Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06285
• Subject: NM_001318900.1
• Aligned Length: 1674
• Identities: 1258
• Gaps: 399

Alignment

Query    1  ATGTACCGCTACCTGGGCGAAGCGCTGTTGCTGTCCCGGGCCGGGCCCGCTGCCCTGGGCTCGGCGTCCGCCGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTCGGCCGCGTTGCTGGGCTGGGCCCGGGGACAGCCCGCCGCCGCCCCGCAGCCGGGGCTGGCATTGGCCGCCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCGCCACTACAGCGAGGCGGTGGCCGACCGCGAGGACGACCCCAACTTCTTCAAGATGGTGGAGGGCTTCTTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GATCGCGGCGCCAGCATCGTGGAGGACAAGCTGGTGGAGGACCTGAGGACCCGGGAGAGCGAGGAGCAGAAGCG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAACCGGGTGCGCGGCATCCTGCGGATCATCAAGCCCTGCAACCATGTGCTGAGTCTCTCCTTCCCCATCCGGC  370
                                           |.|.|||||  ||.||||.|.|        |.||.|.||    
Sbjct    1  -------------------------------ATGACCTGC--CCGTGTGATAA--------TGCCTCGTC----  29

Query  371  GCGACGACGGCTCCTGGGAGGTCATCGAAGGCTACCGGGCCCAGCACAGCCAGCACCGCACGCCCTGCAAGGGA  444
                  |..|.||.||||...|                                                    
Sbjct   30  ------AGTGTTCTTGGGCTTT----------------------------------------------------  45

Query  445  GGTATCCGTTACAGCACTGATGTGAGTGTAGATGAAGTAAAAGCTTTGGCTTCTCTGATGACATACAAGTGTGC  518
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   46  TGTATCCGTTACAGCACTGATGTGAGTGTAGATGAAGTAAAAGCTTTGGCTTCTCTGATGACATACAAGTGTGC  119

Query  519  AGTGGTTGATGTGCCGTTTGGGGGTGCTAAAGCTGGTGTTAAGATCAATCCCAAGAACTATACTGATAATGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120  AGTGGTTGATGTGCCGTTTGGGGGTGCTAAAGCTGGTGTTAAGATCAATCCCAAGAACTATACTGATAATGAAT  193

Query  593  TGGAAAAGATCACAAGGAGGTTCACCATGGAGCTAGCAAAAAAGGGCTTTATTGGTCCTGGCATTGATGTGCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  194  TGGAAAAGATCACAAGGAGGTTCACCATGGAGCTAGCAAAAAAGGGCTTTATTGGTCCTGGCATTGATGTGCCT  267

Query  667  GCTCCAGACATGAGCACAGGTGAGCGGGAGATGTCCTGGATCGCTGATACCTATGCCAGCACCATAGGGCACTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  268  GCTCCAGACATGAGCACAGGTGAGCGGGAGATGTCCTGGATCGCTGATACCTATGCCAGCACCATAGGGCACTA  341

Query  741  TGATATTAATGCACACGCCTGTGTTACTGGTAAACCCATCAGCCAAGGGGGAATCCATGGACGCATCTCTGCTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  342  TGATATTAATGCACACGCCTGTGTTACTGGTAAACCCATCAGCCAAGGGGGAATCCATGGACGCATCTCTGCTA  415

Query  815  CTGGCCGTGGTGTCTTCCATGGGATTGAAAATTTCATCAATGAAGCTTCTTACATGAGCATTTTAGGAATGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  CTGGCCGTGGTGTCTTCCATGGGATTGAAAATTTCATCAATGAAGCTTCTTACATGAGCATTTTAGGAATGACA  489

Query  889  CCAGGGTTTGGAGATAAAACATTTGTTGTTCAGGGATTTGGTAATGTGGGCCTACACTCTATGAGATATTTACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490  CCAGGGTTTGGAGATAAAACATTTGTTGTTCAGGGATTTGGTAATGTGGGCCTACACTCTATGAGATATTTACA  563

Query  963  TCGTTTTGGTGCTAAATGTATTGCTGTTGGTGAGTCTGATGGGAGTATATGGAATCCAGATGGTATTGACCCAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564  TCGTTTTGGTGCTAAATGTATTGCTGTTGGTGAGTCTGATGGGAGTATATGGAATCCAGATGGTATTGACCCAA  637

Query 1037  AGGAACTGGAAGACTTCAAATTGCAACATGGGTCCATTCTGGGCTTCCCCAAGGCAAAGCCCTATGAAGGAAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  638  AGGAACTGGAAGACTTCAAATTGCAACATGGGTCCATTCTGGGCTTCCCCAAGGCAAAGCCCTATGAAGGAAGC  711

Query 1111  ATCTTGGAGGCCGACTGTGACATACTGATCCCAGCTGCCAGTGAGAAGCAGTTGACCAAATCCAACGCACCCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  712  ATCTTGGAGGCCGACTGTGACATACTGATCCCAGCTGCCAGTGAGAAGCAGTTGACCAAATCCAACGCACCCAG  785

Query 1185  AGTCAAAGCCAAGATCATTGCTGAAGGTGCCAATGGGCCAACAACTCCAGAAGCTGACAAGATCTTCCTGGAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  AGTCAAAGCCAAGATCATTGCTGAAGGTGCCAATGGGCCAACAACTCCAGAAGCTGACAAGATCTTCCTGGAGA  859

Query 1259  GAAACATTATGGTTATTCCAGATCTCTACTTGAATGCTGGAGGAGTGACAGTATCTTACTTTGAGTGGCTGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  860  GAAACATTATGGTTATTCCAGATCTCTACTTGAATGCTGGAGGAGTGACAGTATCTTACTTTGAGTGGCTGAAG  933

Query 1333  AATCTAAATCATGTCAGCTATGGCCGTTTGACCTTCAAATATGAAAGGGATTCTAACTACCACTTGCTCATGTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  934  AATCTAAATCATGTCAGCTATGGCCGTTTGACCTTCAAATATGAAAGGGATTCTAACTACCACTTGCTCATGTC  1007

Query 1407  TGTTCAAGAGAGTTTAGAAAGAAAATTTGGAAAGCATGGTGGAACTATTCCCATTGTACCCACGGCAGAGTTCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  TGTTCAAGAGAGTTTAGAAAGAAAATTTGGAAAGCATGGTGGAACTATTCCCATTGTACCCACGGCAGAGTTCC  1081

Query 1481  AAGACAGGATATCGGGTGCATCTGAGAAAGACATCGTGCACTCTGGCTTGGCATACACAATGGAGCGTTCTGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  AAGACAGGATATCGGGTGCATCTGAGAAAGACATCGTGCACTCTGGCTTGGCATACACAATGGAGCGTTCTGCC  1155

Query 1555  AGGCAAATTATGCGCACAGCCATGAAGTATAACCTGGGATTGGACCTGAGAACAGCTGCCTATGTTAATGCCAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156  AGGCAAATTATGCGCACAGCCATGAAGTATAACCTGGGATTGGACCTGAGAACAGCTGCCTATGTTAATGCCAT  1229

Query 1629  TGAGAAAGTCTTCAAAGTGTACAATGAAGCTGGTNTGACCTTCACA  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1230  TGAGAAAGTCTTCAAAGTGTACAATGAAGCTGGTGTGACCTTCACA  1275