Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06063
• Subject: XM_017321372.1
• Aligned Length: 2715
• Identities: 2454
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACTTCGGCAACTTCACCTATCATTCTGAAATGGGACCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACGCTAACAGTGGA  74
            |||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGACTTCGGCAACTTCACCTATTATTTTAAAATGGGATCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACACTCACAGTGGA  74

Query   75  AAGGCTGTTGGAGCCACTTGTTACACAGGTGACTACACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGCCCATCTGGTAAAA  148
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  AAGACTATTGGAGCCACTTGTGACACAGGTGACAACACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGTCCGTCTGGTAAAA  148

Query  149  AGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTACTAGCTGCCTCTGTAGAGCAAGCCACTCAGAATTTCCTGGAAAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  AGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTGCTGGCAGCATCTGTAGAACAAGCTACTCAGAACTTCCTGGAAAAG  222

Query  223  GGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGTCAAGATCTCAAAGAAGAGTTGGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGCAAACA  296
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  223  GGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGCCAAGACCTCAAAGAAGAGTTAGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGGAAGCA  296

Query  297  AGGTGAGACGATGCGGATCGCCTCCTCCGAGTTTGCAGATGACCCTTGCTCGTCGGTAAAGCGCGGCACCATGG  370
            |||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  AGGTGAGACAATGCGGATTGCCTCCTCAGAGTTTGCAGATGACCCTTGCTCTTCTGTCAAGCGTGGCACCATGG  370

Query  371  TACGGGCGGCAAGGGCTTTGCTCTCCGCGGTGACACGCTTACTCATCCTGGCGGACATGGCAGATGTCATGAGA  444
            |.||.||.|||.|||||.||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  TGCGTGCAGCACGGGCTCTGCTATCGGCTGTGACACGCTTGCTCATCCTGGCCGACATGGCAGATGTCATGAGG  444

Query  445  CTTTTATCCCATCTGAAAATTGTGGAAGAGGCCCTGGAAGCTGTCAAAAATGCTACAAATGAGCAAGACCTTGC  518
            ||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  CTTTTATCGCATCTGAAAATTGTCGAGGAGGCCTTGGAAGCAGTCAAAAATGCCACAAATGAACAAGACCTTGC  518

Query  519  AAACCGTTTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGAAACTTAACTATGTAGCAGCAAGAAGACAACAGGAGCTGA  592
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|
Sbjct  519  AAACCGATTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGAAACTGAACTATGTAGCAGCAAGACGGCAGCAGGAGCTCA  592

Query  593  AGGATCCTCACTGTCGGGATGAGATGGCAGCCGCCCGAGGGGCTCTGAAGAAGAATGCCACAATGCTGTACACG  666
            ||||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  593  AGGACCCTCACTGTAGGGATGAGATGGCTGCAGCCCGTGGAGCCCTGAAGAAGAATGCCACCATGCTGTACACA  666

Query  667  GCCTCTCAAGCATTTCTCCGCCACCCAGATGTCGCCGCTACGAGAGCCAACCGAGATTATGTGTTCAAACAAGT  740
            |||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  667  GCCTCCCAAGCCTTCCTCCGGCATCCAGATGTTGCTGCTACAAGAGCCAACCGAGATTATGTATTTAAACAAGT  740

Query  741  CCAGGAGGCCATCGCCGGCATCTCCAATGCTGCTCAAGCTACCTCGCCCACTGACGAAGCCAAGGGCCACACGG  814
            |||.||||||||.||.||||||||||.|||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  CCAAGAGGCCATAGCTGGCATCTCCAGTGCTGCTCAGGCCACCTCCCCCACCGATGAAGCCAAAGGCCACACAG  814

Query  815  GCATCGGCGAGCTGGCTGCGGCTCTTAATGAGTTTGACAATAAGATTATCCTGGACCCCATGACGTTCAGCGAG  888
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  GCATCGGCGAGCTGGCTGCAGCCCTGAATGAGTTTGATAATAAGATCATCCTGGACCCCATGACATTCAGCGAG  888

Query  889  GCCAGGTTCCGGCCGTCCCTGGAGGAGAGGCTGGAGAGCATCATCAGCGGCGCAGCGCTGATGGCCGACTCCTC  962
            |||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||
Sbjct  889  GCCAGGTTCCGACCATCCCTGGAGGAGAGACTGGAGAGCATCATCAGTGGGGCTGCTCTCATGGCAGATTCCTC  962

Query  963  CTGCACGCGAGACGACCGGCGCGAGAGGATCGTGGCGGAGTGCAACGCCGTGCGGCAGGCGCTCCAGGACCTGC  1036
            ||||||.||.||.|||||.||.|||.|.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  963  CTGCACACGTGATGACCGCCGTGAGCGTATTGTGGCCGAGTGCAATGCAGTTCGACAGGCACTCCAGGACCTGC  1036

Query 1037  TCAGCGAGTACATGAATAATACTGGAAGGAAAGAAAAAGGAGATCCTCTCAACATTGCGATTGATAAGATGACT  1110
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1037  TAAGCGAGTACATGAATAACACTGGAAGGAAAGAGAAAGGAGACCCTCTCAACATTGCGATTGACAAGATGACC  1110

Query 1111  AAGAAAACAAGAGATCTAAGGAGACAGCTTCGGAAAGCAGTGATGGATCACATATCTGACTCTTTCCTGGAAAC  1184
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||
Sbjct 1111  AAGAAAACAAGAGATCTGAGGAGACAGCTTCGGAAAGCTGTGATGGATCACATCTCAGATTCTTTCTTGGAAAC  1184

Query 1185  CAATGTTCCTTTGCTAGTTCTCATTGAGGCTGCAAAGAGCGGAAATGAAAAGGAAGTGAAAGAATATGCCCAAG  1258
            ||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 1185  CAATGTCCCCTTGCTGGTTCTCATTGAGGCTGCGAAGAGCGGGAATGAGAAGGAGGTGAAGGAATACGCCCAAG  1258

Query 1259  TTTTCCGTGAGCATGCCAACAAACTGGTAGAGGTTGCCAATTTGGCCTGTTCCATCTCCAACAATGAAGAAGGG  1332
            ||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  TTTTCCGTGAACATGCCAACAAGCTGGTGGAGGTTGCCAATTTGGCTTGTTCCATCTCCAACAATGAGGAAGGG  1332

Query 1333  GTGAAATTAGTTCGGATGGCAGCCACCCAGATTGACAGCCTGTGTCCCCAGGTCATCAATGCCGCTCTGACACT  1406
            |||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1333  GTGAAATTAGTCAGAATGGCAGCCACCCAGATTGACAGCCTGTGTCCCCAAGTCATTAATGCTGCCCTCACACT  1406

Query 1407  GGCTGCCCGGCCACAGAGCAAAGTTGCTCAGGATAACATGGACGTCTTCAAAGACCAGTGGGAGAAGCAGGTCC  1480
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1407  GGCTGCTCGGCCACAGAGTAAAGTTGCTCAGGACAACATGGATGTCTTCAAAGACCAGTGGGAAAAGCAAGTCC  1480

Query 1481  GAGTGTTGACAGAGGCCGTGGATGACATCACCTCAGTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAATCACATCTTG  1554
            |.|||.|.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1481  GTGTGCTCACTGAGGCAGTGGATGACATCACCTCTGTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAACCATATCTTG  1554

Query 1555  GAGGATGTGAACAAGTGTGTGATAGCCCTCCAAGAGGGCGATGTGGACACTCTGGACCGGACTGCAGGGGCCAT  1628
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1555  GAGGATGTGAACAAATGTGTGATTGCCCTGCAAGAGGGAGATGTGGACACACTGGATCGCACAGCTGGGGCCAT  1628

Query 1629  CAGGGGCCGGGCAGCTCGAGTCATACACATCATCAATGCTGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTTTATACTG  1702
            ..|||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1629  ACGGGGCCGGGCAGCCCGGGTCATTCACATCATCAATGCAGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTCTATACAG  1702

Query 1703  AGAAGGTGTTGGAAGCTACAAAATTGCTTTCTGAAACAGTGATGCCACGCTTCGCTGAACAAGTAGAGGTTGCC  1776
            ||||.|||.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1703  AGAAAGTGCTGGAAGCCACAAAATTGCTTTCAGAAACAGTGATGCCACGCTTTGCTGAACAAGTTGAGGTGGCC  1776

Query 1777  ATTGAAGCCCTGAGTGCCAACGTTCCTCAACCGTTTGAGGAGAATGAGTTCATCGATGCCTCTCGCCTGGTGTA  1850
            ||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777  ATCGAAGCCCTGAGCGCCAATGTCCCTCAGCCATTCGAGGAGAACGAGTTCATCGATGCCTCGCGCCTGGTGTA  1850

Query 1851  TGATGGCGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGATGATCAGGACCCCAGAAGAACTAGAGGATGATTCTGACT  1924
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 1851  TGACGGTGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGATGATCAGGACTCCAGAAGAGCTAGAAGATGATTCCGACT  1924

Query 1925  TTGAGCAAGAAGATTATGATGTGCGTAGCAGGACAAGTGTTCAGACTGAGGATGACCAGCTCATTGCAGGGCAG  1998
            ||||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1925  TTGAGCAAGAGGATTATGATGTGCGGAGTCGGACAAGTGTTCAGACAGAGGACGACCAGCTCATTGCTGGACAG  1998

Query 1999  AGCGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCGCAGGAGGAGAAGGCAAAAATAGCTGAGCAGGTGGAGATATTCCA  2072
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1999  AGTGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCACAGGAGGAGAAAGCAAAAATAGCTGAACAGGTGGAGATTTTCCA  2072

Query 2073  TCAAGAGAAAAGCAAGCTGGATGCAGAAGTGGCCAAATGGGACGACAGCGGCAATGATATCATTGTACTGGCCA  2146
            .|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 2073  CCAAGAAAAAAGCAAGCTGGATGCTGAAGTGGCCAAGTGGGATGACAGCGGCAATGACATCATTGTGCTGGCCA  2146

Query 2147  AGCAGATGTGTATGATCATGATGGAAATGACAGACTTCACAAGAGGCAAAGGCCCATTGAAAAATACATCTGAT  2220
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCAGATGTGTATGATCATGATGGAGATGACAGACTTCACAAGAGGCAAAGGCCCACTGAAAAATACATCTGAT  2220

Query 2221  GTCATTAATGCTGCCAAGAAAATTGCCGAAGCAGGTTCTCGAATGGACAAATTAGCTCGTGCTGTGGCTGATCA  2294
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2221  GTCATTAATGCTGCCAAGAAGATTGCAGAAGCAGGCTCTCGAATGGACAAATTAGCGCGCGCTGTGGCTGATCA  2294

Query 2295  GTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAGCCTACCTTCAACGAATTGCCTTGTATTGCCATCAGCTTA  2368
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2295  GTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAGCCTACCTTCAGCGGATTGCTTTGTACTGCCATCAGCTTA  2368

Query 2369  ATATCTGCAGCAAGGTGAAGGCAGAAGTGCAGAATCTGGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGGGCTGGACAGTGCC  2442
            |.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2369  ACATCTGCAGCAAAGTGAAGGCCGAGGTTCAGAACCTAGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGGGCTGGACAGTGCT  2442

Query 2443  ACATCGCTTATCCAGGCAGCTAAAAACCTGATGAATGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCATCCTATGTGGCCTC  2516
            |||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2443  ACATCACTCATCCAGGCAGCCAAAAACCTGATGAATGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCGTCTTATGTAGCCTC  2516

Query 2517  AACCAAATACCAGAAGGTCTATGGGACAGCAGCTGTCAACTCACCTGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCAG  2590
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2517  AACTAAATACCAGAAGGTCTATGGAACAGCAGCTGTCAACTCTCCAGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCTG  2590

Query 2591  AGAAGAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCTGAAGAATTCCAGACACGAGTTCGACGAGGTTCTCAGAAGAAA  2664
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2591  AAAAGAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCTGAAGAATTCCAGACAAGAGTTAGACGGGGGTCTCAAAAGAAA  2664

Query 2665  CACATTTCGCCTGTACAGGCTTTAAGTGAATTCAAAGCAATGGATTCCTTC  2715
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2665  CACATTTCACCTGTGCAGGCTTTAAGTGAATTCAAGGCAATGGATTCCTTC  2715