  1317

Query 1303  CAGGAGAACATCTCCGTGTCT-AAGCGGGACACAGCTGGTGATGCCTCTGAGTCAGCTCTGCTCAAGTGCATTG  1375
            |||||.||||||.|.|| .|| |||.|||||...||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1318  CAGGACAACATCCCAGT-ACTCAAGAGGGACGTGGCCGGTGATGCCTCCGAGTCTGCCCTGCTTAAGTGCATTG  1390

Query 1376  AGCTCTCCTGTGGCTCAGTGAGGAAA----ATGAGAG-ACAGAAACCCCAAG---GTGGCAGAGATTCCTTTCA  1441
            ||||.||||..||.||.||    |||    |||.||| ||.|||    ||||   |||||.||||||||.||||
Sbjct 1391  AGCTGTCCTCGGGTTCCGT----AAAGCTGATGCGAGAACGGAA----CAAGAAAGTGGCTGAGATTCCGTTCA  1456

Query 1442  ACTCTACCAACAAGTACCAGCTGTCTATCCACGAG--CGAG-------AAGACAGCCCCCAGAGCCACGTGCTG  1506
            ||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||  .|||       |.||||.||      |..||.||||.
Sbjct 1457  ACTCGACCAACAAATACCAGCTATCCATCCATGAGACTGAGGATCCCAATGACAACC------GGTACCTGCTA  1524

Query 1507  GTGATGAAGGGGGCCCCAGAGCGCATTCTGGACCGGTGCTCCACCATCCTGGTGCAGGGCAAGGAGATCCCGCT  1580
            |||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||..||||||||||..||||||||||||||...||.||
Sbjct 1525  GTGATGAAGGGCGCCCCCGAACGCATTCTGGACCGCTGTGCCACCATCCTCCTGCAGGGCAAGGAGCAGCCTCT  1598

Query 1581  CGACAAGGAGATGCAAGATGCCTTTCAAAATGCCTACATGGAGCTGGGGGGACTTGGGGAGCGTGTGCTGGGAT  1654
            .||..||||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1599  GGATGAGGAGATGAAGGAGGCCTTCCAGAATGCCTACCTGGAGCTTGGTGGCCTGGGCGAGCGTGTGCTGGGTT  1672

Query 1655  TCTGTCA--ACTGAATCTGCCATCTGGAA-AGTTTCCTCGGGGCTTCAAATTCGACACGGATGAGCTGAACTTT  1725
            ||||.||  |||  |.||||| |..|||| ||||.||...||||||....||.|||...|||||..|||||||.
Sbjct 1673  TCTGCCATTACT--ACCTGCC-TGAGGAACAGTTCCCCAAGGGCTTTGCCTTTGACTGTGATGACGTGAACTTC  1743

Query 1726  CCCACGGAGAAGCTTTGCTTTGTGGGGCTCATGTCTATGATTGACCCTCCCCGGGCTGCTGTGCCAGATGCTGT  1799
            .||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct 1744  ACCACAGACAACCTTTGCTTTGTGGGTCTCATGTCCATGATTGACCCTCCCCGGGCAGCCGTCCCTGACGCTGT  1817

Query 1800  GGGCAAGTGCCGAAGCGCAGGCATCAAGGTGATCATGGTAACCGGGGATCACCCTATCACAGCCAAGGCCATTG  1873
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1818  GGGCAAATGCCGAAGCGCAGGCATCAAGGTCATCATGGTCACCGGCGATCACCCCATCACTGCCAAGGCCATTG  1891

Query 1874  CCAAAGGCGTGGGCATCATATCAGAGGGTAACGAGACTGTGGAGGACATTGCAGCCCGGCTCAACATTCCCATG  1947
            ||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||..|.
Sbjct 1892  CCAAGGGTGTGGGTATCATCTCTGAGGGTAACGAGACTGTCGAAGACATCGCTGCCCGGCTCAACATCCCTGTC  1965

Query 1948  AGTCAAGTCAACCCCAGAGAAGCCAAGGCATGCGTGGTGCACGGCTCTGACCTGAAGGACATGACATCGGAGCA  2021
            ||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||.|||.|.||||||.|.|||||.||||||.|.||.||||||||
Sbjct 1966  AGCCAGGTGAACCCCAGGGATGCCAAAGCCTGTGTGATTCACGGCACCGACCTCAAGGACTTCACCTCGGAGCA  2039

Query 2022  GCTCGATGAGATCCTCAAGAACCACACAGAGATCGTCTTTGCTCGAACGTCTCCCCAGCAGAAGCTCATCATTG  2095
            |.|.||.|||||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 2040  GATTGACGAGATTCTGCAGAACCACACCGAGATCGTCTTTGCCCGAACCTCCCCTCAGCAGAAGCTCATCATCG  2113

Query 2096  TGGAGGGATGTCAGAGGCAGGGAGCCATTGTGGCCGTGACGGGTGACGGGGTGAACGACTCCCCTGCATTGAAG  2169
            |||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 2114  TGGAGGGCTGTCAGAGACAGGGAGCAATTGTGGCTGTGACTGGCGATGGTGTGAATGACTCCCCTGCTCTGAAG  2187

Query 2170  AAGGCTGACATTGGCATTGCCATGGGCATCTCTGGCTCTGACGTCTCTAAGCAGGCAGCCGACATGATCCTGCT  2243
            |||||||||||.||..|.|||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 2188  AAGGCTGACATCGGGGTGGCCATGGGCATTGCTGGCTCTGATGTCTCTAAGCAGGCTGCCGACATGATTCTGCT  2261

Query 2244  GGATGACAACTTTGCCTCCATCGTCACGGGGGTGGAGGAGGGCCGCCTGATCTTTGACAACTTGAAGAAATCCA  2317
            |||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2262  GGATGACAACTTTGCTTCCATTGTCACTGGTGTGGAGGAAGGCCGCCTGATCTTTGACAACCTGAAGAAATCCA  2335

Query 2318  TCGCCTACACCCTGACCAGCAACATCCCCGAGATCACCCCCTTCCTGCTGTTCATCATTGCCAACATCCCCCTA  2391
            ||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 2336  TCGCCTACACTCTGACTAGCAACATCCCTGAGATCACACCCTTCCTGCTCTTCATCATGGCTAACATCCCACTG  2409

Query 2392  CCTCTGGGCACTGTGACCATCCTTTGCATTGACCTGGGCACAGATATGGTCCCTGCCATCTCCTTGGCCTATGA  2465
            |||||.|||||..|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||.|||||||.||
Sbjct 2410  CCTCTTGGCACCATCACCATCCTCTGCATTGACCTGGGTACCGACATGGTCCCTGCAATCTCCCTGGCCTACGA  2483

Query 2466  GGCAGCTGAGAGTGATATCATGAAGCGGCAGCCACGAAACTCCCAGACGGACAAGCTGGTGAATGAGAGGCTCA  2539
            |||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||..|.|||.|.|..||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 2484  GGCTGCCGAGAGCGACATCATGAAGAGGCAGCCCAGGAACCCACGCACAGACAAACTGGTCAACGAAAGGCTCA  2557

Query 2540  TCAGCATGGCCTACGGACAGATCGGGATGATCCAGGCACTGGGTGGCTTCTTCACCTACTTTGTGATCCTGGCA  2613
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 2558  TCAGCATGGCCTACGGGCAGATTGGGATGATCCAGGCCCTCGGTGGTTTCTTCTCCTACTTTGTCATCCTGGCA  2631

Query 2614  GAGAACGGTTTCCTGCCATCACGG----CTACTGGGAATCCGCCTCGACTGGGATGACCGGACCATGAATGATC  2683
            ||.||.||.|||.||||    |||    ||..||||.|||||.|||.||||||||||.||.||..|.|||||.|
Sbjct 2632  GAAAATGGCTTCTTGCC----CGGAAACCTGGTGGGCATCCGGCTCAACTGGGATGATCGCACTGTCAATGACC  2701

Query 2684  TGGAGGACAGCTATGGACAGGAGTGGACCTATGAGCAGCGGAAGGTGGTGGAGTTCACGTGCCACACGGCATTC  2757
            |.||.|||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 2702  TAGAAGACAGTTATGGGCAGCAGTGGACTTATGAGCAGAGGAAGGTGGTAGAGTTCACATGCCACACAGCCTTC  2775

Query 2758  TTTGCCAGCATCGTGGTGGTGCAGTGGGCTGACCTCATCATCTGCAAGACCCGCCGCAACTCAGTCTTCCAGCA  2831
            ||||..||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|..|.|||||.|||||||||||
Sbjct 2776  TTTGTGAGTATCGTGGTGGTCCAGTGGGCTGACCTGATCATCTGCAAGACCAGGAGGAACTCCGTCTTCCAGCA  2849

Query 2832  GGGCATGAAGAACAAGATCCTGATTTTTGGGCTCCTGGAGGAGACGGCGTTGGCTGCCTTTCTCTCTTACTGCC  2905
            ||||||||||||.||||||.||||.||.||..|..|.|||||||||||..|.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 2850  GGGCATGAAGAATAAGATCTTGATCTTCGGCTTGTTTGAGGAGACGGCCCTCGCTGCCTTCCTGTCCTACTGCC  2923

Query 2906  CAGGCATGGGTGTAGCCCTCCGCATGTACCCGCTCAAAGTCACCTGGTGGTTCTGCGCCTTCCCCTACAGCCTC  2979
            |||||||||.|||.|||||.|||||||||||.|||||...||.||||||||||||.||||||||||||||..||
Sbjct 2924  CAGGCATGGATGTGGCCCTTCGCATGTACCCTCTCAAGCCCAGCTGGTGGTTCTGTGCCTTCCCCTACAGTTTC  2997

Query 2980  CTCATCTTCATCTATGATGAGGTCCGAAAGCTCATCCTGCGGCGGTATCCTGGTGGCTGGGTGGAGAAGGAGAC  3053
            |||||||||.|||||||||||.|.||.||.|||||||||||..||.|.||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 2998  CTCATCTTCGTCTATGATGAGATTCGCAAACTCATCCTGCGCAGGAACCCCGGGGGTTGGGTGGAGAAAGAGAC  3071

Query 3054  ATACTAC  3060
            .|||||.
Sbjct 3072  CTACTAT  3078