Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06063
Subject:
NM_001320810.1
Aligned Length:
953
Identities:
537
Gaps:
416

Alignment

Query   1  MTSATSPIILKWDPKSLEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVNTSNKGPSGKKKGRSKKAHVLAASVEQATQNFLEK  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSSVKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMR  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  LLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEFGKEMVKLNYVAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYT  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  ASQAFLRHPDVAATRANRDYVFKQVQEAIAGISNAAQATSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMTFSE  296
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 297  ARFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMNNTGRKEKGDPLNIAIDKMT  370
                                                                                   ||
Sbjct   1  ------------------------------------------------------------------------MT  2

Query 371  KKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   3  KKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEG  76

Query 445  VKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHIL  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  77  VKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHIL  150

Query 519  EDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 151  EDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVA  224

Query 593  IEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQ  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 225  IEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQ  298

Query 667  SARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSD  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299  SARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSD  372

Query 741  VINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSG----  810
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct 373  VINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGTGVQ  446

Query 811  --------------------------------------------LDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYVAST  840
                                                       ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447  STFTTFYEVDCDVIDGGRASQLSTHLPTCAEGAPIGSGSSDSSMLDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYVAST  520

Query 841  KYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF  905
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 521  KYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF  585