Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05865
- Subject:
- NM_001290469.1
- Aligned Length:
- 3040
- Identities:
- 2762
- Gaps:
- 2
Alignment
Query 1 ATGGGGGACAAGAAAGATGACAAGGACTCACCCAAGAAGAACAAGGGCAAGGAGCGCCGGGACCTGGATGACCT 74
|||||||||||.||||||||||||..|||.||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGGACAAAAAAGATGACAAGAGCTCGCCCAAGAAGAGCAAGGCCAAAGAGCGCCGGGACCTGGATGACCT 74
Query 75 CAAGAAGGAGGTGGCTATGACAGAGCACAAGATGTCAGTGGAAGAGGTCTGCCGGAAATACAACACAGACTGTG 148
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 75 CAAGAAGGAAGTGGCTATGACAGAGCACAAGATGTCAGTAGAAGAGGTCTGCCGGAAATACAATACTGACTGCG 148
Query 149 TGCAGGGTTTGACCCACAGCAAAGCCCAGGAGATCCTGGCCCGGGATGGGCCTAACGCACTCACGCCACCGCCT 222
||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 149 TGCAGGGTCTGACACACAGTAAAGCCCAGGAGATCCTAGCCCGGGATGGGCCTAACGCCCTCACACCACCGCCC 222
Query 223 ACCACCCCAGAGTGGGTCAAGTTTTGCCGGCAGCTCTTCGGGGGCTTCTCCATCCTGCTGTGGATCGGGGCTAT 296
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 ACCACCCCAGAATGGGTCAAGTTCTGCCGGCAGCTGTTTGGTGGCTTCTCTATCCTGCTGTGGATCGGGGCAAT 296
Query 297 CCTCTGCTTCCTGGCCTACGGTATCCAGGCGGGCACCGAGGACGACCCCTCTGGTGACAACCTGTACCTGGGCA 370
|||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 CCTTTGCTTCCTGGCCTATGGCATCCAGGCAGGGACGGAGGATGACCCTTCCGGTGACAATCTGTACCTGGGCA 370
Query 371 TCGTGCTGGCGGCCGTGGTGATCATCACTGGCTGCTTCTCCTACTACCAGGAGGCCAAGAGCTCCAAGATCATG 444
|.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 TAGTGCTGGCCGCAGTCGTGATCATCACCGGCTGCTTCTCCTACTACCAAGAAGCCAAGAGTTCTAAGATCATG 444
Query 445 GAGTCCTTCAAGAACATGGTGCCCCAGCAAGCCCTGGTGATCCGGGAAGGTGAGAAGATGCAGGTGAACGCTGA 518
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 445 GAGTCCTTCAAGAACATGGTCCCCCAGCAAGCCCTTGTGATCCGGGAAGGTGAAAAGATGCAGGTGAATGCGGA 518
Query 519 GGAGGTGGTGGTCGGGGACCTGGTGGAGATCAAGGGTGGAGACCGAGTGCCAGCTGACCTGCGGATCATCTCAG 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 519 GGAGGTGGTGGTCGGGGACCTGGTGGAGATCAAGGGTGGTGACCGGGTGCCAGCTGACCTGCGCATCATCTCGG 592
Query 593 CCCACGGCTGCAAGGTGGACAACTCCTCCCTGACTGGCGAATCCGAGCCCCAGACTCGCTCTCCCGACTGCACG 666
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 593 CCCATGGCTGCAAGGTGGACAACTCCTCCCTGACTGGCGAATCTGAGCCTCAGACCCGCTCCCCGGACTGCACA 666
Query 667 CACGACAACCCCTTGGAGACTCGGAACATCACCTTCTTTTCCACCAACTGTGTGGAAGGCACGGCTCGGGGCGT 740
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 667 CACGACAACCCCCTGGAGACTCGGAACATCACCTTCTTTTCCACCAACTGCGTGGAAGGCACCGCTCGGGGTGT 740
Query 741 GGTGGTGGCCACGGGCGACCGCACTGTCATGGGCCGTATCGCCACCCTGGCATCAGGGC-TGGAGGTGGGCAAG 813
||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|| |||| ||||||||||||||
Sbjct 741 GGTGGTAGCCACAGGTGACCGCACCGTCATGGGCCGCATTGCCACCCTGGCCTC-GGGCTTGGAGGTGGGCAAG 813
Query 814 ACGCCCATCGCCATCGAGATTGAGCACTTCATCCAGCTCATCACCGGCGTGGCTGTCTTCCTGGGTGTCTCCTT 887
||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 814 ACGCCCATCGCCATTGAGATTGAGCATTTCATCCAGCTCATTACGGGCGTGGCCGTGTTCCTGGGCGTGTCCTT 887
Query 888 CTTCATCCTCTCCCTCATTCTCGGATACACCTGGCTTGAGGCTGTCATCTTCCTCATCGGCATCATCGTGGCCA 961
||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 888 CTTCATCCTCTCTCTCATTCTGGGTTACACCTGGCTCGAGGCAGTCATCTTCCTCATCGGCATCATTGTGGCCA 961
Query 962 ATGTCCCAGAGGGTCTGCTGGCCACTGTCACTGTGTGTCTGACGCTGACCGCCAAGCGCATGGCCCGGAAGAAC 1035
|||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 962 ATGTCCCAGAGGGGCTGCTGGCTACTGTCACGGTGTGTCTGACGCTGACCGCCAAGCGCATGGCTCGCAAGAAC 1035
Query 1036 TGCCTGGTGAAGAACCTGGAGGCTGTAGAAACCCTGGGCTCCACGTCCACCATCTGCTCAGATAAGACAGGGAC 1109
|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1036 TGCCTGGTGAAGAACCTGGAGGCGGTGGAGACGCTGGGCTCCACGTCCACCATCTGCTCGGACAAGACCGGCAC 1109
Query 1110 CCTCACTCAGAACCGCATGACAGTCGCCCACATGTGGTTTGACAACCAGATCCACGAGGCTGACACCACTGAGG 1183
.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1110 TCTCACCCAGAACCGCATGACCGTCGCCCACATGTGGTTTGACAACCAGATCCACGAGGCAGACACCACAGAGG 1183
Query 1184 ACCAGTCAGGGACCTCATTTGACAAGAGTTCGCACACCTGGGTGGCCCTGTCTCACATCGCTGGGCTCTGCAAT 1257
|.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1184 ATCAGTCAGGGACCTCTTTCGACAAGAGCTCACACACCTGGGTGGCCCTGTCCCACATCGCCGGGCTCTGCAAC 1257
Query 1258 CGCGCTGTCTTCAAGGGTGGTCAGGACAACATCCCTGTGCTCAAGAGGGATGTGGCTGGGGATGCGTCTGAGTC 1331
||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1258 CGGGCCGTCTTCAAGGGCGGGCAGGACAACATCCCAGTACTCAAGAGGGACGTGGCCGGTGATGCCTCCGAGTC 1331
Query 1332 TGCCCTGCTCAAGTGCATCGAGCTGTCCTCTGGCTCCGTGAAGCTGATGCGTGAACGCAACAAGAAAGTGGCTG 1405
|||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1332 TGCCCTGCTTAAGTGCATTGAGCTGTCCTCGGGTTCCGTAAAGCTGATGCGAGAACGGAACAAGAAAGTGGCTG 1405
Query 1406 AGATTCCCTTCAATTCCACCAACAAATACCAGCTCTCCATCCATGAGACCGAGGACCCCAACGACAACCGATAC 1479
|||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1406 AGATTCCGTTCAACTCGACCAACAAATACCAGCTATCCATCCATGAGACTGAGGATCCCAATGACAACCGGTAC 1479
Query 1480 CTGCTGGTGATGAAGGGTGCCCCCGAGCGCATCCTGGACCGCTGCTCCACCATCCTGCTACAGGGCAAGGAGCA 1553
|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1480 CTGCTAGTGATGAAGGGCGCCCCCGAACGCATTCTGGACCGCTGTGCCACCATCCTCCTGCAGGGCAAGGAGCA 1553
Query 1554 GCCTCTGGACGAGGAAATGAAGGAGGCCTTCCAGAATGCCTACCTTGAGCTCGGTGGCCTGGGCGAGCGCGTGC 1627
|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1554 GCCTCTGGATGAGGAGATGAAGGAGGCCTTCCAGAATGCCTACCTGGAGCTTGGTGGCCTGGGCGAGCGTGTGC 1627
Query 1628 TTGGTTTCTGCCATTATTACCTGCCCGAGGAGCAGTTCCCCAAGGGCTTTGCCTTCGACTGTGATGACGTGAAC 1701
|.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1628 TGGGTTTCTGCCATTACTACCTGCCTGAGGAACAGTTCCCCAAGGGCTTTGCCTTTGACTGTGATGACGTGAAC 1701
Query 1702 TTCACCACGGACAACCTCTGCTTTGTGGGCCTCATGTCCATGATCGACCCACCCCGGGCAGCCGTCCCTGACGC 1775
||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 TTCACCACAGACAACCTTTGCTTTGTGGGTCTCATGTCCATGATTGACCCTCCCCGGGCAGCCGTCCCTGACGC 1775
Query 1776 GGTGGGCAAGTGTCGCAGCGCAGGCATCAAGGTCATCATGGTCACCGGCGATCACCCCATCACGGCCAAGGCCA 1849
.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1776 TGTGGGCAAATGCCGAAGCGCAGGCATCAAGGTCATCATGGTCACCGGCGATCACCCCATCACTGCCAAGGCCA 1849
Query 1850 TTGCCAAGGGTGTGGGCATCATCTCTGAGGGCAACGAGACTGTGGAGGACATCGCCGCCCGGCTCAACATTCCC 1923
||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1850 TTGCCAAGGGTGTGGGTATCATCTCTGAGGGTAACGAGACTGTCGAAGACATCGCTGCCCGGCTCAACATCCCT 1923
Query 1924 GTCAGCCAGGTTAACCCCCGGGATGCCAAGGCCTGCGTGATCCACGGCACCGACCTCAAGGACTTCACCTCCGA 1997
|||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1924 GTCAGCCAGGTGAACCCCAGGGATGCCAAAGCCTGTGTGATTCACGGCACCGACCTCAAGGACTTCACCTCGGA 1997
Query 1998 GCAAATCGACGAGATCCTGCAGAATCACACCGAGATCGTCTTCGCCCGCACATCCCCCCAGCAGAAGCTCATCA 2071
|||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1998 GCAGATTGACGAGATTCTGCAGAACCACACCGAGATCGTCTTTGCCCGAACCTCCCCTCAGCAGAAGCTCATCA 2071
Query 2072 TTGTGGAGGGCTGTCAGAGACAGGGTGCAATTGTGGCTGTGACCGGGGATGGTGTGAACGACTCCCCCGCTCTG 2145
|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2072 TCGTGGAGGGCTGTCAGAGACAGGGAGCAATTGTGGCTGTGACTGGCGATGGTGTGAATGACTCCCCTGCTCTG 2145
Query 2146 AAGAAGGCCGACATTGGGGTGGCCATGGGCATCGCTGGCTCTGACGTCTCCAAGCAGGCAGCTGACATGATCCT 2219
||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 2146 AAGAAGGCTGACATCGGGGTGGCCATGGGCATTGCTGGCTCTGATGTCTCTAAGCAGGCTGCCGACATGATTCT 2219
Query 2220 GCTGGACGACAACTTTGCCTCCATCGTCACAGGGGTGGAGGAGGGCCGCCTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGT 2293
||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 2220 GCTGGATGACAACTTTGCTTCCATTGTCACTGGTGTGGAGGAAGGCCGCCTGATCTTTGACAACCTGAAGAAAT 2293
Query 2294 CCATTGCCTACACCCTGACCAGCAATATCCCGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCG 2367
||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 2294 CCATCGCCTACACTCTGACTAGCAACATCCCTGAGATCACACCCTTCCTGCTCTTCATCATGGCTAACATCCCA 2367
Query 2368 CTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATGGTCCCTGCCATCTCACTGGCGTA 2441
|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2368 CTGCCTCTTGGCACCATCACCATCCTCTGCATTGACCTGGGTACCGACATGGTCCCTGCAATCTCCCTGGCCTA 2441
Query 2442 CGAGGCTGCCGAAAGCGACATCATGAAGAGACAGCCCAGGAACCCGCGGACGGACAAATTGGTCAATGAGAGAC 2515
||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||.||.||.|
Sbjct 2442 CGAGGCTGCCGAGAGCGACATCATGAAGAGGCAGCCCAGGAACCCACGCACAGACAAACTGGTCAACGAAAGGC 2515
Query 2516 TCATCAGCATGGCCTACGGGCAGATTGGAATGATCCAGGCTCTCGGTGGCTTCTTCTCTTACTTTGTGATCCTG 2589
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2516 TCATCAGCATGGCCTACGGGCAGATTGGGATGATCCAGGCCCTCGGTGGTTTCTTCTCCTACTTTGTCATCCTG 2589
Query 2590 GCAGAAAATGGCTTCTTGCCCGGCAACCTGGTGGGCATCCGGCTGAACTGGGATGACCGCACCGTCAATGACCT 2663
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2590 GCAGAAAATGGCTTCTTGCCCGGAAACCTGGTGGGCATCCGGCTCAACTGGGATGATCGCACTGTCAATGACCT 2663
Query 2664 GGAAGACAGTTACGGGCAGCAGTGGACATACGAGCAGAGGAAGGTGGTGGAGTTCACCTGCCACACGGCCTTCT 2737
.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 2664 AGAAGACAGTTATGGGCAGCAGTGGACTTATGAGCAGAGGAAGGTGGTAGAGTTCACATGCCACACAGCCTTCT 2737
Query 2738 TTGTGAGCATCGTTGTCGTCCAGTGGGCCGATCTGATCATCTGCAAGACCCGGAGGAACTCGGTCTTCCAGCAG 2811
|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2738 TTGTGAGTATCGTGGTGGTCCAGTGGGCTGACCTGATCATCTGCAAGACCAGGAGGAACTCCGTCTTCCAGCAG 2811
Query 2812 GGCATGAAGAACAAGATCCTGATCTTCGGGCTGTTTGAGGAGACGGCCCTGGCTGCCTTCCTGTCCTACTGCCC 2885
|||||||||||.||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 GGCATGAAGAATAAGATCTTGATCTTCGGCTTGTTTGAGGAGACGGCCCTCGCTGCCTTCCTGTCCTACTGCCC 2885
Query 2886 CGGCATGGACGTGGCCCTGCGCATGTACCCTCTCAAGCCCAGCTGGTGGTTCTGTGCCTTCCCCTACAGTTTCC 2959
.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886 AGGCATGGATGTGGCCCTTCGCATGTACCCTCTCAAGCCCAGCTGGTGGTTCTGTGCCTTCCCCTACAGTTTCC 2959
Query 2960 TCATCTTCGTCTACGACGAAATCCGCAAACTCATCCTGCGCAGGAACCCAGGGGGTTGGGTGGAGAAGGAAACC 3033
|||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2960 TCATCTTCGTCTATGATGAGATTCGCAAACTCATCCTGCGCAGGAACCCCGGGGGTTGGGTGGAGAAAGAGACC 3033
Query 3034 TACTAC 3039
|||||.
Sbjct 3034 TACTAT 3039