Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06063
Subject:
NM_001282598.1
Aligned Length:
939
Identities:
905
Gaps:
34

Alignment

Query   1  ----------------------------------MTSATSPIILKWDPKSLEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVN  40
                                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MSGLICLQYGLWHGQKIDFGGPRRLLQRNRGEGSMTSATSPIILKWDPKSLEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVN  74

Query  41  TSNKGPSGKKKGRSKKAHVLAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDP  114
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TSNKGPSGKKKGRSKKAHVLAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDP  148

Query 115  CSSVKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEFGKEMVKLNY  188
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CSSVKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEFGKEMVKLNY  222

Query 189  VAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAATRANRDYVFKQVQEAIAGISNAAQATS  262
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  VAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAATRANRDYVFKQVQEAIAGISNAAQATS  296

Query 263  PTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMTFSEARFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECN  336
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  PTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMTFSEARFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECN  370

Query 337  AVRQALQDLLSEYMNNTGRKEKGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGN  410
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AVRQALQDLLSEYMNNTGRKEKGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGN  444

Query 411  EKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDV  484
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  EKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDV  518

Query 485  FKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEM  558
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  FKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEM  592

Query 559  ENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRT  632
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRT  666

Query 633  PEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDD  706
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  PEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDD  740

Query 707  SGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLAYLQ  780
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  SGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLAYLQ  814

Query 781  RIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGLDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSP  854
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  RIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGLDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSP  888

Query 855  VVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF  905
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  VVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF  939