Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_05889
Subject:
NM_007542.5
Aligned Length:
1107
Identities:
979
Gaps:
3

Alignment

Query    1  ATGTGGCCCCTGTGGCGCCTCGTGTCTCTGCTGGCCCTGAGCCAGGCCCTGCCCTTTGAGCAGAGAGGCTTCTG  74
            |||||.||||||||||..|||...|..|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||..||.|||||
Sbjct    1  ATGTGTCCCCTGTGGCTACTCACCTTGCTGCTGGCCCTGAGCCAGGCCTTGCCCTTTGAGCAGAAGGGTTTCTG  74

Query   75  GGACTTCACCCTGGACGATGGGCCATTCATGATGAACGATGAGGAAGCTTCGGGCGCTGACACC---TCAGGCG  145
            ||||||||||.||||.|||||||...||||||||||.||||||||.|||||.||..|.||||||   |||||.|
Sbjct   75  GGACTTCACCTTGGATGATGGGCTGCTCATGATGAATGATGAGGAGGCTTCAGGTTCAGACACCACTTCAGGTG  148

Query  146  TCCTGGACCCGGACTCTGTCACACCCACCTACAGCGCCATGTGTCCTTTCGGCTGCCACTGCCACCTGCGGGTG  219
            |||..||||.|||||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  TCCCCGACCTGGACTCTGTCACACCTACCTTCAGTGCCATGTGTCCTTTCGGTTGCCACTGCCACCTGCGGGTT  222

Query  220  GTTCAGTGCTCCGACCTGGGTCTGAAGTCTGTGCCCAAAGAGATCTCCCCTGACACCACGCTGCTGGACCTGCA  293
            |||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  GTTCAGTGCTCTGACTTGGGTCTGAAGACTGTGCCCAAGGAGATCTCACCTGACACCACACTGCTAGACCTGCA  296

Query  294  GAACAACGACATCTCCGAGCTCCGCAAGGATGACTTCAAGGGTCTCCAGCACCTCTACGCCCTCGTCCTGGTGA  367
            ||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|
Sbjct  297  GAACAATGACATTTCTGAGCTTCGCAAGGATGACTTCAAAGGCCTCCAGCACCTCTACGCCCTGGTCTTGGTAA  370

Query  368  ACAACAAGATCTCCAAGATCCATGAGAAGGCCTTCAGCCCACTGCGGAAGCTGCAGAAGCTCTACATCTCCAAG  441
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  371  ACAATAAGATCTCCAAGATCCATGAGAAGGCCTTTAGCCCTCTGCGGAAGCTGCAAAAACTCTACATCTCCAAG  444

Query  442  AACCACCTGGTGGAGATCCCGCCCAACCTACCCAGCTCCCTGGTGGAGCTCCGCATCCACGACAACCGCATCCG  515
            |||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  445  AACCACCTGGTGGAGATTCCTCCCAACCTGCCCAGCTCCCTGGTAGAACTACGAATCCATGACAACCGTATCCG  518

Query  516  CAAGGTGCCCAAGGGAGTGTTCAGCGGGCTCCGGAACATGAACTGCATCGAGATGGGCGGGAACCCACTGGAGA  589
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  CAAAGTGCCCAAGGGCGTGTTCAGCGGGCTCCGGAACATGAACTGCATTGAGATGGGCGGGAATCCCCTGGAGA  592

Query  590  ACAGTGGCTTTGAACCTGGAGCCTTCGATGGCCTGAAGCTCAACTACCTGCGCATCTCAGAGGCCAAGCTGACT  663
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  ACAGTGGCTTTGAACCAGGAGCCTTTGATGGCCTGAAGCTCAATTACCTGCGCATCTCAGAGGCCAAGCTCACT  666

Query  664  GGCATCCCCAAAGACCTCCCTGAGACCCTGAATGAACTCCACCTAGACCACAACAAAATCCAGGCCATCGAACT  737
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||..|
Sbjct  667  GGCATCCCCAAAGATCTCCCTGAGACCCTGAACGAACTTCACCTGGACCACAACAAAATCCAGGCTATTGAGTT  740

Query  738  GGAGGACCTGCTTCGCTACTCCAAGCTGTACAGGCTGGGCCTAGGCCACAACCAGATCAGGATGATCGAGAACG  811
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||.||||.|||||.|||||..|||||||.|||||.|
Sbjct  741  GGAGGACCTACTTCGATACTCCAAGCTGTACAGGTTGGGCTTAGGTCACAATCAGATTCGGATGATTGAGAATG  814

Query  812  GGAGCCTGAGCTTCCTGCCCACCCTCCGGGAGCTCCACTTGGACAACAACAAGTTGGCCAGGGTGCCCTCAGGG  885
            ||||||||||.||.|||||.|||||..||||.||.||||||||||||||||||.||.||.|||||||..|.||.
Sbjct  815  GGAGCCTGAGTTTTCTGCCTACCCTGAGGGAACTTCACTTGGACAACAACAAGCTGTCCCGGGTGCCTGCTGGC  888

Query  886  CTCCCAGACCTCAAGCTCCTCCAGGTGGTCTATCTGCACTCCAACAACATCACCAAAGTGGGTGTCAACGACTT  959
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.|||||
Sbjct  889  CTCCCAGATCTCAAGCTCCTCCAGGTTGTCTATCTGCACTCCAACAACATCACCAAGGTGGGCATCAATGACTT  962

Query  960  CTGTCCCATGGGCTTCGGGGTGAAGCGGGCCTACTACAACGGCATCAGCCTCTTCAACAACCCCGTGCCCTACT  1033
            ||||||.|||||||||||.||.|||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  CTGTCCTATGGGCTTCGGAGTCAAGAGGGCCTACTATAATGGCATCAGCCTCTTCAACAACCCTGTGCCCTACT  1036

Query 1034  GGGAGGTGCAGCCGGCCACTTTCCGCTGCGTCACTGACCGCCTGGCCATCCAGTTTGGCAACTACAAAAAG  1104
            ||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1037  GGGAAGTGCAGCCTGCCACCTTCCGCTGCGTTACTGACCGCCTGGCCATCCAATTTGGAAATTATAAGAAG  1107