Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06154
• Subject: XM_017319993.1
• Aligned Length: 1098
• Identities: 1028
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGTTATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTC  74
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------ATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGACCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTC  68

Query   75  CAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   69  CAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAGACAGGCGCCGCCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCG  142

Query  149  TCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  143  TCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAGGAATTCAGGAGTCTCTTTGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCC  216

Query  223  TGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGA  296
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  TGCAAACTCGTGAGAGACAAAATCACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGA  290

Query  297  TGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct  291  TGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTGTCCTACGCCCGCC  364

Query  371  CGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTG  444
            |.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  365  CAAGCTCGGCCTCGATCAGGGATGCTAACCTGTATGTTAGTGGCCTTCCCAAGACCATGACCCAGAAGGAGCTG  438

Query  445  GAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGTCACAGGAGTGTCCAG  518
            |||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||.||.||.||
Sbjct  439  GAGCAGCTTTTCTCTCAATACGGTCGCATCATCACCTCACGCATCCTGGTTGATCAAGTCACAGGGGTCTCTAG  512

Query  519  AGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  513  AGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGACTGAATGGCCAGAAGC  586

Query  593  CCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTC  666
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  CCAGCGGTGCTACAGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTC  660

Query  667  TCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCAGGCTGGA  740
            ||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  661  TCCCAGCTGTACCAGTCCCCCAACAGGCGATACCCTGGCCCTCTCCACCACCAGGCTCAAAGATTCAGGCTGGA  734

Query  741  CAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  735  CAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATCACCATTGACGGGATGACAAGTCTTGTGG  808

Query  815  GAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAG  888
            |||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  809  GAATGAACATCCCTGGTCACACAGGGACAGGCTGGTGCATCTTCGTCTATAACCTGTCCCCTGATTCTGATGAG  882

Query  889  AGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  883  AGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGCGCAGTGAACAACGTCAAGGTCATCCGTGACTTCAACACCAA  956

Query  963  CAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCACCAGCCTCAACG  1036
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.|
Sbjct  957  CAAGTGCAAGGGATTCGGCTTCGTCACCATGACCAACTACGATGAGGCAGCCATGGCCATCGCCAGCCTCAATG  1030

Query 1037  GGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1098
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1031  GCTATCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAATCC  1092