Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06095
• Subject: NM_001320136.2
• Aligned Length: 1025
• Identities: 802
• Gaps: 214

Alignment

Query    1  ATGCTCCAGAAGCCCAAGAGCGTGAAGCTGCGGGCCCTGCGCAGCCCGAGGAAGTTCGGCGTGGCTGGCCGGAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTGCCAGGAGGTGCTGCGCAAGGGCTGTCTCCGCTTCCAGCTCCCTGAGCGCGGTTCCCGGCTGTGCCTGTACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGATGGCACGGAGCTGACGGAAGATTACTTCCCCA---GTGTTCCCGACAACGCCGAGCTGGTGCTGCTCACC  219
                                               |   ||.|||            .|||||..|.|  ||||
Sbjct    1  -----------------------------------ATGTGTCTTC------------TGCTGGACCGG--CACC  25

Query  220  ------TTGGGCCA--GGCCTGGCAGGGCTATGTGAGCGACATCAGGCGCTTCCTCAGTGCATTTCACGAGCCA  285
                  |||..|||  ||  ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  TTTTGTTTGTCCCATTGG--TGGCAG----ATGTGAGCGACATCAGGCGCTTCCTCAGTGCATTTCACGAGCCA  93

Query  286  CAGGTGGGGCTCATCCAGGCCGCCCAGCAGCTGCTGTGTGATGAGCAGGCCCCACAGAGGCAGAGGCTGCTGGC  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   94  CAGGTGGGGCTCATCCAGGCCGCCCAGCAGCTGCTGTGTGATGAGCAGGCCCCACAGAGGCAGAGGCTGCTGGC  167

Query  360  TGACCTCCTGCACAACGTCAGCCAGAACATCGCGGCCGAGACCCGGGCTGAGGACCCGCCGTGGTTTGAAGGCT  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  168  TGACCTCCTGCACAACGTCAGCCAGAACATCGCGGCCGAGACCCGGGCTGAGGACCCGCCGTGGTTTGAAGGCT  241

Query  434  TGGAGTCCCGATTTCAGAGCAAGTCTGGCTATCTGAGATACAGCTGTGAGAGCCGGATCCGGAGTTACCTGAGG  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  TGGAGTCCCGATTTCAGAGCAAGTCTGGCTATCTGAGATACAGCTGTGAGAGCCGGATCCGGAGTTACCTGAGG  315

Query  508  GAGGTGAGCTCCTACCCCTCCACAGTGGGTGCGGAGGCTCAGGAGGAATTCCTGCGGGTCCTCGGCTCCATGTG  581
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  GAGGTGAGCTCCTACCCCTCCACGGTGGGTGCGGAGGCTCAGGAGGAATTCCTGCGGGTCCTCGGCTCCATGTG  389

Query  582  CCAGAGGCTCCGGTCCATGCAGTACAATGGCAGCTACTTCGACAGAGGAGCCAAGGGCGGCAGCCGCCTCTGCA  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  CCAGAGGCTCCGGTCCATGCAGTACAATGGCAGCTACTTCGACAGAGGAGCCAAGGGCGGCAGCCGCCTCTGCA  463

Query  656  CACCGGAAGGCTGGTTCTCCTGCCAGGGTCCCTTTGACATGGACAGCTGCTTATCAAGACACTCCATCAACCCC  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  CACCGGAAGGCTGGTTCTCCTGCCAGGGTCCCTTTGACATGGACAGCTGCTTATCAAGACACTCCATCAACCCC  537

Query  730  TACAGTAACAGGGAGAGCAGGATCCTCTTCAGCACCTGGAACCTGGATCACATAATAGAAAAGAAACGCACCAT  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  TACAGTAACAGGGAGAGCAGGATCCTCTTCAGCACCTGGAACCTGGATCACATAATAGAAAAGAAACGCACCAT  611

Query  804  CATTCCTACACTGGTGGAAGCAATTAAGGAACAAGATGGAAGAGAAGTGGACTGGGAGTATTTTTATGGCCTGC  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  CATTCCTACACTGGTGGAAGCAATTAAGGAACAAGATGGAAGAGAAGTGGACTGGGAGTATTTTTATGGCCTGC  685

Query  878  TTTTTACCTCAGAGAACCTAAAACTAGTGCACATTGTCTGCCATAAGAAAACCACCCACAAGCTCAACTGTGAC  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  TTTTTACCTCAGAGAACCTAAAACTAGTGCACATTGTCTGCCATAAGAAAACCACCCACAAGCTCAACTGTGAC  759

Query  952  CCGAGCAGAATCTACAAACCCCAGACAAGGTTGAAGCGGAAGCAGCCTGTGCGGAAACGCCAG  1014
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  CCAAGCAGAATCTACAAACCCCAGACAAGGTTGAAGCGGAAGCAGCCTGTGCGGAAACGCCAG  822