Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06149
- Subject:
- NM_001300821.3
- Aligned Length:
- 1848
- Identities:
- 1831
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCTAACAGACTTTCTGGCTGAGGATGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCTAACAGACTTTCTGGCTGAGGATGG 74
Query 75 GGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATGTTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATGTTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAG 148
Query 149 ATGTTTCGACCACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTATAGGGCGCCTCCAATTGACCGTTCCATCCTTCCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGTTTCGACCACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTATAGGGCGCCTCCAATTGACCGTTCCATCCTTCCC 222
Query 223 ACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCAATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCAATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTT 296
Query 297 TCTAGGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCGAGGATTAAATATCAGTGCAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTAGGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCGAGGATTAAATATCAGTGCAG 370
Query 371 TGCGTTTACCACGTGAACCCAGCAATCCAGAGAGGTTGAAAGGTTTTGGTTATGCTGAATTTGAGGACCTGGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGCGTTTACCACGTGAACCCAGCAATCCAGAGAGGTTGAAAGGTTTTGGTTATGCTGAATTTGAGGACCTGGAT 444
Query 445 TCCCTGCTCAGTGCCCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAGGTAACAGGAGAATTCGAGTGGACGTTGCTGATCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCCCTGCTCAGTGCCCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAGGTAACAGGAGAATTCGAGTGGACGTTGCTGATCA 518
Query 519 AGCACAGGATAAAGACAGGGATGATCGTTCTTTTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCACAGGATAAAGACAGGGATGATCGTTCTTTTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAG 592
Query 593 ACTGGAGGGCTCGTCCTGCTACAGACAGCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGATGATAGCTTTGGAGAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTGGAGGGCTCGTCCTGCTACAGACAGCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGATGATAGCTTTGGAGAC 666
Query 667 AAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACCGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACCGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCG 740
Query 741 GGATATGGATCGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGATAGAGGCTATGATT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGATATGGATCGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGATAGAGGCTATGATT 814
Query 815 CCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTGGGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGGAGGCGGGGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTGGGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGGAGGCGGGGAC 888
Query 889 CGCTATGAAGACCGATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTCTCGGGATGATTA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGCTATGAAGACCGATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTCTCGGGATGATTA 962
Query 963 TAGGCGTGATGATAGAGGTCCCCCCCAAAGACCCAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAGGCGTGATGATAGAGGTCCCCCCCAAAGACCCAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATG 1036
Query 1037 ATTCCTCTGCTAGTACCTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAGCCTGTTGACACAGCT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATTCCTCTGCTAGTACCTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAGCCTGTTGACACAGCT 1110
Query 1111 GCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTACAGAAGGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTACAGAAGGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAA 1184
Query 1185 ACTAGAACGACGGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAACGGGAACGGTCGAGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACTAGAACGACGGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAACGGGAACGGTCGAGGA 1258
Query 1259 CAGGAAGTGAGTCATCACAAACTGGGACCTCCACCACATCTAGCAGAA---------------ATGCACGAAGG 1317
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1259 CAGGAAGTGAGTCATCACAAACTGGGACCTCCACCACATCTAGCAGAAGTAAGTCAGACCAGGATGCACGAAGG 1332
Query 1318 AGAGAGAGTGAGAAGTCTCTAGAAAATGAAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACC 1391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGAGAGAGTGAGAAGTCTCTAGAAAATGAAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACC 1406
Query 1392 TCCCAAACCTGATCAGCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAATGCTTGGGTGAAGCGAAGTT 1465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCCCAAACCTGATCAGCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAATGCTTGGGTGAAGCGAAGTT 1480
Query 1466 CTAACCCTCCTGCTCGATCTCAGAGCTCAGACACAGAGCAGCAGTCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCT 1539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTAACCCTCCTGCTCGATCTCAGAGCTCAGACACAGAGCAGCAGTCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCT 1554
Query 1540 CCAGCTCAACCATCTGAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGGGATGAATGCCCCAAAAGG 1613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCAGCTCAACCATCTGAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGGGATGAATGCCCCAAAAGG 1628
Query 1614 CCAAACTGGGAACTCTAGCCGTGGTCCAGGAGACGGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAG 1687
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCAAACTGGGAACTCTAGCCGTGGTCCAGGCGACGGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAG 1702
Query 1688 ATGGCAAAAAGGATCAAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAATCCAGCTTCTAAGTTC 1761
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703 ATGGCAAAAAGGATCAAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAATCCAGCTTCCAAGTTC 1776
Query 1762 AGTTCTGCAAGCAAGTATGCTGCTCTCTCTGTTGATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCCGAA 1833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGTTCTGCAAGCAAGTATGCTGCTCTCTCTGTTGATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCCGAA 1848