Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06177
• Subject: XM_011243115.1
• Aligned Length: 1849
• Identities: 1570
• Gaps: 89

Alignment

Query    1  ATGGAAGACTCCCAGGATTTAAATGAACAATCAGTAAAGAAAACGTGCACAGAATCAGATGTTTCACAATCTCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAGGACCTAGCAAGTCCTCATACTCTT-GTTGGAGGTGGTGATACTCCAGGT  147
                         |||||||||||.||||||||||||||.|||.| ||| ||||||||..|||||||.||.||.
Sbjct    1  -------------ATGGAAATGCAAGACCTAGCAAGTCCCCATGC-CTTGGTTGGAGGCAGTGATACACCTGGG  60

Query  148  AGCTCCAAACTGGAAAAATCTAATCTCAGCAGCACATCAGTTACTACAAATGGGACAGGAGTGTCTCTTCTTGC  221
            ||||||||.|||||.||||||..||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   61  AGCTCCAAGCTGGATAAATCTGGTCTCAGCAGCACTTCAGTCACAACAAATGGGACAGGAGTGTCTCTTCTTGC  134

Query  222  AGTCAAAACAGAGCCCTTGAACAGCAGTGAAACCACAGCCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTG  295
            |||||||||||||||||||.||||||||||..||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  135  AGTCAAAACAGAGCCCTTGCACAGCAGTGAGTCCACTACCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTG  208

Query  296  GGTCAGTAATTACAAGTAGTGGCTACAGCCCCAGATCAGCACATCAGTATTCCCCACAGCTGTATCCTTCCAAG  369
            ||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  209  GGTCAGTAATAACAAGCAGCGGCTACAGCCCCAGGTCGGCGCAGCAGTACTCTCCACAGCTGTACCCCTCCAAG  282

Query  370  CCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCTGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTATTCGGG  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  283  CCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCGGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTACTCTGG  356

Query  444  GATGCAGCAGCCAGCCGTCTACACAGCCTACTCACAGACAGGACAGCCCTACAGCTTGCCCACTTACGATTTGG  517
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||..|.||||||.|.|
Sbjct  357  GATGCAGCAGCCGGCCGTCTACACAGCCTACTCGCAGACAGGACAGCCCTACAGCCTGCCTGCCTACGATCTTG  430

Query  518  GTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACAGAGAGTGGACTTTCCCAAACTCAGTCCCCATTACAGAGTGGCTGCCTC  591
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  431  GTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACGGAAAGTGGGCTTTCCCAAACTCAGTCCCCGTTACAGAGTGGCTGCCTG  504

Query  592  AGTTACAGCCCAGGGTTCTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACACCTTATTCTTACCAAATGCCAGGTTCTAGTTT  665
            ||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  505  AGCTACAGCCCTGGGTTTTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACGCCTTACTCTTACCAAATGCCAGGTTCCAGCTT  578

Query  666  TGCACCATCATCTACTATTTATGCAAATAATTCAGTTTCCAATTCAACAAATTTCAGTGGTTCACAACAGGATT  739
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.|||||||
Sbjct  579  TGCACCATCGTCTACTATTTATGCAAATAATTCCGTTTCTAATTCAACAAACTTCAGCAGCTCACAGCAGGATT  652

Query  740  ATCCATCCTATACAGCCTTTGGCCAAAACCAGTATGCACAGTATTATTCAGCATCAACGTATGGAGCGTATATG  813
            |.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  653  ACCCATCCTACACAGCCTTTGGCCAAAACCAATATGCTCAGTATTACTCAGCATCAACCTATGGGGCATACATG  726

Query  814  ACATCGAATAACACAGCCGATGGCACACCCTCTTCAACCTCTACTTATCAGTTGCAGGAATCTCTCCCAGGACT  887
            |||||.||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct  727  ACATCAAACAACACAGCTGACGGCACATCATCGTCAACATCAACTTATCAGCTGCAGGAATCTCTCCAAGGACT  800

Query  888  GACTAACCAACCAGGAGAGTTCGATACCATGCAGAGTCCCTCCACACCCATCAAAGATCTTGATGAGAGAACCT  961
            |||||.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  801  GACTAGCCAACCAGGAGAGTTTGATACAGTGCAGAGTCCCTCCACACCAATCAAAGATCTCGATGACAGAACAT  874

Query  962  GTAGGAGTTCTGGGTCAAAGTCCAGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCGCCTCCTGATAGTGACCTG  1035
            ||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct  875  GTAGAAGTTCTGGGTCAAAGTCTCGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCACCTCCGGACAGTGACCTA  948

Query 1036  GAGCGTGTGTTTGTCTGGGATTTGGATGAAACCATCATTGTTTTTCACTCACTGCTCACCGGGTCTTATGCACA  1109
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  949  GAGCGTGTGTTTGTCTGGGACTTGGATGAAACCATCATCGTCTTCCACTCTCTCCTCACGGGCTCTTATGCACA  1022

Query 1110  GAAGTATGGCAAGGATCCCCCCATGGCTGTAACCCTTGGACTCCGCATGGAAGAAATGATTTTTAATCTTGCTG  1183
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1023  GAAGTATGGCAAGGATCCCCCAATGGCTGTGACTCTCGGGCTCCGGATGGAAGAAATGATCTTTAATCTTGCAG  1096

Query 1184  ATACTCATTTGTTTTTTAATGATTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCTGATGATAAT  1257
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1097  ATACACATTTGTTTTTTAATGACTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCCGACGACAAT  1170

Query 1258  GGGCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCAAACCTTTGTTT  1331
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1171  GGTCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCGAACCTTTGTTT  1244

Query 1332  GCCAACAGGTGTAAGAGGAGGGGTTGACTGGATGAGGAAGTTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAAGAATTAT  1405
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1245  GCCAACAGGTGTGAGAGGAGGAGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAGGAATTAT  1318

Query 1406  ATAACACCTACAAGAACAACGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCCAAGAGGGATGCCTGGCTACAGTTAAGGGCA  1479
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1319  ATAACACCTACAAGAACAATGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCTAAGAGGGATGCATGGCTGCAGTTAAGGGCA  1392

Query 1480  GAGATTGAAGGTCTGACAGATTCCTGGCTAACAAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGCACTAGGAGTAA  1553
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1393  GAGATCGAAGGCCTAACAGATTCCTGGCTAACGAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGTACTAGGAGTAA  1466

Query 1554  CTGCATAAATGTCTTGGTAACGACAACTCAACTGATCCCAGCACTTGCGAAGGTTCTACTCTATAGTTTAGGAG  1627
            |||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||..||||||
Sbjct 1467  CTGTGTAAATGTCTTGGTAACGACAACCCAGCTGATTCCTGCTCTTGCAAAAGTCCTGCTCTACAGCCTAGGAG  1540

Query 1628  GTGCTTTCCCCATTGAGAATATTTACAGTGCAACTAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAACGAATAATGCAA  1701
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||.||...
Sbjct 1541  GTGCTTTCCCCATTGAGAACATTTACAGCGCAACGAAAATAGGCAAGGAAAGCTGTTTTGAGCGTATAGTGTCC  1614

Query 1702  AGGTTTGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAACAGGCAGCAAAAAAGCACAA  1775
            ||.|||||||..||..||...||||||||.|||||.|||||....||.||.||.||.||.||.||..|||||||
Sbjct 1615  AGATTTGGCACTAACATAACTTATGTTGTGATTGGAGATGGCCGGGATGAGGAGCACGCTGCTAACCAGCACAA  1688

Query 1776  CATGCCCTTCTGGAGGATATCCAGTCACTCAGACCTCCTGGCTCTCCACCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG  1848
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1689  CATGCCCTTTTGGAGGATATCAAGCCACTCGGACCTCTTGGCTCTACATCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG  1761