Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06177
• Subject: XM_017313798.1
• Aligned Length: 1855
• Identities: 1615
• Gaps: 38

Alignment

Query    1  ATGGAAGACTCCCAGGATTTA-AATG--AACA--ATCAGTAAAGAAAACGTGCACAGAATCAGATGTTTCACAA  69
            || |||||        |.||| ||||  |.||  .||.|.|||            |||||..||        ||
Sbjct    1  AT-GAAGA--------AGTTACAATGTCATCATGTTCTGGAAA------------AGAATTGGA--------AA  45

Query   70  TCTCAGAATT-CCAGGTCTATGGAAATGCAGGACCTAGCAAGTCCTCATACTCTT-GTTGGAGGTGGTGATACT  141
            | |...|||| ..|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.| ||| ||||||||..|||||||.
Sbjct   46  T-TATTAATTGGAAGGTCTATGGAAATGCAAGACCTAGCAAGTCCCCATGC-CTTGGTTGGAGGCAGTGATACA  117

Query  142  CCAGGTAGCTCCAAACTGGAAAAATCTAATCTCAGCAGCACATCAGTTACTACAAATGGGACAGGAGTGTCTCT  215
            ||.||.||||||||.|||||.||||||..||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  CCTGGGAGCTCCAAGCTGGATAAATCTGGTCTCAGCAGCACTTCAGTCACAACAAATGGGACAGGAGTGTCTCT  191

Query  216  TCTTGCAGTCAAAACAGAGCCCTTGAACAGCAGTGAAACCACAGCCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTT  289
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||..||||..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  TCTTGCAGTCAAAACAGAGCCCTTGCACAGCAGTGAGTCCACTACCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTT  265

Query  290  TTACTGGGTCAGTAATTACAAGTAGTGGCTACAGCCCCAGATCAGCACATCAGTATTCCCCACAGCTGTATCCT  363
            ||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  266  TTACTGGGTCAGTAATAACAAGCAGCGGCTACAGCCCCAGGTCGGCGCAGCAGTACTCTCCACAGCTGTACCCC  339

Query  364  TCCAAGCCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCTGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTA  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  TCCAAGCCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCGGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTA  413

Query  438  TTCGGGGATGCAGCAGCCAGCCGTCTACACAGCCTACTCACAGACAGGACAGCCCTACAGCTTGCCCACTTACG  511
            .||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||..|.||||
Sbjct  414  CTCTGGGATGCAGCAGCCGGCCGTCTACACAGCCTACTCGCAGACAGGACAGCCCTACAGCCTGCCTGCCTACG  487

Query  512  ATTTGGGTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACAGAGAGTGGACTTTCCCAAACTCAGTCCCCATTACAGAGTGGC  585
            ||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  488  ATCTTGGTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACGGAAAGTGGGCTTTCCCAAACTCAGTCCCCGTTACAGAGTGGC  561

Query  586  TGCCTCAGTTACAGCCCAGGGTTCTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACACCTTATTCTTACCAAATGCCAGGTTC  659
            |||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  562  TGCCTGAGCTACAGCCCTGGGTTTTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACGCCTTACTCTTACCAAATGCCAGGTTC  635

Query  660  TAGTTTTGCACCATCATCTACTATTTATGCAAATAATTCAGTTTCCAATTCAACAAATTTCAGTGGTTCACAAC  733
            .||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.|
Sbjct  636  CAGCTTTGCACCATCGTCTACTATTTATGCAAATAATTCCGTTTCTAATTCAACAAACTTCAGCAGCTCACAGC  709

Query  734  AGGATTATCCATCCTATACAGCCTTTGGCCAAAACCAGTATGCACAGTATTATTCAGCATCAACGTATGGAGCG  807
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct  710  AGGATTACCCATCCTACACAGCCTTTGGCCAAAACCAATATGCTCAGTATTACTCAGCATCAACCTATGGGGCA  783

Query  808  TATATGACATCGAATAACACAGCCGATGGCACACCCTCTTCAACCTCTACTTATCAGTTGCAGGAATCTCTCCC  881
            ||.||||||||.||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||.
Sbjct  784  TACATGACATCAAACAACACAGCTGACGGCACATCATCGTCAACATCAACTTATCAGCTGCAGGAATCTCTCCA  857

Query  882  AGGACTGACTAACCAACCAGGAGAGTTCGATACCATGCAGAGTCCCTCCACACCCATCAAAGATCTTGATGAGA  955
            |||||||||||.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  858  AGGACTGACTAGCCAACCAGGAGAGTTTGATACAGTGCAGAGTCCCTCCACACCAATCAAAGATCTCGATGACA  931

Query  956  GAACCTGTAGGAGTTCTGGGTCAAAGTCCAGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCGCCTCCTGATAGT  1029
            ||||.|||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct  932  GAACATGTAGAAGTTCTGGGTCAAAGTCTCGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCACCTCCGGACAGT  1005

Query 1030  GACCTGGAGCGTGTGTTTGTCTGGGATTTGGATGAAACCATCATTGTTTTTCACTCACTGCTCACCGGGTCTTA  1103
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1006  GACCTAGAGCGTGTGTTTGTCTGGGACTTGGATGAAACCATCATCGTCTTCCACTCTCTCCTCACGGGCTCTTA  1079

Query 1104  TGCACAGAAGTATGGCAAGGATCCCCCCATGGCTGTAACCCTTGGACTCCGCATGGAAGAAATGATTTTTAATC  1177
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1080  TGCACAGAAGTATGGCAAGGATCCCCCAATGGCTGTGACTCTCGGGCTCCGGATGGAAGAAATGATCTTTAATC  1153

Query 1178  TTGCTGATACTCATTTGTTTTTTAATGATTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCTGAT  1251
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1154  TTGCAGATACACATTTGTTTTTTAATGACTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCCGAC  1227

Query 1252  GATAATGGGCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCAAACCT  1325
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1228  GACAATGGTCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCGAACCT  1301

Query 1326  TTGTTTGCCAACAGGTGTAAGAGGAGGGGTTGACTGGATGAGGAAGTTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAAG  1399
            ||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1302  TTGTTTGCCAACAGGTGTGAGAGGAGGAGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAGG  1375

Query 1400  AATTATATAACACCTACAAGAACAACGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCCAAGAGGGATGCCTGGCTACAGTTA  1473
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1376  AATTATATAACACCTACAAGAACAATGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCTAAGAGGGATGCATGGCTGCAGTTA  1449

Query 1474  AGGGCAGAGATTGAAGGTCTGACAGATTCCTGGCTAACAAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGCACTAG  1547
            |||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1450  AGGGCAGAGATCGAAGGCCTAACAGATTCCTGGCTAACGAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGTACTAG  1523

Query 1548  GAGTAACTGCATAAATGTCTTGGTAACGACAACTCAACTGATCCCAGCACTTGCGAAGGTTCTACTCTATAGTT  1621
            |||||||||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||..
Sbjct 1524  GAGTAACTGTGTAAATGTCTTGGTAACGACAACCCAGCTGATTCCTGCTCTTGCAAAAGTCCTGCTCTACAGCC  1597

Query 1622  TAGGAGGTGCTTTCCCCATTGAGAATATTTACAGTGCAACTAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAACGAATA  1695
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1598  TAGGAGGTGCTTTCCCCATTGAGAACATTTACAGCGCAACGAAAATAGGCAAGGAAAGCTGTTTTGAGCGTATA  1671

Query 1696  ATGCAAAGGTTTGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAACAGGCAGCAAAAAA  1769
            .||...||.|||||||..||..||...||||||||.|||||.|||||....||.||.||.||.||.||.||..|
Sbjct 1672  GTGTCCAGATTTGGCACTAACATAACTTATGTTGTGATTGGAGATGGCCGGGATGAGGAGCACGCTGCTAACCA  1745

Query 1770  GCACAACATGCCCTTCTGGAGGATATCCAGTCACTCAGACCTCCTGGCTCTCCACCAAGCACTGGAATTAGAGT  1843
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1746  GCACAACATGCCCTTTTGGAGGATATCAAGCCACTCGGACCTCTTGGCTCTACATCAAGCACTGGAATTAGAGT  1819

Query 1844  ATTTG  1848
            |||||
Sbjct 1820  ATTTG  1824