Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06154
• Subject: XM_006502798.3
• Aligned Length: 1155
• Identities: 1028
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGGTTAT---------------GATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC  59
                  ||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ------ATGAGGCTCCAGAACCAGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGACCGACATCCAATAC  68

Query   60  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||
Sbjct   69  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAGACAGGCGCCGCCACAGATGACAGCA  142

Query  134  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  143  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAGGAATTCAGGAGTCTCTTTGGGAGCATT  216

Query  208  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  281
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTCGTGAGAGACAAAATCACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  290

Query  282  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  364

Query  356  TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG  429
            |.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  365  TGTCCTACGCCCGCCCAAGCTCGGCCTCGATCAGGGATGCTAACCTGTATGTTAGTGGCCTTCCCAAGACCATG  438

Query  430  ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGT  503
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||.||||||
Sbjct  439  ACCCAGAAGGAGCTGGAGCAGCTTTTCTCTCAATACGGTCGCATCATCACCTCACGCATCCTGGTTGATCAAGT  512

Query  504  CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC  577
            ||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  513  CACAGGGGTCTCTAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGAC  586

Query  578  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  651
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACAGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  660

Query  652  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA  725
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  661  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTGTACCAGTCCCCCAACAGGCGATACCCTGGCCCTCTCCACCACCAGGCTCA  734

Query  726  GAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAG----------------------------  771
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  735  AAGATTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGACTGATGTCTGGACCAGTCCCCCCTT  808

Query  772  --------------AGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGT  831
                          ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  CTGCTTGTCCCCCCAGGTTCTCCCCAATCACCATTGACGGGATGACAAGTCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGT  882

Query  832  CACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCT  905
            ||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  CACACAGGGACAGGCTGGTGCATCTTCGTCTATAACCTGTCCCCTGATTCTGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCT  956

Query  906  CTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCG  979
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  CTTTGGCCCCTTTGGCGCAGTGAACAACGTCAAGGTCATCCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCG  1030

Query  980  GCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGAC  1053
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1031  GCTTCGTCACCATGACCAACTACGATGAGGCAGCCATGGCCATCGCCAGCCTCAATGGCTATCGCCTGGGAGAC  1104

Query 1054  AGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1098
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1105  AGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAATCC  1149