Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06177
• Subject: XM_006512529.3
• Aligned Length: 1849
• Identities: 1559
• Gaps: 95

Alignment

Query    1  ATGGAAGACTCCCAGGATTTAAATGAACAATCAGTAAAGAAAACGTGCACAGAATCAGATGTTTCACAATCTCA  74
            |||||||||.|||||||..|||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||||..||.||||
Sbjct    1  ATGGAAGACACCCAGGACCTAAATGAGCAATCTGTAAAGAAAACGTGCCCAGAAGCAGATGTTTCGGAACCTCA  74

Query   75  GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAGGACCTAGCAAGTCCTCATACTCTT-GTTGGAGGTGGTGATACTCCAGGT  147
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.| ||| ||||||||..|||||||.||.||.
Sbjct   75  GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAAGACCTAGCAAGTCCCCATGC-CTTGGTTGGAGGCAGTGATACACCTGGG  147

Query  148  AGCTCCAAACTGGAAAAATCTAATCTCAGCAGCACATCAGTTACTACAAATGGGACAGGAGTGTCTCTTCTTGC  221
            ||||||||.|||||.||||||..||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||               
Sbjct  148  AGCTCCAAGCTGGATAAATCTGGTCTCAGCAGCACTTCAGTCACAACAAATGGGACAGG---------------  206

Query  222  AGTCAAAACAGAGCCCTTGAACAGCAGTGAAACCACAGCCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTG  295
                                                                                      
Sbjct  207  --------------------------------------------------------------------------  206

Query  296  GGTCAGTAATTACAAGTAGTGGCTACAGCCCCAGATCAGCACATCAGTATTCCCCACAGCTGTATCCTTCCAAG  369
                ||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  207  ----AGTAATAACAAGCAGCGGCTACAGCCCCAGGTCGGCGCAGCAGTACTCTCCACAGCTGTACCCCTCCAAG  276

Query  370  CCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCTGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTATTCGGG  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  277  CCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCGGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTACTCTGG  350

Query  444  GATGCAGCAGCCAGCCGTCTACACAGCCTACTCACAGACAGGACAGCCCTACAGCTTGCCCACTTACGATTTGG  517
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||..|.||||||.|.|
Sbjct  351  GATGCAGCAGCCGGCCGTCTACACAGCCTACTCGCAGACAGGACAGCCCTACAGCCTGCCTGCCTACGATCTTG  424

Query  518  GTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACAGAGAGTGGACTTTCCCAAACTCAGTCCCCATTACAGAGTGGCTGCCTC  591
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  425  GTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACGGAAAGTGGGCTTTCCCAAACTCAGTCCCCGTTACAGAGTGGCTGCCTG  498

Query  592  AGTTACAGCCCAGGGTTCTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACACCTTATTCTTACCAAATGCCAGGTTCTAGTTT  665
            ||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  499  AGCTACAGCCCTGGGTTTTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACGCCTTACTCTTACCAAATGCCAGGTTCCAGCTT  572

Query  666  TGCACCATCATCTACTATTTATGCAAATAATTCAGTTTCCAATTCAACAAATTTCAGTGGTTCACAACAGGATT  739
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.|||||||
Sbjct  573  TGCACCATCGTCTACTATTTATGCAAATAATTCCGTTTCTAATTCAACAAACTTCAGCAGCTCACAGCAGGATT  646

Query  740  ATCCATCCTATACAGCCTTTGGCCAAAACCAGTATGCACAGTATTATTCAGCATCAACGTATGGAGCGTATATG  813
            |.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  647  ACCCATCCTACACAGCCTTTGGCCAAAACCAATATGCTCAGTATTACTCAGCATCAACCTATGGGGCATACATG  720

Query  814  ACATCGAATAACACAGCCGATGGCACACCCTCTTCAACCTCTACTTATCAGTTGCAGGAATCTCTCCCAGGACT  887
            |||||.||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct  721  ACATCAAACAACACAGCTGACGGCACATCATCGTCAACATCAACTTATCAGCTGCAGGAATCTCTCCAAGGACT  794

Query  888  GACTAACCAACCAGGAGAGTTCGATACCATGCAGAGTCCCTCCACACCCATCAAAGATCTTGATGAGAGAACCT  961
            |||||.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  795  GACTAGCCAACCAGGAGAGTTTGATACAGTGCAGAGTCCCTCCACACCAATCAAAGATCTCGATGACAGAACAT  868

Query  962  GTAGGAGTTCTGGGTCAAAGTCCAGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCGCCTCCTGATAGTGACCTG  1035
            ||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct  869  GTAGAAGTTCTGGGTCAAAGTCTCGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCACCTCCGGACAGTGACCTA  942

Query 1036  GAGCGTGTGTTTGTCTGGGATTTGGATGAAACCATCATTGTTTTTCACTCACTGCTCACCGGGTCTTATGCACA  1109
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  943  GAGCGTGTGTTTGTCTGGGACTTGGATGAAACCATCATCGTCTTCCACTCTCTCCTCACGGGCTCTTATGCACA  1016

Query 1110  GAAGTATGGCAAGGATCCCCCCATGGCTGTAACCCTTGGACTCCGCATGGAAGAAATGATTTTTAATCTTGCTG  1183
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1017  GAAGTATGGCAAGGATCCCCCAATGGCTGTGACTCTCGGGCTCCGGATGGAAGAAATGATCTTTAATCTTGCAG  1090

Query 1184  ATACTCATTTGTTTTTTAATGATTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCTGATGATAAT  1257
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1091  ATACACATTTGTTTTTTAATGACTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCCGACGACAAT  1164

Query 1258  GGGCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCAAACCTTTGTTT  1331
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1165  GGTCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCGAACCTTTGTTT  1238

Query 1332  GCCAACAGGTGTAAGAGGAGGGGTTGACTGGATGAGGAAGTTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAAGAATTAT  1405
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1239  GCCAACAGGTGTGAGAGGAGGAGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAGGAATTAT  1312

Query 1406  ATAACACCTACAAGAACAACGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCCAAGAGGGATGCCTGGCTACAGTTAAGGGCA  1479
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1313  ATAACACCTACAAGAACAATGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCTAAGAGGGATGCATGGCTGCAGTTAAGGGCA  1386

Query 1480  GAGATTGAAGGTCTGACAGATTCCTGGCTAACAAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGCACTAGGAGTAA  1553
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1387  GAGATCGAAGGCCTAACAGATTCCTGGCTAACGAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGTACTAGGAGTAA  1460

Query 1554  CTGCATAAATGTCTTGGTAACGACAACTCAACTGATCCCAGCACTTGCGAAGGTTCTACTCTATAGTTTAGGAG  1627
            |||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||..||||||
Sbjct 1461  CTGTGTAAATGTCTTGGTAACGACAACCCAGCTGATTCCTGCTCTTGCAAAAGTCCTGCTCTACAGCCTAGGAG  1534

Query 1628  GTGCTTTCCCCATTGAGAATATTTACAGTGCAACTAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAACGAATAATGCAA  1701
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||.||...
Sbjct 1535  GTGCTTTCCCCATTGAGAACATTTACAGCGCAACGAAAATAGGCAAGGAAAGCTGTTTTGAGCGTATAGTGTCC  1608

Query 1702  AGGTTTGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAACAGGCAGCAAAAAAGCACAA  1775
            ||.|||||||..||..||...||||||||.|||||.|||||....||.||.||.||.||.||.||..|||||||
Sbjct 1609  AGATTTGGCACTAACATAACTTATGTTGTGATTGGAGATGGCCGGGATGAGGAGCACGCTGCTAACCAGCACAA  1682

Query 1776  CATGCCCTTCTGGAGGATATCCAGTCACTCAGACCTCCTGGCTCTCCACCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG  1848
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683  CATGCCCTTTTGGAGGATATCAAGCCACTCGGACCTCTTGGCTCTACATCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG  1755