Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06329
- Subject:
- NM_008177.3
- Aligned Length:
- 1161
- Identities:
- 1017
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ATGGCTCTAAATGACTGTTTCCTTCTGAACTTGGAGGTGGACCATTTCATGCACTGCA---ACATCTCCAGTCA 71
|||||||.||||.|.||||.||..|||||||||||.|||||||.||||.||..||||| |||.||.||.|||
Sbjct 1 ATGGCTCCAAATAATTGTTCCCACCTGAACTTGGACGTGGACCCTTTCCTGTCCTGCAACGACACCTTCAATCA 74
Query 72 CAGTGCGGA-TCTCCCCGTGAACGATG----ACTGGTCCCACCCGGGGATCCTCTATGTCATCCCTGCAGTTTA 140
.||| |.|| ||.|||| |.|||| ||||||..||||||||..||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAGT-CTGAGTCCCCCC----AAGATGGACAACTGGTTTCACCCGGGCTTCATCTATGTCATCCCTGCAGTTTA 143
Query 141 TGGGGTTATCATTCTGATAGGCCTCATTGGCAACATCACTTTGATCAAGATCTTCTGTACAGTCAAGTCCATGC 214
||||.|||||||..|||||||.||.||||||||||||||..|.||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 144 TGGGCTTATCATCGTGATAGGTCTTATTGGCAACATCACGCTCATCAAGATCTTCTGCACGGTCAAGTCCATGC 217
Query 215 GAAACGTTCCAAACCTGTTCATTTCCAGTCTGGCTTTGGGAGACCTGCTCCTCCTAATAACGTGTGCTCCAGTG 288
|||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||.||.||.|||
Sbjct 218 GAAACGTGCCAAACCTGTTCATCTCTAGCCTGGCTTTGGGAGACCTGCTGCTGCTGGTGACATGCGCCCCTGTG 291
Query 289 GATGCCAGCAGGTACCTGGCTGACAGATGGCTATTTGGCAGGATTGGCTGCAAACTGATCCCCTTTATACAGCT 362
||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 292 GATGCCAGCAAGTACCTGGCTGACAGGTGGCTATTTGGCAGAATTGGCTGCAAACTGATCCCCTTTATACAACT 365
Query 363 TACCTCTGTTGGGGTGTCTGTCTTCACACTCACGGCGCTCTCGGCAGACAGATACAAAGCCATTGTCCGGCCAA 436
|||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 366 TACTTCAGTGGGGGTGTCTGTCTTCACACTTACGGCACTGTCAGCTGACAGGTACAAAGCCATTGTACGGCCAA 439
Query 437 TGGATATCCAGGCCTCCCATGCCCTGATGAAGATCTGCCTCAAAGCCGCCTTTATCTGGATCATCTCCATGCTG 510
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||..||||.|||.||
Sbjct 440 TGGATATCCAGGCATCCCATGCCCTGATGAAGATCTGTCTCAAAGCTGCTTTGATCTGGATTGTCTCTATGTTG 513
Query 511 CTGGCCATTCCAGAGGCCGTGTTTTCTGACCTCCATCCCTTCCATGAGGAAAG-CACCAACCAGACCTTCATTA 583
.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||| .||||| .||||||||.||||||||||
Sbjct 514 TTGGCCATCCCAGAGGCTGTGTTTTCTGACCTCCACCCCTTCCATG-TGAAAGATACCAACCAAACCTTCATTA 586
Query 584 GCTGTGCCCCATACCCACACTCTAATGAGCTTCACCCCAAAATCCATTCTATGGCTTCCTTTCTGGTCTTCTAC 657
|.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 587 GTTGTGCCCCCTACCCACACTCCAATGAGCTACACCCTAAAATCCATTCCATGGCTTCCTTTCTGGTTTTCTAC 660
Query 658 GTCATCCCACTGTCGATCATCTCTGTTTACTACTACTTCATTGCTAAAAATCTGATCCAGAGTGCTTACAATCT 731
||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||...|||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 661 GTTATCCCACTGGCGATCATCTCTGTCTACTACTACTTCATTGCCCGAAATCTGATTCAGAGTGCCTACAATCT 734
Query 732 TCCCGTGGAAGGGAATATACATGTCAAGAAGCAGATTGAATCCCGGAAGCGACTTGCCAAGACAGTGCTGGTGT 805
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 735 TCCCGTGGAAGGCAATATACATGTCAAGAAGCAGATCGAATCCCGGAAGCGGCTTGCCAAGACAGTACTGGTGT 808
Query 806 TTGTGGGCCTGTTCGCCTTCTGCTGGCTCCCCAATCATGTCATCTACCTGTACCGCTCCTACCACTACTCTGAG 879
||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 809 TTGTGGGCCTCTTTGCCTTCTGCTGGCTCCCCAACCATGTCATCTACCTGTACCGTTCCTACCACTACTCTGAA 882
Query 880 GTGGACACCTCCATGCTCCACTTTGTCACCAGCATCTGTGCCCGCCTCCTGGCCTTCACCAACTCCTGCGTGAA 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 883 GTGGACACCTCCATGCTCCACTTTGTCACCAGCATCTGTGCCCGCCTCCTGGCCTTCACCAACTCCTGTGTGAA 956
Query 954 CCCCTTTGCCCTCTACCTGCTGAGCAAGAGTTTCAGGAAACAGTTCAACACTCAGCTGCTCTGTTGCCAGCCTG 1027
|||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 957 CCCCTTTGCTCTTTATCTGCTGAGCAAGAGCTTCAGGAAGCAGTTCAACACTCAACTTCTCTGCTGCCAGCCTG 1030
Query 1028 GCCTGATCATCCGGTCTCACAGCACTGGAAGGAGTACAACCTGCATGACCTCCCTCAAGAGTACCAACCCCTCC 1101
|||||||.|.|.||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||||||||
Sbjct 1031 GCCTGATGAACAGGTCCCACAGCACAGGCAGAAGTACCACCTGCATGACCTCCTTCAAGAGCACTAACCCCTC- 1103
Query 1102 GTGGCCACCTTTAGCCTCATCAATGGAAACATCTGTCACGAGCGGTATGTC 1152
|||.|||||||||||||||||..||||.||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1104 --GGCTACCTTTAGCCTCATCAACAGAAATATCTGTCATGAGGGGTATGTC 1152