Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05976
- Subject:
- NM_019707.5
- Aligned Length:
- 2149
- Identities:
- 1870
- Gaps:
- 17
Alignment
Query 1 ATGCAGCCGAGAACTCCGCTCGTTCTGTGCGTTCTCCTGTCCCAGGTGCTGCTGCTAACATCTGCAGAAGATTT 74
|||||||||||||||||||||...||||||||.||.||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.|||.|
Sbjct 1 ATGCAGCCGAGAACTCCGCTCACCCTGTGCGTCCTGCTGTCCCAGGTGCTCCTGGTCACGTCTGCAGATGATCT 74
Query 75 GGACTGCACTCCTGGATTTCAGCAGAAAGTGTTCCATATCAATCAGCCAGCTGAATTCATTGAGGACCAGTCAA 148
|||.|||||.||||||||.||||.|||||||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||.|..
Sbjct 75 GGAGTGCACCCCTGGATTCCAGCGGAAAGTGTTACACATCCACCAGCCTGCCGAATTCATCGAGGACCAGCCTG 148
Query 149 TTCTAAACTTGACCTTCAGTGACTGTAAGGGAAACGACAAGCTACGCTATGAGGTCTCGAGCCCATACTTCAAG 222
|.||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||.|||||.|.|||.||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 149 TCCTAAACTTGACCTTCAATGACTGCAAGGGCAACGAGAAGCTGCACTACGAGGTCTCAAGCCCACACTTCAAG 222
Query 223 GTGAACAGCGATGGCGGCTTAGTTGCTCTGAGAAACATAACTGCAGTGGGCAAAACTCTGTTCGTCCATGCACG 296
|||||||||||.|||..||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||..||.|||||.||||||||..|
Sbjct 223 GTGAACAGCGACGGCACCTTAGTGGCTCTCAGGAACATCACTGCGGTGGGCAGGACCCTGTTTGTCCATGCGAG 296
Query 297 GACCCCCCATGCGGAAGATATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGGAAAGACATCCAGGGCTCCTTGCAGGATA 370
|||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GACTCCTCATGCTGAAGACATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGCAAAGACATCCAGGGCTCCTTGCAGGATA 370
Query 371 TATTTAAATTTGCAAGAACTTCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTATCTCCCATTTTAATTCCA 444
|.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct 371 TCTTTAAATTTGCAAGGACATCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTGTCCCCCATCTTGATCCCA 444
Query 445 GAGAATCAGAGACAGCCTTTCCCAAGAGATGTTGGCAAGGTAGTCGATAGTGACAGGCCAGAAAGGTCCAAGTT 518
|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||||||||
Sbjct 445 GAGAACCAGAGACAGCCCTTCCCCAGAGATGTCGGCAAGGTAGTCGATAGCGACAGACCCGAAGGGTCCAAGTT 518
Query 519 CCGGCTCACTGGAAAGGGAGTGGATCAAGAGCCTAAAGGAATTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGGAGCGTCT 592
|||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 519 CCGGCTCACCGGGAAGGGAGTGGATCAAGACCCTAAAGGAACTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGCAGTGTCT 592
Query 593 CCATGACACGGACCTTGGACAGAGAAGTAATCGCTGTTTATCAACTATTTGTGGAGACCACTGATGTCAATGGC 666
||.|||||||||||.|||||||||||...||||||..|||||||||.|.||||||.|||||.||||.||.||||
Sbjct 593 CCGTGACACGGACCCTGGACAGAGAAACGATCGCTACTTATCAACTGTATGTGGAAACCACGGATGCCAGTGGC 666
Query 667 AAAACTCTCGAGGGGCCGGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGATCAGAATGACAACCGACCGATCTTTCGGGA 740
||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|||||
Sbjct 667 AAAACTCTGGAAGGGCCAGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGACCAGAACGACAACAGACCCATCTTCCGGGA 740
Query 741 AGGCCCCTACATCGGCCACGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGCACCACAGTGATGCGGATGACAGCCTTTGATG 814
||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 741 AGGCCCTTACATCGGCCATGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGGACCACGGTGATGCGGATGACAGCGTTTGATG 814
Query 815 CAGATGACCCAGCCACCGATAATGCCCTCCTGCGGTATAATATCCGTCGGCAGACGCCTGACAAGCCATCTCCC 888
||||||||||.||.||.||.|||||.||||||.||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 815 CAGATGACCCGGCTACTGACAATGCTCTCCTGAGGTACAACATCCGTCAGCAGACGCCTGACAAGCCATCTCCT 888
Query 889 AACATGTTCTACATCGATCCTGAGAAAGGAGACATTGTCACTGTTGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCGAGAGAC 962
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 AACATGTTCTACATCGATCCCGAGAAAGGAGACATTGTCACCGTGGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCGGGAGAC 962
Query 963 TCTGGAAAATCCCAAGTATGAACTGATCATCGAGGCTCAAGATATGGCTGGACTGGATGTTGGATTAACAGGCA 1036
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.|||.|.|||||||
Sbjct 963 TCTGGAAAACCCCAAGTATGAACTGATCATCGAAGCTCAAGATATGGCAGGATTGGATGTCGGACTGACAGGCA 1036
Query 1037 CGGCCACAGCCACGATCATGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCC 1110
|.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGCCACAGCCACCATCGTGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCC 1110
Query 1111 ACAGTCGAGGAAGGAGCTGTGGGAGTTATTGTCAATTTGACAGTTGAAGATAAGGATGACCCCGCCACAGGTGC 1184
|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|||||||.||
Sbjct 1111 ACAGTGGAGGAGGGAGCTGTGGGGGTCATTGTCAACTTGACAGTGGAAGACAAAGACGACCCTACCACAGGAGC 1184
Query 1185 ATGGAGGGCTGCCTACACCATCATCAACGGAAACCCCGGGCAGAGCTTTGAAATCCACACCAACCCTCAAACCA 1258
.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1185 CTGGAGGGCTGCATACACCATCATCAATGGAAATCCTGGGCAGAGCTTCGAGATCCACACCAACCCACAGACCA 1258
Query 1259 ACGAAGGGATGCTTTCTGTTGTCAAACCATTGGACTATGAAATTTCTGCCTTCCACACCCTGCTGATCAAAGTG 1332
||||.||.|||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACGAGGGCATGCTCTCTGTGGTCAAGCCCCTGGACTATGAGATCTCTGCCTTTCACACCCTGCTGATCAAAGTG 1332
Query 1333 GAAAATGAAGACCCACTCGTACCCGACGTCTCCTACGGCCCCAGCTCCACAGCCACCGTCCACATCACTGTCCT 1406
||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333 GAGAATGAGGACCCACTGGTACCCGACGTCTCCTATGGCCCCAGCTCCACGGCAACTGTCCACATCACAGTCCT 1406
Query 1407 GGATGTCAACGAGGGCCCAGTCTTCTACCCAGACCCCATGATGGTGACCAGGCAGGAGGACCTCTCTGTGGGCA 1480
|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|..||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1407 GGATGTCAACGAGGGACCAGTCTTCTACCCGGACCCCATGATGGTGACTAAACAGGAGAACATCTCTGTGGGCA 1480
Query 1481 GCGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACGGACCCCGACTCCCTGCAGCATCAAACCATCAGGTATTCTGTTTACAAG 1554
|.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|.||||||
Sbjct 1481 GTGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACAGACCCAGACTCCCTGCAACATCAAACTATCAGGTACTCTATCTACAAG 1554
Query 1555 GACCCAGCAGGTTGGCTGAATATTAACCCCATCAATGGGACTGTTGACACCACAGCTGTGCTGGACCGTGAGTC 1628
|||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1555 GACCCAGCAGGCTGGCTGAGTATCAACCCCATCAATGGAACGGTGGACACCACAGCTGTGTTGGACCGGGAGTC 1628
Query 1629 CACATTTGTCGACAACAGCGTGTACACTGCTCTCTTCCTGGCAATTGACAGTGGCAACCCTCCCGCTACGGGCA 1702
|.||||.|||.|||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1629 CCCATTCGTCCACAACAGTGTGTACACGGCCCTGTTCCTGGCCATCGACAGTGGCAACCCTCCTGCAACTGGCA 1702
Query 1703 CTGGGACTTTGCTGATAACCCTGGAGGACGTGAATGACAATGCCCCGTTCATTTACCCCACAGTAGCTGAAGTC 1776
|.||||||.|||||||||||||.||||||.|.||||||||.||.||..||||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 1703 CCGGGACTCTGCTGATAACCCTAGAGGACATTAATGACAACGCTCCTGTCATTTACCCAACTGTGGCTGAGGTC 1776
Query 1777 TGTGATGATGCCAAAAACCTCAGTGTAGTCATTTTGGGAGCATCAGATAAGGATCTTCACCCGAATACAGATCC 1850
||.||||||||||.|||||||||.||.||||||.||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1777 TGCGATGATGCCAGAAACCTCAGCGTGGTCATTCTGGGGGCTTCGGACAAGGACCTTCACCCCAACACAGACCC 1850
Query 1851 TTTCAAATTTGAAATCCACAAACAAGCTGTTCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAGATCAACAATACACACG 1924
.|||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1851 CTTCAAGTTTGAGATTCATAAACAGACAGTCCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAAATCAACAACACCCACG 1924
Query 1925 CCCTGGTAAGCCTTCTTCAAAATCTGAACAAAGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCAGGGAAA 1998
||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1925 CCCTCGTGAGCCTTCTTCAGAATCTGAACAAGGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCAGGGAAG 1998
Query 1999 CCACCCATGACGAATATCACAGATCTCAGGGTACAAGTGTGCTCCTGCAGGAATTCCAAAGTGGACTGCAACGC 2072
||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1999 CCACCCATGACGAACATCACGGACCTCAGGGTGCAGGTGTGCTCTTGCAAGAACTCCAAAGTGGACTGCAACGG 2072
Query 2073 GGCGGGGGCCCTGCGCTTCAGCCTGCCCTCAG-----TCCTGCTCCTCAGCCTCTTCAGCTTAGCTTGTCTG-- 2139
|||.||||||||||.|.|||| |||||| |.||||||.||...|||.|||||||| |||||.|
Sbjct 2073 GGCTGGGGCCCTGCACCTCAG-----CCTCAGCTTGCTGCTGCTCTTCTCTCTCCTCAGCTTA--TTGTCAGGT 2139
Query 2140 --- 2139
Sbjct 2140 CTG 2142