Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06149
• Subject: NM_001417.7
• Aligned Length: 1833
• Identities: 1831
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCTAACAGACTTTCTGGCTGAGGATGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCTAACAGACTTTCTGGCTGAGGATGG  74

Query   75  GGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATGTTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATGTTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAG  148

Query  149  ATGTTTCGACCACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTATAGGGCGCCTCCAATTGACCGTTCCATCCTTCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTTTCGACCACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTATAGGGCGCCTCCAATTGACCGTTCCATCCTTCCC  222

Query  223  ACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCAATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCAATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTT  296

Query  297  TCTAGGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCGAGGATTAAATATCAGTGCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTAGGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCGAGGATTAAATATCAGTGCAG  370

Query  371  TGCGTTTACCACGTGAACCCAGCAATCCAGAGAGGTTGAAAGGTTTTGGTTATGCTGAATTTGAGGACCTGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCGTTTACCACGTGAACCCAGCAATCCAGAGAGGTTGAAAGGTTTTGGTTATGCTGAATTTGAGGACCTGGAT  444

Query  445  TCCCTGCTCAGTGCCCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAGGTAACAGGAGAATTCGAGTGGACGTTGCTGATCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCCTGCTCAGTGCCCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAGGTAACAGGAGAATTCGAGTGGACGTTGCTGATCA  518

Query  519  AGCACAGGATAAAGACAGGGATGATCGTTCTTTTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCACAGGATAAAGACAGGGATGATCGTTCTTTTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAG  592

Query  593  ACTGGAGGGCTCGTCCTGCTACAGACAGCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGATGATAGCTTTGGAGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTGGAGGGCTCGTCCTGCTACAGACAGCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGATGATAGCTTTGGAGAC  666

Query  667  AAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACCGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACCGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCG  740

Query  741  GGATATGGATCGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGATAGAGGCTATGATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGATATGGATCGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGATAGAGGCTATGATT  814

Query  815  CCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTGGGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGGAGGCGGGGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTGGGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGGAGGCGGGGAC  888

Query  889  CGCTATGAAGACCGATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTCTCGGGATGATTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCTATGAAGACCGATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTCTCGGGATGATTA  962

Query  963  TAGGCGTGATGATAGAGGTCCCCCCCAAAGACCCAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAGGCGTGATGATAGAGGTCCCCCCCAAAGACCCAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATG  1036

Query 1037  ATTCCTCTGCTAGTACCTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAGCCTGTTGACACAGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTCCTCTGCTAGTACCTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAGCCTGTTGACACAGCT  1110

Query 1111  GCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTACAGAAGGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTACAGAAGGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAA  1184

Query 1185  ACTAGAACGACGGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAACGGGAACGGTCGAGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTAGAACGACGGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAACGGGAACGGTCGAGGA  1258

Query 1259  CAGGAAGTGAGTCATCACAAACTGGGACCTCCACCACATCTAGCAGAAATGCACGAAGGAGAGAGAGTGAGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGGAAGTGAGTCATCACAAACTGGGACCTCCACCACATCTAGCAGAAATGCACGAAGGAGAGAGAGTGAGAAG  1332

Query 1333  TCTCTAGAAAATGAAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACCTCCCAAACCTGATCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCTCTAGAAAATGAAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACCTCCCAAACCTGATCA  1406

Query 1407  GCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAATGCTTGGGTGAAGCGAAGTTCTAACCCTCCTGCTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAATGCTTGGGTGAAGCGAAGTTCTAACCCTCCTGCTC  1480

Query 1481  GATCTCAGAGCTCAGACACAGAGCAGCAGTCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCTCCAGCTCAACCATCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GATCTCAGAGCTCAGACACAGAGCAGCAGTCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCTCCAGCTCAACCATCT  1554

Query 1555  GAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGGGATGAATGCCCCAAAAGGCCAAACTGGGAACTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGGGATGAATGCCCCAAAAGGCCAAACTGGGAACTC  1628

Query 1629  TAGCCGTGGTCCAGGAGACGGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAGATGGCAAAAAGGATC  1702
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TAGCCGTGGTCCAGGCGACGGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAGATGGCAAAAAGGATC  1702

Query 1703  AAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAATCCAGCTTCTAAGTTCAGTTCTGCAAGCAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAATCCAGCTTCCAAGTTCAGTTCTGCAAGCAAG  1776

Query 1777  TATGCTGCTCTCTCTGTTGATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCCGAA  1833
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TATGCTGCTCTCTCTGTTGATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCCGAA  1833