Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06154
Subject:
NM_021952.5
Aligned Length:
1140
Identities:
1094
Gaps:
42

Alignment

Query    1  ATGGTTATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTC  74

Query   75  CAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCG  148

Query  149  TCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCC  222

Query  223  TGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGA  296

Query  297  TGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTC  370

Query  371  CGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTG  444
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGAGCTCTGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTG  444

Query  445  GAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGTCACAGGAGTGTCCAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGATCAAGTCACAGGAGTGTCCAG  518

Query  519  AGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGC  592

Query  593  CCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTC  666

Query  667  TCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCAGGCTGGA  740
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCCAGCTCTACCAGTCCCCCAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCAGGCTGGA  740

Query  741  CAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAG------------------------------------------A  772
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                          |
Sbjct  741  CAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGACTGATGTCTGGACCAGTCCCCCCTTCTGCTTGTCCCCCCA  814

Query  773  GGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGG  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGG  888

Query  847  TGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGG  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGG  962

Query  921  AGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGA  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGA  1036

Query  995  CCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTT  1068
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCGCCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTT  1110

Query 1069  TCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1140