Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05933
• Subject: NM_009794.3
• Aligned Length: 2100
• Identities: 1841
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGGCATCGCGGCCAAGCTGGCGAAGGACCGGGAGGCGGCCGAGGGGCTGGGCTCCCACGAGAGGGCCAT  74
            |||||||||||||||...||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGGGCATCGCGATAAAGCTGGCCAAGGACCGCGAAGCGGCCGAGGGGCTGGGGTCGCATGAGAGAGCCAT  74

Query   75  CAAGTACCTCAACCAGGACTACGAGGCGCTGCGGAACGAGTGCCTGGAGGCCGGGACGCTCTTCCAGGACCCGT  148
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|
Sbjct   75  CAAGTACCTCAACCAGGACTACGAGACGCTGCGGAACGAGTGCCTGGAGGCCGGGGCGCTCTTCCAGGATCCTT  148

Query  149  CCTTCCCGGCCATCCCCTCGGCCCTGGGCTTCAAGGAGTTGGGGCCCTACTCCAGCAAAACCCGGGGCATCGAG  222
            |||||||.|||.|.||.||..||.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  149  CCTTCCCCGCCCTGCCGTCATCCTTGGGCTATAAGGAGTTGGGGCCCTACTCCAGCAAAACTCGGGGCATCGAA  222

Query  223  TGGAAGCGCCCCACGGAGATCTGCGCTGACCCCCAGTTTATCATTGGAGGAGCCACCCGCACAGACATCTGCCA  296
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGAAGCGGCCCACGGAGATCTGCGCTGACCCCCAGTTCATTATTGGAGGAGCCACCCGCACAGACATCTGCCA  296

Query  297  AGGAGCCCTAGGTGACTGCTGGCTGCTGGCAGCCATTGCCTCCCTCACCTTGAATGAAGAAATCCTGGCTCGAG  370
            |||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  297  AGGAGCCCTGGGGGACTGCTGGCTGCTGGCTGCCATCGCCTCCCTCACCTTGAATGAGGAAATCCTGGCTCGGG  370

Query  371  TCGTCCCCCTAAACCAGAGCTTCCAGGAAAACTATGCAGGGATCTTTCACTTCCAGTTCTGGCAATACGGCGAG  444
            |.||.||.|.|.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  TTGTGCCTCCAGATCAGAGCTTCCAGGAAAACTATGCAGGCATCTTCCACTTCCAGTTCTGGCAATATGGCGAG  444

Query  445  TGGGTGGAGGTGGTGGTGGATGACAGGCTGCCCACCAAGGACGGGGAGCTGCTCTTTGTGCATTCAGCCGAAGG  518
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  TGGGTGGAGGTGGTGGTGGACGACAGGCTGCCCACTAAGGACGGGGAGCTGCTCTTTGTGCATTCAGCTGAAGG  518

Query  519  GAGCGAGTTCTGGAGCGCCCTGCTGGAGAAGGCATACGCCAAGATCAACGGATGCTATGAAGCACTATCAGGGG  592
            |||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GAGTGAGTTCTGGAGTGCCCTTCTGGAGAAAGCCTATGCCAAGATCAATGGGTGCTATGAAGCACTCTCAGGGG  592

Query  593  GTGCCACCACTGAGGGCTTCGAAGACTTCACCGGAGGCATTGCTGAGTGGTATGAGTTGAAGAAGCCCCCTCCC  666
            ||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.||||||
Sbjct  593  GTGCCACCACGGAAGGCTTTGAAGACTTCACAGGAGGCATTGCTGAGTGGTATGAGCTGAGGAAGCCTCCTCCC  666

Query  667  AACCTGTTCAAGATCATCCAGAAAGCTCTGCAAAAAGGCTCTCTCCTTGGCTGCTCCATCGACATCACCAGCGC  740
            |||.|||||||||||||||||||.|||.||.|.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  667  AACTTGTTCAAGATCATCCAGAAGGCTTTGGAGAAAGGTTCTCTGCTTGGCTGCTCTATCGATATCACCAGCGC  740

Query  741  CGCGGACTCGGAGGCCATCACGTTTCAGAAGCTGGTGAAGGGGCACGCGTACTCGGTCACCGGAGCCGAGGAGG  814
            .||.||.||.||||||.|.||||..||||||.|||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCAGATTCTGAGGCCGTTACGTACCAGAAGTTGGTGAAAGGACATGCGTACTCTGTCACCGGAGCCGAGGAGG  814

Query  815  TTGAAAGTAACGGAAGCCTACAGAAACTGATCCGCATCCGAAATCCCTGGGGAGAAGTGGAGTGGACAGGGCGG  888
            ||||||||...||||||||.||||||.|||||||||||.|.||||||||||||.||||.||||||||.|||..|
Sbjct  815  TTGAAAGTTCAGGAAGCCTGCAGAAATTGATCCGCATCAGGAATCCCTGGGGACAAGTAGAGTGGACCGGGAAG  888

Query  889  TGGAATGACAACTGCCCAAGCTGGAACACTATAGACCCAGAGGAGAGGGAAAGGCTGACCAGACGGCATGAAGA  962
            |||||||||||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|..||||.||..||.|||..||||||.||.||
Sbjct  889  TGGAATGACAATTGCCCCAGCTGGAACACGGTTGACCCAGAAGTAAGGGCAAATCTAACCGAACGGCAGGAGGA  962

Query  963  TGGAGAATTCTGGATGTCTTTCAGTGACTTCCTGAGGCACTATTCCCGCCTGGAGATCTGTAACCTGACCCCAG  1036
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  963  CGGAGAATTCTGGATGTCCTTCAGTGACTTCCTGAGACACTACTCTCGCCTGGAGATCTGCAACCTGACCCCGG  1036

Query 1037  ACACTCTCACCAGCGATACCTACAAGAAGTGGAAACTCACCAAAATGGATGGGAACTGGAGGCGGGGCTCCACC  1110
            ||||.||||||.|.||..||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  ACACCCTCACCTGTGACTCCTATAAGAAGTGGAAACTCACCAAGATGGATGGGAACTGGAGGCGAGGCTCCACC  1110

Query 1111  GCGGGAGGTTGCAGGAACTACCCGAACACATTCTGGATGAACCCTCAGTACCTGATCAAGCTGGAGGAGGAGGA  1184
            ||.||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1111  GCAGGGGGCTGCAGGAATTACCCAAATACCTTCTGGATGAACCCTCAGTACCTAATTAAGCTGGAGGAAGAAGA  1184

Query 1185  TGAGGACGAGGAGGATGGGGAGAGCGGCTGCACCTTCCTGGTGGGGCTCATTCAGAAGCACCGACGGCGGCAGA  1258
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1185  CGAAGATGAGGAGGATGGGGAGAGAGGCTGTACCTTCCTGGTGGGTCTCATCCAGAAGCACCGGCGACGGCAGA  1258

Query 1259  GGAAGATGGGCGAGGACATGCACACCATCGGCTTTGGCATCTATGAGGTTCCAGAGGAGTTAAGTGGGCAGACC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||..|||||||||
Sbjct 1259  GGAAGATGGGCGAGGACATGCACACCATTGGCTTCGGCATCTATGAGGTTCCAGAGGAGCTAACAGGGCAGACC  1332

Query 1333  AACATCCACCTCAGCAAAAACTTCTTCCTGACGAATCGCGCCAGGGAGCGCTCAGACACCTTCATCAACCTCCG  1406
            ||||||||||||.||||||||||.|||||.||.|..||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1333  AACATCCACCTCGGCAAAAACTTTTTCCTCACAACCCGAGCCAGGGAGCGGTCAGATACCTTCATTAACCTCCG  1406

Query 1407  GGAGGTGCTCAACCGCTTCAAGCTGCCGCCAGGAGAGTACATTCTCGTGCCTTCCACCTTCGAACCCAACAAGG  1480
            .|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||..|.|||||.||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 1407  CGAGGTCCTCAACCGCTTCAAGCTGCCCCCGGGAGAGTATGTCCTCGTTCCCTCCACCTTCGAACCCCACAAGG  1480

Query 1481  ATGGGGATTTCTGCATCCGGGTCTTTTCTGAAAAGAAAGCTGACTACCAAGCTGTCGATGATGAAATCGAGGCC  1554
            ||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1481  ATGGCGATTTCTGCATCCGAGTCTTCTCGGAGAAGAAGGCTGACTACCAAGCTGTTGATGACGAGATCGAGGCC  1554

Query 1555  AATCTTGAAGAGTTCGACATCAGCGAGGATGACATTGATGATGGATTCAGGAGACTGTTTGCCCAGTTGGCAGG  1628
            ||..||||||||.|.|||..||..|||||.||||||||.|||||||||.|.||.||.||||..|||.||||.||
Sbjct 1555  AACATTGAAGAGATTGACGCCAATGAGGAGGACATTGACGATGGATTCCGAAGGCTCTTTGTTCAGCTGGCTGG  1628

Query 1629  AGAGGATGCGGAGATCTCTGCCTTTGAGCTGCAGACCATCCTGAGAAGGGTTCTAGCAAAGCGCCAAGATATCA  1702
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1629  AGAGGATGCAGAGATCTCTGCCTTTGAGCTGCAGACCATCTTAAGAAGAGTTCTAGCCAAACGCCAAGACATCA  1702

Query 1703  AGTCAGATGGCTTCAGCATCGAGACATGCAAAATTATGGTTGACATGCTAGATTCGGACGGGAGTGGCAAGCTG  1776
            |||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||...||.||||||||||||||.
Sbjct 1703  AGTCAGACGGCTTCAGCATCGAGACCTGTAAGATCATGGTGGACATGCTGGATGAAGATGGGAGTGGCAAGCTT  1776

Query 1777  GGGCTGAAGGAGTTCTACATTCTCTGGACGAAGATTCAAAAATACCAAAAAATTTACCGAGAAATCGACGTTGA  1850
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||
Sbjct 1777  GGCCTGAAGGAGTTCTACATCCTCTGGACGAAGATTCAGAAATACCAAAAAATCTACCGGGAAATCGATGTGGA  1850

Query 1851  CAGGTCTGGTACCATGAATTCCTATGAAATGCGGAAGGCATTAGAAGAAGCAGGTTTCAAGATGCCCTGTCAAC  1924
            |||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||.|.||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1851  CAGGTCTGGAACCATGAATTCCTACGAGATGCGGAAAGCACTGGAAGAAGCAGGTTTCAAGCTGCCCTGTCAAC  1924

Query 1925  TCCACCAAGTCATCGTTGCTCGGTTTGCAGATGACCAGCTCATCATCGATTTTGATAATTTTGTTCGGTGTTTG  1998
            |.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1925  TTCATCAAGTCATCGTTGCCCGGTTTGCAGACGACGAGCTAATCATCGACTTTGACAATTTTGTGCGGTGTTTG  1998

Query 1999  GTTCGGCTGGAAACGCTATTCAAGATATTTAAGCAGCTGGATCCCGAGAATACTGGAACAATAGAGCTCGACCT  2072
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||.|||||.||||
Sbjct 1999  GTCCGTCTGGAAACGCTATTCAAGATATTCAAGCAGCTAGACCCTGAGAACACTGGAACGATACAGCTCAACCT  2072

Query 2073  TATCTCTTGGCTCTGTTTCTCAGTACTT  2100
            |...||.|||||..||||.||||||||.
Sbjct 2073  TGCTTCGTGGCTGAGTTTTTCAGTACTC  2100