Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06270
• Subject: NM_001348096.1
• Aligned Length: 1380
• Identities: 1378
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTCCTGGCGACCCTGTACTTCGCGCTGCCGCTCTTGGACTTGCTCCTGTCGGCCGAAGTGAGCGGCGGAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTCCTGGCGACCCTGTACTTCGCGCTGCCGCTCTTGGACTTGCTCCTGTCGGCCGAAGTGAGCGGCGGAGA  74

Query   75  CCGCCTGGATTGCGTGAAAGCCAGTGATCAGTGCCTGAAGGAGCAGAGCTGCAGCACCAAGTACCGCACGCTAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCCTGGATTGCGTGAAAGCCAGTGATCAGTGCCTGAAGGAGCAGAGCTGCAGCACCAAGTACCGCACGCTAA  148

Query  149  GGCAGTGCGTGGCGGGCAAGGAGACCAACTTCAGCCTGGCATCCGGCCTGGAGGCCAAGGATGAGTGCCGCAGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCAGTGCGTGGCGGGCAAGGAGACCAACTTCAGCCTGGCATCCGGCCTGGAGGCCAAGGATGAGTGCCGCAGC  222

Query  223  GCCATGGAGGCCCTGAAGCAGAAGTCGCTCTACAACTGCCGCTGCAAGCGGGGTATGAAGAAGGAGAAGAACTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCATGGAGGCCCTGAAGCAGAAGTCGCTCTACAACTGCCGCTGCAAGCGGGGTATGAAGAAGGAGAAGAACTG  296

Query  297  CCTGCGCATTTACTGGAGCATGTACCAGAGCCTGCAGGGAAATGATCTGCTGGAGGATTCCCCATATGAACCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGCGCATTTACTGGAGCATGTACCAGAGCCTGCAGGGAAATGATCTGCTGGAGGATTCCCCATATGAACCAG  370

Query  371  TTAACAGCAGATTGTCAGATATATTCCGGGTGGTCCCATTCATATCAGTGGAGCACATTCCCAAAGGGAACAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTAACAGCAGATTGTCAGATATATTCCGGGTGGTCCCATTCATATCAGTGGAGCACATTCCCAAAGGGAACAAC  444

Query  445  TGCCTGGATGCAGCGAAGGCCTGCAACCTCGACGACATTTGCAAGAAGTACAGGTCGGCGTACATCACCCCGTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCCTGGATGCAGCGAAGGCCTGCAACCTCGACGACATTTGCAAGAAGTACAGGTCGGCGTACATCACCCCGTG  518

Query  519  CACCACCAGCGTGTCCAATGATGTCTGCAACCGCCGCAAGTGCCACAAGGCCCTCCGGCAGTTCTTTGACAAGG  592
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACCACCAGCGTGTCCAACGATGTCTGCAACCGCCGCAAGTGCCACAAGGCCCTCCGGCAGTTCTTTGACAAGG  592

Query  593  TCCCGGCCAAGCACAGCTACGGAATGCTCTTCTGCTCCTGCCGGGACATCGCCTGCACAGAGCGGAGGCGACAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCCGGCCAAGCACAGCTACGGAATGCTCTTCTGCTCCTGCCGGGACATCGCCTGCACAGAGCGGAGGCGACAG  666

Query  667  ACCATCGTGCCTGTGTGCTCCTATGAAGAGAGGGAGAAGCCCAACTGTTTGAATTTGCAGGACTCCTGCAAGAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCATCGTGCCTGTGTGCTCCTATGAAGAGAGGGAGAAGCCCAACTGTTTGAATTTGCAGGACTCCTGCAAGAC  740

Query  741  GAATTACATCTGCAGATCTCGCCTTGCGGATTTTTTTACCAACTGCCAGCCAGAGTCAAGGTCTGTCAGCAGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAATTACATCTGCAGATCTCGCCTTGCGGATTTTTTTACCAACTGCCAGCCAGAGTCAAGGTCTGTCAGCAGCT  814

Query  815  GTCTAAAGGAAAACTACGCTGACTGCCTCCTCGCCTACTCGGGGCTTATTGGCACAGTCATGACCCCCAACTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTCTAAAGGAAAACTACGCTGACTGCCTCCTCGCCTACTCGGGGCTTATTGGCACAGTCATGACCCCCAACTAC  888

Query  889  ATAGACTCCAGTAGCCTCAGTGTGGCCCCATGGTGTGACTGCAGCAACAGTGGGAACGACCTAGAAGAGTGCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATAGACTCCAGTAGCCTCAGTGTGGCCCCATGGTGTGACTGCAGCAACAGTGGGAACGACCTAGAAGAGTGCTT  962

Query  963  GAAATTTTTGAATTTCTTCAAGGACAATACATGTCTTAAAAATGCAATTCAAGCCTTTGGCAATGGCTCCGATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAATTTTTGAATTTCTTCAAGGACAATACATGTCTTAAAAATGCAATTCAAGCCTTTGGCAATGGCTCCGATG  1036

Query 1037  TGACCGTGTGGCAGCCAGCCTTCCCAGTACAGACCACCACTGCCACTACCACCACTGCCCTCCGGGTTAAGAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGACCGTGTGGCAGCCAGCCTTCCCAGTACAGACCACCACTGCCACTACCACCACTGCCCTCCGGGTTAAGAAC  1110

Query 1111  AAGCCCCTGGGGCCAGCAGGGTCTGAGAATGAAATTCCCACTCATGTTTTGCCACCGTGTGCAAATTTACAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGCCCCTGGGGCCAGCAGGGTCTGAGAATGAAATTCCCACTCATGTTTTGCCACCGTGTGCAAATTTACAGGC  1184

Query 1185  ACAGAAGCTGAAATCCAATGTGTCGGGCAATACACACCTCTGTATTTCCAATGGTAATTATGAAAAAGAAGGTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACAGAAGCTGAAATCCAATGTGTCGGGCAATACACACCTCTGTATTTCCAATGGTAATTATGAAAAAGAAGGTC  1258

Query 1259  TCGGTGCTTCCAGCCACATAACCACAAAATCAATGGCTGCTCCTCCAAGCTGTGGTCTGAGCCCACTGCTGGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCGGTGCTTCCAGCCACATAACCACAAAATCAATGGCTGCTCCTCCAAGCTGTGGTCTGAGCCCACTGCTGGTC  1332

Query 1333  CTGGTGGTAACCGCTCTGTCCACCCTATTATNTTTAACAGAAACATCA  1380
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGTGGTAACCGCTCTGTCCACCCTATTATCTTTAACAGAAACATCA  1380