Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06063
• Subject: NM_001164883.1
• Aligned Length: 2715
• Identities: 2579
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGACTTCGGCAACTTCACCTATCATTCTGAAATGGGACCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACGCTAACAGTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTTCGGCAACTTCACCTATCATTCTGAAATGGGACCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACGCTAACAGTGGA  74

Query   75  AAGGCTGTTGGAGCCACTTGTTACACAGGTGACTACACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGCCCATCTGGTAAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGGCTGTTGGAGCCACTTGTTACACAGGTGACTACACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGCCCATCTGGTAAAA  148

Query  149  AGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTACTAGCTGCCTCTGTAGAGCAAGCCACTCAGAATTTCCTGGAAAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTACTAGCTGCCTCTGTAGAGCAAGCCACTCAGAATTTCCTGGAAAAG  222

Query  223  GGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGTCAAGATCTCAAAGAAGAGTTGGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGCAAACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGTCAAGATCTCAAAGAAGAGTTGGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGCAAACA  296

Query  297  AGGTGAGACGATGCGGATCGCCTCCTCCGAGTTTGCAGATGACCCTTGCTCGTCGGTAAAGCGCGGCACCATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGTGAGACGATGCGGATCGCCTCCTCCGAGTTTGCAGATGACCCTTGCTCGTCGGTAAAGCGCGGCACCATGG  370

Query  371  TACGGGCGGCAAGGGCTTTGCTCTCCGCGGTGACACGCTTACTCATCCTGGCGGACATGGCAGATGTCATGAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACGGGCGGCAAGGGCTTTGCTCTCCGCGGTGACACGCTTACTCATCCTGGCGGACATGGCAGATGTCATGAGA  444

Query  445  CTTTTATCCCATCTGAAAATTGTGGAAGAGGCCCTGGAAGCTGTCAAAAATGCTACAAATGAGCAAGACCTTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTTTATCCCATCTGAAAATTGTGGAAGAGGCCCTGGAAGCTGTCAAAAATGCTACAAATGAGCAAGACCTTGC  518

Query  519  AAACCGTTTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGAAACTTAACTATGTAGCAGCAAGAAGACAACAGGAGCTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAACCGTTTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGAAACTTAACTATGTAGCAGCAAGAAGACAACAGGAGCTGA  592

Query  593  AGGATCCTCACTGTCGGGATGAGATGGCAGCCGCCCGAGGGGCTCTGAAGAAGAATGCCACAATGCTGTACACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGATCCTCACTGTCGGGATGAGATGGCAGCCGCCCGAGGGGCTCTGAAGAAGAATGCCACAATGCTGTACACG  666

Query  667  GCCTCTCAAGCATTTCTCCGCCACCCAGATGTCGCCGCTACGAGAGCCAACCGAGATTATGTGTTCAAACAAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCTCTCAAGCATTTCTCCGCCACCCAGATGTCGCCGCTACGAGAGCCAACCGAGATTATGTGTTCAAACAAGT  740

Query  741  CCAGGAGGCCATCGCCGGCATCTCCAATGCTGCTCAAGCTACCTCGCCCACTGACGAAGCCAAGGGCCACACGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGGAGGCCATCGCCGGCATCTCCAATGCTGCTCAAGCTACCTCGCCCACTGACGAAGCCAAGGGCCACACGG  814

Query  815  GCATCGGCGAGCTGGCTGCGGCTCTTAATGAGTTTGACAATAAGATTATCCTGGACCCCATGACGTTCAGCGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCATCGGCGAGCTGGCTGCGGCTCTTAATGAGTTTGACAATAAGATTATCCTGGACCCCATGACGTTCAGCGAG  888

Query  889  GCCAGGTTCCGGCCGTCCCTGGAGGAGAGGCTGGAGAGCATCATCAGCGGCGCAGCGCTGATGGCCGACTCCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCAGGTTCCGGCCGTCCCTGGAGGAGAGGCTGGAGAGCATCATCAGCGGCGCAGCGCTGATGGCCGACTCCTC  962

Query  963  CTGCACGCGAGACGACCGGCGCGAGAGGATCGTGGCGGAGTGCAACGCCGTGCGGCAGGCGCTCCAGGACCTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGCACGCGAGACGACCGGCGCGAGAGGATCGTGGCGGAGTGCAACGCCGTGCGGCAGGCGCTCCAGGACCTGC  1036

Query 1037  TCAGCGAGTACATGAATAATACTGGAAGGAAAGAAAAAGGAGATCCTCTCAACATTGCGATTGATAAGATGACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAGCGAGTACATGAATAATACTGGAAGGAAAGAAAAAGGAGATCCTCTCAACATTGCGATTGATAAGATGACT  1110

Query 1111  AAGAAAACAAGAGATCTAAGGAGACAGCTTCGGAAAGCAGTGATGGATCACATATCTGACTCTTTCCTGGAAAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGAAAACAAGAGATCTAAGGAGACAGCTTCGGAAAGCAGTGATGGATCACATATCTGACTCTTTCCTGGAAAC  1184

Query 1185  CAATGTTCCTTTGCTAGTTCTCATTGAGGCTGCAAAGAGCGGAAATGAAAAGGAAGTGAAAGAATATGCCCAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAATGTTCCTTTGCTAGTTCTCATTGAGGCTGCAAAGAGCGGAAATGAAAAGGAAGTGAAAGAATATGCCCAAG  1258

Query 1259  TTTTCCGTGAGCATGCCAACAAACTGGTAGAGGTTGCCAATTTGGCCTGTTCCATCTCCAACAATGAAGAAGGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTTCCGTGAGCATGCCAACAAACTGGTAGAGGTTGCCAATTTGGCCTGTTCCATCTCCAACAATGAAGAAGGG  1332

Query 1333  GTGAAATTAGTTCGGATGGCAGCCACCCAGATTGACAGCCTGTGTCCCCAGGTCATCAATGCCGCTCTGACACT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGAAATTAGTTCGGATGGCAGCCACCCAGATTGACAGCCTGTGTCCCCAGGTCATCAATGCCGCTCTGACACT  1406

Query 1407  GGCTGCCCGGCCACAGAGCAAAGTTGCTCAGGATAACATGGACGTCTTCAAAGACCAGTGGGAGAAGCAGGTCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCTGCCCGGCCACAGAGCAAAGTTGCTCAGGATAACATGGACGTCTTCAAAGACCAGTGGGAGAAGCAGGTCC  1480

Query 1481  GAGTGTTGACAGAGGCCGTGGATGACATCACCTCAGTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAATCACATCTTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAGTGTTGACAGAGGCCGTGGATGACATCACCTCAGTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAATCACATCTTG  1554

Query 1555  GAGGATGTGAACAAGTGTGTGATAGCCCTCCAAGAGGGCGATGTGGACACTCTGGACCGGACTGCAGGGGCCAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGGATGTGAACAAGTGTGTGATAGCCCTCCAAGAGGGCGATGTGGACACTCTGGACCGGACTGCAGGGGCCAT  1628

Query 1629  CAGGGGCCGGGCAGCTCGAGTCATACACATCATCAATGCTGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTTTATACTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAGGGGCCGGGCAGCTCGAGTCATACACATCATCAATGCTGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTTTATACTG  1702

Query 1703  AGAAGGTGTTGGAAGCTACAAAATTGCTTTCTGAAACAGTGATGCCACGCTTCGCTGAACAAGTAGAGGTTGCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGAAGGTGTTGGAAGCTACAAAATTGCTTTCTGAAACAGTGATGCCACGCTTCGCTGAACAAGTAGAGGTTGCC  1776

Query 1777  ATTGAAGCCCTGAGTGCCAACGTTCCTCAACCGTTTGAGGAGAATGAGTTCATCGATGCCTCTCGCCTGGTGTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATTGAAGCCCTGAGTGCCAACGTTCCTCAACCGTTTGAGGAGAATGAGTTCATCGATGCCTCTCGCCTGGTGTA  1850

Query 1851  TGATGGCGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGATGATCAGGACCCCAGAAGAACTAGAGGATGATTCTGACT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGATGGCGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGATGATCAGGACCCCAGAAGAACTAGAGGATGATTCTGACT  1924

Query 1925  TTGAGCAAGAAGATTATGATGTGCGTAGCAGGACAAGTGTTCAGACTGAGGATGACCAGCTCATTGCAGGGCAG  1998
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTGAGCAGGAAGATTATGATGTGCGTAGCAGGACAAGTGTTCAGACTGAGGATGACCAGCTCATTGCAGGGCAG  1998

Query 1999  AGCGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCGCAGGAGGAGAAGGCAAAAATAGCTGAGCAGGTGGAGATATTCCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGCGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCGCAGGAGGAGAAGGCAAAAATAGCTGAGCAGGTGGAGATATTCCA  2072

Query 2073  TCAAGAGAAAAGCAAGCTGGATGCAGAAGTGGCCAAATGGGACGACAGCGGCAATGATATCATTGTACTGGCCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCAAGAGAAAAGCAAGCTGGATGCAGAAGTGGCCAAATGGGACGACAGCGGCAATGATATCATTGTACTGGCCA  2146

Query 2147  AGCAGATGTGTATGATCATGATGGAAATGACAGACTTCACAAGAGGCAAAGGCCCATTGAAAAATACATCTGAT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCAGATGTGTATGATCATGATGGAAATGACAGACTTCACAAGAGGCAAAGGCCCATTGAAAAATACATCTGAT  2220

Query 2221  GTCATTAATGCTGCCAAGAAAATTGCCGAAGCAGGTTCTCGAATGGACAAATTAGCTCGTGCTGTGGCTGATCA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTCATTAATGCTGCCAAGAAAATTGCCGAAGCAGGTTCTCGAATGGACAAATTAGCTCGTGCTGTGGCTGATCA  2294

Query 2295  GTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAGCCTACCTTCAACGAATTGCCTTGTATTGCCATCAGCTTA  2368
                                                                                      
Sbjct 2295  --------------------------------------------------------------------------  2294

Query 2369  ATATCTGCAGCAAGGTGAAGGCAGAAGTGCAGAATCTGGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGGGCTGGACAGTGCC  2442
                                                                         |||||||||||||
Sbjct 2295  -------------------------------------------------------------GCTGGACAGTGCC  2307

Query 2443  ACATCGCTTATCCAGGCAGCTAAAAACCTGATGAATGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCATCCTATGTGGCCTC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2308  ACATCGCTTATCCAGGCAGCTAAAAACCTGATGAATGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCATCCTATGTGGCCTC  2381

Query 2517  AACCAAATACCAGAAGGTCTATGGGACAGCAGCTGTCAACTCACCTGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCAG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2382  AACCAAATACCAGAAGGTCTATGGGACAGCAGCTGTCAACTCACCTGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCAG  2455

Query 2591  AGAAGAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCTGAAGAATTCCAGACACGAGTTCGACGAGGTTCTCAGAAGAAA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456  AGAAGAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCTGAAGAATTCCAGACACGAGTTCGACGAGGTTCTCAGAAGAAA  2529

Query 2665  CACATTTCGCCTGTACAGGCTTTAAGTGAATTCAAAGCAATGGATTCCTTC  2715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2530  CACATTTCGCCTGTACAGGCTTTAAGTGAATTCAAAGCAATGGATTCCTTC  2580