Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06292
• Subject: NM_008138.5
• Aligned Length: 1067
• Identities: 978
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGGCTGCACCGTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGCCGAGCGCTCTAAGATGATCGACAAGAACCTGCGGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGCACCGTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCAGCCGAGCGCTCTAAAATGATCGACAAGAACCTGCGGGA  74

Query   75  GGACGGAGAGAAGGCGGCGCGGGAGGTGAAGTTGCTGCTGTTGGGTGCTGTGGAGTCAGGGAAGAGCACCATCG  148
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACGGCGAGAAGGCGGCGCGGGAGGTGAAGTTGCTTCTGTTAGGTGCTGGAGAGTCAGGGAAGAGCACCATCG  148

Query  149  TCAAGCAGATGAAGATCATCCACGAGGATGGCTACTCCGAGGAGGAATGCCGGCAGTACCGGGCGGTTGTCTAC  222
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  149  TCAAGCAGATGAAGATCATCCATGAAGATGGCTACTCAGAAGAGGAGTGCCGGCAGTACCGTGCCGTGGTCTAC  222

Query  223  AGCAACACCATCCAGTCCATCATGGCCATTGTCAAAGCCATGGGCAACCTGCAGATCGACTTTGCCGACCCCTC  296
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||  |
Sbjct  223  AGCAACACCATCCAGTCTATCATGGCCATCGTGAAGGCCATGGGCAACCTGCAGATCGACTTTGCTGATCC--C  294

Query  297  CA--GAGCGGACGACGCCAGGCAGCTATTTGCACTGTCCTGCACCGCCGAGGAGCAAGGCGTGCTCCCTGATGA  368
            ||  |.|||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||..|.||.|||||.|||||..||||.|||||.||
Sbjct  295  CAGCGTGCGGATGATGCCAGGCAGCTGTTCGCCCTGTCCTGTGCTGCAGAGGAACAAGGGATGCTTCCTGAAGA  368

Query  369  CCTGTCCGGCGTCATCCGGAGGCTCTGGGCTGACCATGGTGTGCAGGCCTGCTTTGGCCGCTCAAGGGAATACC  442
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  369  CCTGTCCGGTGTCATCCGGAGGCTCTGGGCTGACCACGGTGTGCAAGCCTGCTTTGGCCGCTCACGAGAATACC  442

Query  443  AGCTCAACGACTCAGCTGCCTACTACCTGAACGACCTGGAGCGTATTGCACAGAGTGACTACATCCCCACACAG  516
            |||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  443  AGCTCAATGACTCAGCCGCTTACTACCTGAATGATCTGGAGCGCATTGCACAGAGTGACTACATCCCTACACAG  516

Query  517  CAAGATGTGCTACGGACCCGCGTAAAGACCACGGGGATCGTGGAGACACACTTCACCTTCAAGGACCTACACTT  590
            ||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  517  CAGGATGTGCTGCGGACCCGTGTGAAGACCACGGGCATCGTGGAAACACACTTCACCTTCAAGGACTTACACTT  590

Query  591  CAAGATGTTTGATGTGGGTGGTCAGCGGTCTGAGCGGAAGAAGTGGATCCACTGCTTTGAGGGCGTCACAGCCA  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  591  CAAGATGTTTGATGTGGGTGGTCAGCGGTCTGAGCGCAAGAAGTGGATCCACTGCTTTGAGGGCGTCACGGCCA  664

Query  665  TCATCTTCTGCGTAGCCTTGAGCGCCTATGACTTGGTGCTAGCTGAGGACGAGGAGATGAACCGCATGCATGAG  738
            ||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  TCATCTTCTGTGTCGCCTTGAGCGCTTATGACTTGGTGCTGGCTGAGGATGAGGAGATGAACCGCATGCATGAG  738

Query  739  AGCATGAAGCTATTCGATAGCATCTGCAACAACAAGTGGTTCACAGACACGTCCATCATCCTCTTCCTCAACAA  812
            |||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  AGCATGAAGCTGTTTGACAGCATCTGCAACAACAAGTGGTTCACAGACACCTCCATCATCCTCTTCCTCAACAA  812

Query  813  GAAGGACCTGTTTGAGGAGAAGATCACACACAGTCCCCTGACCATCTGCTTCCCTGAGTACACAGGGGCCAACA  886
            |||||||||||||||.||.|||||||||||.||..|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  813  GAAGGACCTGTTTGAAGAAAAGATCACACAGAGCTCCCTGACCATCTGTTTCCCTGAGTACACGGGGGCCAACA  886

Query  887  AATATGATGAGGCAGCCAGCTACATCCAGAGTAAGTTTGAGGACCTGAATAAGCGCAAAGACACCAAGGAGATC  960
            |.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  AGTACGACGAGGCAGCCAGCTACATCCAGAGCAAGTTTGAGGATCTAAATAAGCGCAAAGACACCAAGGAGATC  960

Query  961  TACACGCACTTCACGTGCGCCACCGACACCAAGAACGTGCAGTTCGTGTTTGACGCCGTCACCGATGTCATCAT  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  961  TACACGCACTTCACGTGCGCCACCGACACCAAGAACGTGCAGTTTGTGTTCGATGCCGTCACTGACGTCATCAT  1034

Query 1035  CAAGAACAACCTGAAGGACTGCGGCCTCTTC  1065
            |||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1035  CAAGAACAACCTGAAGGACTGTGGCCTCTTC  1065