Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05978
- Subject:
- XM_006520097.3
- Aligned Length:
- 2370
- Identities:
- 1532
- Gaps:
- 645
Alignment
Query 1 ATGAAAATTACTTGCACATCTTGCATCTGTCCAGTCCTAGTGTGTCTCTGTTTTGTGCAGAGGTGTTATGGAAC 74
||||.||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAATTACGAGCACATCTTGCATCTGTCCAGTCCTCGTGTGTCTCTGTTTTGTGCAGAGGTGTTATGGAAC 74
Query 75 TGCTCACCACAGCTCCATCAAGGTGATGAGAAACCAAACCAAACACATTGAAGGTGAAACCGAAGTCCATCATC 148
||||||||||||||||||.|||||||..|||||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 75 TGCTCACCACAGCTCCATTAAGGTGACCAGAAACCAAACCAAACACACTGAAGGGGAAACTGAAGTACACCATC 148
Query 149 GTCCCAAAAGGGGATGGGTATGGAATCAGTTCTTTGTTTTAGAAGAACATATGGGACCAGATCCTCAGTATGTT 222
|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 149 GTCCCAAGAGGGGATGGGTATGGAACCAGTTCTTTGTTTTAGAAGAACATATGGGACCAGACCCACAGTATGTT 222
Query 223 GGAAAGCTGCACTCCAATTCTGACAAAGGTGATGGATCTGTCAAGTACATCCTTACTGGAGAGGGTGCTGGGAC 296
|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 223 GGAAAACTGCACTCCAACTCCGACAAAGGTGATGGTTCTGTCAAGTACATCCTGACTGGAGAAGGGGCCGGGAC 296
Query 297 TATATTTATCATTGACGATACCACGGGTGATATCCACTCAACAAAAAGCCTAGACAGAGAGCAGAAGACCCACT 370
|||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TATATTTATCATTGATGACACCACAGGTGACATCCACTCAACCAAAAGCCTGGACAGAGAGCAGAAGACTCACT 370
Query 371 ATGTGCTTCATGCTCAAGCTATTGATAGACGTACAAACAAACCTCTTGAGCCTGAATCCGAGTTCATCATCAAA 444
|||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 371 ATGTGCTCCATGCCCAGGCTATTGACAGACGGACAAACAAGCCTCTTGAACCTGAGTCTGAGTTCATCATCAAA 444
Query 445 GTGCAAGACATCAATGACAACGCTCCAAAATTCACAGATGGACCATACATTGTTACTGTGCCTGAAATGTCAGA 518
||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGCAAGATATTAATGACAATGCCCCAAAGTTCACAGATGGACCATACATCGTTACTGTGCCTGAAATGTCAGA 518
Query 519 TATGGGTACCTCTGTTCTACAGGTGACAGCTACTGATGCAGATGACCCTACCTATGGAAACAGCGCTCGGGTGG 592
||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 519 TATGGGTACCTCTGTTCTGCAGGTGACAGCTACAGATGCAGATGACCCCACCTATGGGAACAGTGCTCGAGTTG 592
Query 593 TTTACAGCATTCTCCAGGGACAACCCTACTTCTCCGTCGACCCTAAAACAGGAGTTATTAGAACGGCCTTACAT 666
|||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||.||||.||.|||||.
Sbjct 593 TTTACAGTATCCTGCAAGGACAACCTTATTTCTCTGTAGATCCTAAAACAGGAGTCATTCGAACAGCTTTACAC 666
Query 667 AACATGGACGGAGAAGCCAGAGAACATTACTCCGTAGTCATTCAAGCCAAAGACATGGCTGGGCAAGTTGGAGG 740
||||||||..|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 AACATGGATAGAGAAGCCAGAGAGCATTACTCAGTGGTCATTCAAGCCAAAGACATGGCTGGGCAAGTTGGCGG 740
Query 741 GCTTTCAGGATCTACAACAGTCAACATCACCTTAACCGATGTCAATGACAACACACCACGCTTTCCTCAAAAAC 814
.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||
Sbjct 741 ACTTTCTGGATCCACCACTGTCAATATTACCTTGACTGATGTCAATGACAACCCACCACGGTTCCCACAGAAAC 814
Query 815 ACTATCAGCTATATGTTCCTGAGTCAGCTCAAGTTGGTTCAGCTGTTGGGAAAATCAAGGCAAATGATGCTGAC 888
|||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 815 ACTATCAACTGTATGTTCCTGAGTCTGCTCAAGTTGGTTCAGCTGTTGGGAAAATCAAAGCAAATGATGCAGAC 888
Query 889 ACTGGCTCAAATGCTGACATGACCTACTCCATCATAAATGGTGATGGCATGGGAATATTCTCAATCTCCACTGA 962
||.||.||||||||.||.||||||||||||||||..|||||.||.||.||.|||.|.|||||.||||||||.||
Sbjct 889 ACAGGATCAAATGCAGATATGACCTACTCCATCACTAATGGAGACGGGATTGGAGTGTTCTCTATCTCCACGGA 962
Query 963 CAAAGAGACCAGAGAAGGAATCCTTTCTTTAAAGAAGCCACTGAACTATGAGAAAAAGAAGTCATATACCCTCA 1036
|||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 963 CAAGGACACCAGAGAAGGAATACTTTCCTTAAAAAAGCCACTGAACTATGAGAAAAAGAAGTCTTACACACTCA 1036
Query 1037 ACATAGAAGGAGCAAATACACATCTTGATTTTCGCTTTTCTCACTTGGGTCCTTTTAAAGATGCTACTATGCTG 1110
||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1037 ACATTGAAGGAGCAAACACACATCTGGATTTCCGTTTTTCCCACTTGGGTCCATTTAAGGATGCCACCATGCTG 1110
Query 1111 AAGATCATTGTTGGGGATGTAGATGAACCACCACTATTTTCCATGCCTTCCTACCTCATGGAAGTCTACGAAAA 1184
|||.|.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 AAGGTTATTGTTGGGGATGTGGATGAGCCACCACTCTTTTCTATGCCTTCCTATGTCATGGAAGTCTATGAAAA 1184
Query 1185 TGCCAAGATTGGGACCGTCGTTGGTACAGTTTTGGCACAAGATCCTGACAGTATTAACAGCTTAGTAAGATACT 1258
|||||||||||||||..|.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||||||..|||||||||||||||.||.|
Sbjct 1185 TGCCAAGATTGGGACAATTGTTGGCACTGTCTTGGCTCAGGATCCAGACAGTGCTAACAGCTTAGTAAGGTATT 1258
Query 1259 TCATCAACTACAATGTTGAAGACGACAGATTTTTCAACATTGATGCCAATACTGGGACCATTAGGACTACAAAG 1332
|||||||..|||.|..||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||..||||.
Sbjct 1259 TCATCAATCACAGTACTGAAGAGGAGAGATTTTTCAATATTGATGCCAATACTGGAACCATTAAGACATCAAAA 1332
Query 1333 GTTCTCGACAGAGAAGAAACTCCATGGTACAACATCACAGTCACTGCTTCAGAAATTGATAATCCTGATTTGCT 1406
||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||..||.||||||||||||||
Sbjct 1333 GTACTGGATAGAGAAGAAACACCATGGTACAATATCACAGTGACTGCTTCAGAAAACGACAATCCTGATTTGCT 1406
Query 1407 GAGCCATGTCACAGTGGGTATTAGAGTTCTGGATGTCAATGACAATCCACCCGAACTTGCCAGGGAATATGATA 1480
||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGCCATGTCTCCGTGGGTATTAGAGTTCTGGATGTCAATGACAATCCACCTGAACTTGCCAGGGAATATGATA 1480
Query 1481 TTATTGTATGTGAAAATTCTAAGCCTGGCCAGGTTATTCATACCATCAGTGCCACTGATAAAGATGATTTTGCC 1554
||.||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481 TTGTTGTCTGTGAGAATTCTAAGCCTGGTCAGGTTATCCACACCATCACTGCCACTGATAAAGATGACTTTGCC 1554
Query 1555 AATGGACCAAGGTTTAACTTCTTTCTTGATGAGCGCCTGCCTGTAAATCCAAACTTCACTCTGAAGGACAATGA 1628
||||||||.||.|||.|.||.||||||||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1555 AATGGACCGAGATTTCATTTTTTTCTTGATGAGCGCCTGCCCATGAACCCAAATTTCACACTTAAGGACAATGA 1628
Query 1629 AGATAACACAGCCAGCATTCTGACAAGGCGGAGGAGATTTAGTCGAACTGTTCAGGATGTGTATTATCTGCCCA 1702
Sbjct 1629 -------------------------------------------------------------------------- 1628
Query 1703 TTATGATCTCTGATGGTGGAATCCCCTCTCTCAGCAGCAGCAGCACCCTCACCATCAGGGTTTGTGCATGCGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 --------------------------------AGCAGCAGCAGCACCCTCACCATCAGGGTTTGTGCATGCGAG 1670
Query 1777 AGAGATGGGCGTGTGCGGACCTGCCATGCAGAAGCCTTCCTGTCCTCGGCTGGTTTGAGTACAGGAGCCTTAAT 1850
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1671 AGAGATGGGCGCGTGCGGACCTGCCATGCAGAAGCCTTCCTGTCCTCCGCTGGTT------------------- 1725
Query 1851 CGCTATTCTTCTCTGTGTTCTCATTCTCCTGGCAATTGTGGTACTTTTTATCACCCTGAGGCGCAGCAAAAAAG 1924
Sbjct 1726 -------------------------------------------------------------------------- 1725
Query 1925 AGCCCTTGATCATTTCAGAAGAGGATGTACGGGAGAACGTGGTCACCTATGATGATGAAGGAGGCGGAGAGGAA 1998
Sbjct 1726 -------------------------------------------------------------------------- 1725
Query 1999 GACACAGGGGCCTTTGACATCACAGCCTTGAGGAATCCTTCTGCTGCTGAGGAGCTCAAGTACCGGAGGGATAT 2072
Sbjct 1726 -------------------------------------------------------------------------- 1725
Query 2073 CAGACCTGAAGTGAAGCTCACTCCCAGACACCAGACATCATCCACCCTGGAAAGCATAGATGTTCAGGAATTTA 2146
Sbjct 1726 -------------------------------------------------------------------------- 1725
Query 2147 TTAAGCAAAGACTGGCAGAAGCAGACCTAGACCCTAGCGTTCCCCCTTATGACTCTCTTCAGACTTATGCCTAT 2220
Sbjct 1726 -------------------------------------------------------------------------- 1725
Query 2221 GAGGGTCAGAGATCAGAAGCTGGGTCTATCAGCTCGCTGGATTCAGCAACGACACAATCAGACCAGGATTATCA 2294
Sbjct 1726 -------------------------------------------------------------------------- 1725
Query 2295 CTACCTTGGAGACTGGGGACCCGAGTTTAAAAAGTTAGCTGAACTCTATGGAGAAATAGAATCTGAAAGAACAA 2368
Sbjct 1726 -------------------------------------------------------------------------- 1725
Query 2369 CT 2370
Sbjct 1726 -- 1725