Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06177
- Subject:
- XM_006512530.3
- Aligned Length:
- 1848
- Identities:
- 1281
- Gaps:
- 408
Alignment
Query 1 ATGGAAGACTCCCAGGATTTAAATGAACAATCAGTAAAGAAAACGTGCACAGAATCAGATGTTTCACAATCTCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAGGACCTAGCAAGTCCTCATACTCTTGTTGGAGGTGGTGATACTCCAGGTA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCTCCAAACTGGAAAAATCTAATCTCAGCAGCACATCAGTTACTACAAATGGGACAGGAGTGTCTCTTCTTGCA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTCAAAACAGAGCCCTTGAACAGCAGTGAAACCACAGCCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GTCAGTAATTACAAGTAGTGGCTACAGCCCCAGATCAGCACATCAGTATTCCCCACAGCTGTATCCTTCCAAGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCTGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTATTCGGGG 444
|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1 --------------------------------------ATGTCGGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTACTCTGGG 36
Query 445 ATGCAGCAGCCAGCCGTCTACACAGCCTACTCACAGACAGGACAGCCCTACAGCTTGCCCACTTACGATTTGGG 518
|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||..|.||||||.|.||
Sbjct 37 ATGCAGCAGCCGGCCGTCTACACAGCCTACTCGCAGACAGGACAGCCCTACAGCCTGCCTGCCTACGATCTTGG 110
Query 519 TGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACAGAGAGTGGACTTTCCCAAACTCAGTCCCCATTACAGAGTGGCTGCCTCA 592
||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 111 TGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACGGAAAGTGGGCTTTCCCAAACTCAGTCCCCGTTACAGAGTGGCTGCCTGA 184
Query 593 GTTACAGCCCAGGGTTCTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACACCTTATTCTTACCAAATGCCAGGTTCTAGTTTT 666
|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 185 GCTACAGCCCTGGGTTTTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACGCCTTACTCTTACCAAATGCCAGGTTCCAGCTTT 258
Query 667 GCACCATCATCTACTATTTATGCAAATAATTCAGTTTCCAATTCAACAAATTTCAGTGGTTCACAACAGGATTA 740
||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||
Sbjct 259 GCACCATCGTCTACTATTTATGCAAATAATTCCGTTTCTAATTCAACAAACTTCAGCAGCTCACAGCAGGATTA 332
Query 741 TCCATCCTATACAGCCTTTGGCCAAAACCAGTATGCACAGTATTATTCAGCATCAACGTATGGAGCGTATATGA 814
.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 333 CCCATCCTACACAGCCTTTGGCCAAAACCAATATGCTCAGTATTACTCAGCATCAACCTATGGGGCATACATGA 406
Query 815 CATCGAATAACACAGCCGATGGCACACCCTCTTCAACCTCTACTTATCAGTTGCAGGAATCTCTCCCAGGACTG 888
||||.||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||.|||||||
Sbjct 407 CATCAAACAACACAGCTGACGGCACATCATCGTCAACATCAACTTATCAGCTGCAGGAATCTCTCCAAGGACTG 480
Query 889 ACTAACCAACCAGGAGAGTTCGATACCATGCAGAGTCCCTCCACACCCATCAAAGATCTTGATGAGAGAACCTG 962
||||.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 481 ACTAGCCAACCAGGAGAGTTTGATACAGTGCAGAGTCCCTCCACACCAATCAAAGATCTCGATGACAGAACATG 554
Query 963 TAGGAGTTCTGGGTCAAAGTCCAGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCGCCTCCTGATAGTGACCTGG 1036
|||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 555 TAGAAGTTCTGGGTCAAAGTCTCGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCACCTCCGGACAGTGACCTAG 628
Query 1037 AGCGTGTGTTTGTCTGGGATTTGGATGAAACCATCATTGTTTTTCACTCACTGCTCACCGGGTCTTATGCACAG 1110
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 629 AGCGTGTGTTTGTCTGGGACTTGGATGAAACCATCATCGTCTTCCACTCTCTCCTCACGGGCTCTTATGCACAG 702
Query 1111 AAGTATGGCAAGGATCCCCCCATGGCTGTAACCCTTGGACTCCGCATGGAAGAAATGATTTTTAATCTTGCTGA 1184
||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 703 AAGTATGGCAAGGATCCCCCAATGGCTGTGACTCTCGGGCTCCGGATGGAAGAAATGATCTTTAATCTTGCAGA 776
Query 1185 TACTCATTTGTTTTTTAATGATTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCTGATGATAATG 1258
|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 777 TACACATTTGTTTTTTAATGACTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCCGACGACAATG 850
Query 1259 GGCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCAAACCTTTGTTTG 1332
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 851 GTCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCGAACCTTTGTTTG 924
Query 1333 CCAACAGGTGTAAGAGGAGGGGTTGACTGGATGAGGAAGTTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAAGAATTATA 1406
|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 925 CCAACAGGTGTGAGAGGAGGAGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAGGAATTATA 998
Query 1407 TAACACCTACAAGAACAACGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCCAAGAGGGATGCCTGGCTACAGTTAAGGGCAG 1480
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 999 TAACACCTACAAGAACAATGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCTAAGAGGGATGCATGGCTGCAGTTAAGGGCAG 1072
Query 1481 AGATTGAAGGTCTGACAGATTCCTGGCTAACAAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGCACTAGGAGTAAC 1554
||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1073 AGATCGAAGGCCTAACAGATTCCTGGCTAACGAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGTACTAGGAGTAAC 1146
Query 1555 TGCATAAATGTCTTGGTAACGACAACTCAACTGATCCCAGCACTTGCGAAGGTTCTACTCTATAGTTTAGGAGG 1628
||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||..|||||||
Sbjct 1147 TGTGTAAATGTCTTGGTAACGACAACCCAGCTGATTCCTGCTCTTGCAAAAGTCCTGCTCTACAGCCTAGGAGG 1220
Query 1629 TGCTTTCCCCATTGAGAATATTTACAGTGCAACTAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAACGAATAATGCAAA 1702
||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||.||...|
Sbjct 1221 TGCTTTCCCCATTGAGAACATTTACAGCGCAACGAAAATAGGCAAGGAAAGCTGTTTTGAGCGTATAGTGTCCA 1294
Query 1703 GGTTTGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAACAGGCAGCAAAAAAGCACAAC 1776
|.|||||||..||..||...||||||||.|||||.|||||....||.||.||.||.||.||.||..||||||||
Sbjct 1295 GATTTGGCACTAACATAACTTATGTTGTGATTGGAGATGGCCGGGATGAGGAGCACGCTGCTAACCAGCACAAC 1368
Query 1777 ATGCCCTTCTGGAGGATATCCAGTCACTCAGACCTCCTGGCTCTCCACCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG 1848
||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 ATGCCCTTTTGGAGGATATCAAGCCACTCGGACCTCTTGGCTCTACATCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG 1440
