Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06154
• Subject: NM_010488.4
• Aligned Length: 1155
• Identities: 1033
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ----------ATGGTT-----ATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC  59
                      ||||.|     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTGGAATGGCTTGAAGATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGACCGACATCCAATAC  74

Query   60  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||
Sbjct   75  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAGACAGGCGCCGCCACAGATGACAGCA  148

Query  134  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAGGAATTCAGGAGTCTCTTTGGGAGCATT  222

Query  208  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  281
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTCGTGAGAGACAAAATCACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  296

Query  282  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  370

Query  356  TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG  429
            |.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  TGTCCTACGCCCGCCCAAGCTCGGCCTCGATCAGGGATGCTAACCTGTATGTTAGTGGCCTTCCCAAGACCATG  444

Query  430  ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGT  503
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||.||||||
Sbjct  445  ACCCAGAAGGAGCTGGAGCAGCTTTTCTCTCAATACGGTCGCATCATCACCTCACGCATCCTGGTTGATCAAGT  518

Query  504  CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC  577
            ||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CACAGGGGTCTCTAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGAC  592

Query  578  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  651
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACAGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  666

Query  652  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA  725
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  667  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTGTACCAGTCCCCCAACAGGCGATACCCTGGCCCTCTCCACCACCAGGCTCA  740

Query  726  GAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAG----------------------------  771
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  741  AAGATTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGACTGATGTCTGGACCAGTCCCCCCTT  814

Query  772  --------------AGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGT  831
                          ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGCTTGTCCCCCCAGGTTCTCCCCAATCACCATTGACGGGATGACAAGTCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGT  888

Query  832  CACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCT  905
            ||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACACAGGGACAGGCTGGTGCATCTTCGTCTATAACCTGTCCCCTGATTCTGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCT  962

Query  906  CTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCG  979
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGGCCCCTTTGGCGCAGTGAACAACGTCAAGGTCATCCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCG  1036

Query  980  GCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGAC  1053
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1037  GCTTCGTCACCATGACCAACTACGATGAGGCAGCCATGGCCATCGCCAGCCTCAATGGCTATCGCCTGGGAGAC  1110

Query 1054  AGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1098
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1111  AGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAATCC  1155