Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06235
• Subject: NM_000402.4
• Aligned Length: 1635
• Identities: 1545
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCCGGCGGGGCTCAGCCCCCGGAAACGGTCGTACACTTCGGGGCTGCGAGCGCGGAGGGCGACGACGACG  74

Query    1  ----------------ATGGCAGAGCAGGTGGCCCTGAGCCGGACCCAGGTGTGCGGGATCCTGCGGGAAGAGC  58
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGCGCAGACAGCGTCATGGCAGAGCAGGTGGCCCTGAGCCGGACCCAGGTGTGCGGGATCCTGCGGGAAGAGC  148

Query   59  TTTTCCAGGGCGATGCCTTCCATCAGTCGGATACACACATATTCATCATCATGGGTGCATCGGGTGACCTGGCC  132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTTCCAGGGCGATGCCTTCCATCAGTCGGATACACACATATTCATCATCATGGGTGCATCGGGTGACCTGGCC  222

Query  133  AAGAAGAAGATCTACCCCACCATCTGGTGGCTGTTCCGGGATGGCCTTCTGCCCGAAAACACCTTCATCGTGGG  206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGAAGAAGATCTACCCCACCATCTGGTGGCTGTTCCGGGATGGCCTTCTGCCCGAAAACACCTTCATCGTGGG  296

Query  207  CTATGCCCGTTCCCGCCTCACAGTGGCTGACATCCGCAAACAGAGTGAGCCCTTCTTCAAGGCCACCCCAGAGG  280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGCCCGTTCCCGCCTCACAGTGGCTGACATCCGCAAACAGAGTGAGCCCTTCTTCAAGGCCACCCCAGAGG  370

Query  281  AGAAGCTCAAGCTGGAGGACTTCTTTGCCCGCAACTCCTATGTGGCTGGCCAGTACGATGATGCAGCCTCCTAC  354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAGCTCAAGCTGGAGGACTTCTTTGCCCGCAACTCCTATGTGGCTGGCCAGTACGATGATGCAGCCTCCTAC  444

Query  355  CAGCGCCTCAACAGCCACATGAATGCCCTCCACCTGGGGTCACAGGCCAACCGCCTCTTCTACCTGGCCTTGCC  428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCGCCTCAACAGCCACATGAATGCCCTCCACCTGGGGTCACAGGCCAACCGCCTCTTCTACCTGGCCTTGCC  518

Query  429  CCCGACCGTCTACGAGGCCGTCACCAAGAACATTCACGAGTCCTGCATGAGCCAGATAGGCTGGAACCGCATCA  502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCGACCGTCTACGAGGCCGTCACCAAGAACATTCACGAGTCCTGCATGAGCCAGATAGGCTGGAACCGCATCA  592

Query  503  TCGTGGAGAAGCCCTTCGGGAGGGACCTGCAGAGCTCTGACCGGCTGTCCAACCACATCTCCTCCCTGTTCCGT  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCGTGGAGAAGCCCTTCGGGAGGGACCTGCAGAGCTCTGACCGGCTGTCCAACCACATCTCCTCCCTGTTCCGT  666

Query  577  GAGGACCAGATCTACCGCATCGACCACTACCTGGGCAAGGAGATGGTGCAGAACCTCATGGTGCTGAGATTTGC  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGACCAGATCTACCGCATCGACCACTACCTGGGCAAGGAGATGGTGCAGAACCTCATGGTGCTGAGATTTGC  740

Query  651  CAACAGGATCTTCGGCCCCATCTGGAACCGGGACAACATCGCCTGCGTTATCCTCACCTTCAAGGAGCCCTTTG  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACAGGATCTTCGGCCCCATCTGGAACCGGGACAACATCGCCTGCGTTATCCTCACCTTCAAGGAGCCCTTTG  814

Query  725  GCACTGAGGGTCGCGGGGGCTATTTCGATGAATTTGGGATCATCCGGGACGTGATGCAGAACCACCTACTGCAG  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCACTGAGGGTCGCGGGGGCTATTTCGATGAATTTGGGATCATCCGGGACGTGATGCAGAACCACCTACTGCAG  888

Query  799  ATGCTGTGTCTGGTGGCCATGGAGAAGCCCGCCTCCACCAACTCAGATGACGTCCGTGATGAGAAGGTCAAGGT  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGCTGTGTCTGGTGGCCATGGAGAAGCCCGCCTCCACCAACTCAGATGACGTCCGTGATGAGAAGGTCAAGGT  962

Query  873  GTTGAAATGCATCTCAGAGGTGCAGGCCAACAATGTGGTCCTGGGCCAGTACGTGGGGAACCCCGATGGAGAGG  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTGAAATGCATCTCAGAGGTGCAGGCCAACAATGTGGTCCTGGGCCAGTACGTGGGGAACCCCGATGGAGAGG  1036

Query  947  GCGAGGCCACCAAAGGGTACCTGGACGACCCCACGGTGCCCCGCGGGTCCACCACCGCCACTTTTGCAGCCGTC  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCGAGGCCACCAAAGGGTACCTGGACGACCCCACGGTGCCCCGCGGGTCCACCACCGCCACTTTTGCAGCCGTC  1110

Query 1021  GTCCTCTATGTGGAGAATGAGAGGTGGGATGGGGTGCCCTTCATCCTGCGCTGCGGCAAGGCCCTGAACGAGCG  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCCTCTATGTGGAGAATGAGAGGTGGGATGGGGTGCCCTTCATCCTGCGCTGCGGCAAGGCCCTGAACGAGCG  1184

Query 1095  CAAGGCCGAGGTGAGGCTGCAGTTCCATGATGTGGCCGGCGACATCTTCCACCAGCAGTGCAAGCGCAACGAGC  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAGGCCGAGGTGAGGCTGCAGTTCCATGATGTGGCCGGCGACATCTTCCACCAGCAGTGCAAGCGCAACGAGC  1258

Query 1169  TGGTGATCCGCGTGCAGCCCAACGAGGCCGTGTACACCAAGATGATGACCAAGAAGCCGGGCATGTTCTTCAAC  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGTGATCCGCGTGCAGCCCAACGAGGCCGTGTACACCAAGATGATGACCAAGAAGCCGGGCATGTTCTTCAAC  1332

Query 1243  CCCGAGGAGTCGGAGCTGGACCTGACCTACGGCAACAGATACAAGAACGTGAAGCTCCCTGACGCCTATGAGCG  1316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCGAGGAGTCGGAGCTGGACCTGACCTACGGCAACAGATACAAGAACGTGAAGCTCCCTGACGCCTATGAGCG  1406

Query 1317  CCTCATCCTGGACGTCTTCTGCGGGAGCCAGATGCACTTCGTGCGCAGCGACGAGCTCCGTGAGGCCTGGCGTA  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTCATCCTGGACGTCTTCTGCGGGAGCCAGATGCACTTCGTGCGCAGCGACGAGCTCCGTGAGGCCTGGCGTA  1480

Query 1391  TTTTCACCCCACTGCTGCACCAGATTGAGCTGGAGAAGCCCAAGCCCATCCCCTATATTTATGGCAGCCGAGGC  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTTTCACCCCACTGCTGCACCAGATTGAGCTGGAGAAGCCCAAGCCCATCCCCTATATTTATGGCAGCCGAGGC  1554

Query 1465  CCCACGGAGGCAGACGAGCTGATGAAGAGAGTGGGTTTCCAGTATGAGGGCACCTACAAGTGGGTGAACCCCCA  1538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCACGGAGGCAGACGAGCTGATGAAGAGAGTGGGTTTCCAGTATGAGGGCACCTACAAGTGGGTGAACCCCCA  1628

Query 1539  CAAGCTC  1545
            |||||||
Sbjct 1629  CAAGCTC  1635