Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06177
- Subject:
- XM_006512526.3
- Aligned Length:
- 1849
- Identities:
- 1606
- Gaps:
- 41
Alignment
Query 1 ATGGAAGACTCCCAGGATTTAAATGAACAATCAGTAAAGAAAACGTGCACAGAATCAGATGTTTCACAATCTCA 74
||||||| .|||| ||||||| .||.||..||..|.||||..|..||
Sbjct 1 ATGGAAG----------------------TTCAG---AGAAAAC---TACGGATACAAGTTTTTCTGATGCT-- 44
Query 75 GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAGGACCTAGCAAGTCCTCATACTCTT-GTTGGAGGTGGTGATACTCCAGGT 147
|||||||||||||||.||||||||||||||.|||.| ||| ||||||||..|||||||.||.||.
Sbjct 45 ---------GTCTATGGAAATGCAAGACCTAGCAAGTCCCCATGC-CTTGGTTGGAGGCAGTGATACACCTGGG 108
Query 148 AGCTCCAAACTGGAAAAATCTAATCTCAGCAGCACATCAGTTACTACAAATGGGACAGGAGTGTCTCTTCTTGC 221
||||||||.|||||.||||||..||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 AGCTCCAAGCTGGATAAATCTGGTCTCAGCAGCACTTCAGTCACAACAAATGGGACAGGAGTGTCTCTTCTTGC 182
Query 222 AGTCAAAACAGAGCCCTTGAACAGCAGTGAAACCACAGCCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTG 295
|||||||||||||||||||.||||||||||..||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 AGTCAAAACAGAGCCCTTGCACAGCAGTGAGTCCACTACCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTG 256
Query 296 GGTCAGTAATTACAAGTAGTGGCTACAGCCCCAGATCAGCACATCAGTATTCCCCACAGCTGTATCCTTCCAAG 369
||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 257 GGTCAGTAATAACAAGCAGCGGCTACAGCCCCAGGTCGGCGCAGCAGTACTCTCCACAGCTGTACCCCTCCAAG 330
Query 370 CCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCTGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTATTCGGG 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 331 CCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCGGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTACTCTGG 404
Query 444 GATGCAGCAGCCAGCCGTCTACACAGCCTACTCACAGACAGGACAGCCCTACAGCTTGCCCACTTACGATTTGG 517
||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||..|.||||||.|.|
Sbjct 405 GATGCAGCAGCCGGCCGTCTACACAGCCTACTCGCAGACAGGACAGCCCTACAGCCTGCCTGCCTACGATCTTG 478
Query 518 GTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACAGAGAGTGGACTTTCCCAAACTCAGTCCCCATTACAGAGTGGCTGCCTC 591
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 479 GTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACGGAAAGTGGGCTTTCCCAAACTCAGTCCCCGTTACAGAGTGGCTGCCTG 552
Query 592 AGTTACAGCCCAGGGTTCTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACACCTTATTCTTACCAAATGCCAGGTTCTAGTTT 665
||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 553 AGCTACAGCCCTGGGTTTTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACGCCTTACTCTTACCAAATGCCAGGTTCCAGCTT 626
Query 666 TGCACCATCATCTACTATTTATGCAAATAATTCAGTTTCCAATTCAACAAATTTCAGTGGTTCACAACAGGATT 739
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.|||||||
Sbjct 627 TGCACCATCGTCTACTATTTATGCAAATAATTCCGTTTCTAATTCAACAAACTTCAGCAGCTCACAGCAGGATT 700
Query 740 ATCCATCCTATACAGCCTTTGGCCAAAACCAGTATGCACAGTATTATTCAGCATCAACGTATGGAGCGTATATG 813
|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct 701 ACCCATCCTACACAGCCTTTGGCCAAAACCAATATGCTCAGTATTACTCAGCATCAACCTATGGGGCATACATG 774
Query 814 ACATCGAATAACACAGCCGATGGCACACCCTCTTCAACCTCTACTTATCAGTTGCAGGAATCTCTCCCAGGACT 887
|||||.||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 775 ACATCAAACAACACAGCTGACGGCACATCATCGTCAACATCAACTTATCAGCTGCAGGAATCTCTCCAAGGACT 848
Query 888 GACTAACCAACCAGGAGAGTTCGATACCATGCAGAGTCCCTCCACACCCATCAAAGATCTTGATGAGAGAACCT 961
|||||.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 849 GACTAGCCAACCAGGAGAGTTTGATACAGTGCAGAGTCCCTCCACACCAATCAAAGATCTCGATGACAGAACAT 922
Query 962 GTAGGAGTTCTGGGTCAAAGTCCAGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCGCCTCCTGATAGTGACCTG 1035
||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 923 GTAGAAGTTCTGGGTCAAAGTCTCGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCACCTCCGGACAGTGACCTA 996
Query 1036 GAGCGTGTGTTTGTCTGGGATTTGGATGAAACCATCATTGTTTTTCACTCACTGCTCACCGGGTCTTATGCACA 1109
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 997 GAGCGTGTGTTTGTCTGGGACTTGGATGAAACCATCATCGTCTTCCACTCTCTCCTCACGGGCTCTTATGCACA 1070
Query 1110 GAAGTATGGCAAGGATCCCCCCATGGCTGTAACCCTTGGACTCCGCATGGAAGAAATGATTTTTAATCTTGCTG 1183
|||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1071 GAAGTATGGCAAGGATCCCCCAATGGCTGTGACTCTCGGGCTCCGGATGGAAGAAATGATCTTTAATCTTGCAG 1144
Query 1184 ATACTCATTTGTTTTTTAATGATTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCTGATGATAAT 1257
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1145 ATACACATTTGTTTTTTAATGACTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCCGACGACAAT 1218
Query 1258 GGGCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCAAACCTTTGTTT 1331
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1219 GGTCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCGAACCTTTGTTT 1292
Query 1332 GCCAACAGGTGTAAGAGGAGGGGTTGACTGGATGAGGAAGTTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAAGAATTAT 1405
||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1293 GCCAACAGGTGTGAGAGGAGGAGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAGGAATTAT 1366
Query 1406 ATAACACCTACAAGAACAACGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCCAAGAGGGATGCCTGGCTACAGTTAAGGGCA 1479
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1367 ATAACACCTACAAGAACAATGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCTAAGAGGGATGCATGGCTGCAGTTAAGGGCA 1440
Query 1480 GAGATTGAAGGTCTGACAGATTCCTGGCTAACAAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGCACTAGGAGTAA 1553
|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1441 GAGATCGAAGGCCTAACAGATTCCTGGCTAACGAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGTACTAGGAGTAA 1514
Query 1554 CTGCATAAATGTCTTGGTAACGACAACTCAACTGATCCCAGCACTTGCGAAGGTTCTACTCTATAGTTTAGGAG 1627
|||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||..||||||
Sbjct 1515 CTGTGTAAATGTCTTGGTAACGACAACCCAGCTGATTCCTGCTCTTGCAAAAGTCCTGCTCTACAGCCTAGGAG 1588
Query 1628 GTGCTTTCCCCATTGAGAATATTTACAGTGCAACTAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAACGAATAATGCAA 1701
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||.||...
Sbjct 1589 GTGCTTTCCCCATTGAGAACATTTACAGCGCAACGAAAATAGGCAAGGAAAGCTGTTTTGAGCGTATAGTGTCC 1662
Query 1702 AGGTTTGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAACAGGCAGCAAAAAAGCACAA 1775
||.|||||||..||..||...||||||||.|||||.|||||....||.||.||.||.||.||.||..|||||||
Sbjct 1663 AGATTTGGCACTAACATAACTTATGTTGTGATTGGAGATGGCCGGGATGAGGAGCACGCTGCTAACCAGCACAA 1736
Query 1776 CATGCCCTTCTGGAGGATATCCAGTCACTCAGACCTCCTGGCTCTCCACCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG 1848
|||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 CATGCCCTTTTGGAGGATATCAAGCCACTCGGACCTCTTGGCTCTACATCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG 1809