Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06363
• Subject: NM_001297439.2
• Aligned Length: 1986
• Identities: 1963
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGGGCGCTGGGCCTGGGTCCCCAGCCCCTGGCCCCCACCGGGGCTGGGCCCCTTCCTCCTCCTCCTCCTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCGCTGGGCCTGGGTCCCCAGCCCCTGGCCCCCACCGGGGCTGGGCCCCTTCCTCCTCCTCCTCCTGCT  74

Query   75  GCTGCTGCTGCTGCCACGGGGGTTCCAGCCCCAGCCTGGCGGGAACCGTACGGAGTCCCCAGAACCTAATGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGCTGCTGCTGCCACGGGGGTTCCAGCCCCAGCCTGGCGGGAACCGTACGGAGTCCCCAGAACCTAATGCCA  148

Query  149  CAGCGACCCCTGCGATCCCCACTATCCTGGTGACCTCTGTGACCTCTGAGACCCCAGCAACAAGTGCTCCAGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCGACCCCTGCGATCCCCACTATCCTGGTGACCTCTGTGACCTCTGAGACCCCAGCAACAAGTGCTCCAGAG  222

Query  223  GCAGAGGGACCCCAAAGTGGGGGGCTCCCGCCCCCGCCCAGGGCAGTTCCCTCGAGCAGTAGCCCCCAGGCCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGAGGGACCCCAAAGTGGGGGGCTCCCGCCCCCGCCCAGGGCAGTTCCCTCGAGCAGTAGCCCCCAGGCCCA  296

Query  297  AGCACTCACCGAGGACGGGAGGCCCTGCAGGTTCCCCTTCCGCTACGGGGGCCGCATGCTGCATGCCTGCACTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCACTCACCGAGGACGGGAGGCCCTGCAGGTTCCCCTTCCGCTACGGGGGCCGCATGCTGCATGCCTGCACTT  370

Query  371  CGGAGGGCAGTGCACACAGGAAGTGGTGTGCCACAACTCACAACTACGACCGGGACAGGGCCTGGGGCTACTGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGAGGGCAGTGCACACAGGAAGTGGTGTGCCACAACTCACAACTACGACCGGGACAGGGCCTGGGGCTACTGT  444

Query  445  GTGGAGGCCACCCCGCCTCCAGGGGGCCCAGCTGCCCTGGATCCCTGTGCCTCCGGCCCCTGCCTCAATGGAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGGAGGCCACCCCGCCTCCAGGGGGCCCAGCTGCCCTGGATCCCTGTGCCTCCGGCCCCTGCCTCAATGGAGG  518

Query  519  CTCCTGCTCCAATACCCAGGACCCCCAGTCCTATCACTGCAGCTGCCCCCGGGCCTTCACCGGCAAGGACTGCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCCTGCTCCAATACCCAGGACCCCCAGTCCTATCACTGCAGCTGCCCCCGGGCCTTCACCGGCAAGGACTGCG  592

Query  593  GCACAGAGAAATGCTTTGATGAGACACGCTACGAGTACCTGGAGGGGGGCGACCGCTGGGCCCGCGTGCGCCAG  666
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCACAGAGAAATGCTTTGATGAGACCCGCTACGAGTACCTGGAGGGGGGCGACCGCTGGGCCCGCGTGCGCCAG  666

Query  667  GGCCACGTGGAACAGTGCGAGTGCTTGGGGGGCCGGACCTGGTGCGAAGGCACCCGACATACAGCTTGTCTGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCACGTGGAACAGTGCGAGTGCTTCGGGGGCCGGACCTGGTGCGAAGGCACCCGACATACAGCTTGTCTGAG  740

Query  741  CAGCCCTTGCCTGAACGGGGGCACCTGCCACCTGATCGTGGCCACCGGGACCACCGTGTGTGCCTGCCCACCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCCCTTGCCTGAACGGGGGCACCTGCCACCTGATCGTGGCCACCGGGACCACCGTGTGTGCCTGCCCACCAG  814

Query  815  GCTTCGCTGGACGGCTCTGCAACATCGAGCCTGATGAGCGCTGCTTCTTGGGGAACGGCACTGGGTACCGTGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTTCGCTGGACGGCTCTGCAACATCGAGCCTGATGAGCGCTGCTTCTTGGGGAACGGCACTGGGTACCGTGGC  888

Query  889  GTGGCCAGCACCTCAGCCTCGGGCCTCAGCTGCCTGGCCTGGAACTCCGATCTGCTCTACCAGGAGCTGCACGT  962
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Sbjct  889  GTGGCCAGCACCTCAGCCTCGGGCCTCAGCTGCCTGGCCTGGAACTCCGATCTGCTCTACCAGGAGCTGCACGT  962

Query  963  GGACTCCGTGGGCGCCGCGGCCCTGCTGGGCCTGGGCCCCCATGCCTACTGCCGGAATCCGGACAATGACGAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACTCCGTGGGCGCCGCGGCCCTGCTGGGCCTGGGCCCCCATGCCTACTGCCGGAATCCGGACAATGACGAGA  1036

Query 1037  GGCCCTGGTGCTACGTGGTGAAGGACAGCGCGCTCTCCTGGGAGTACTGCCGCCTGGAGGCCTGC---------  1101
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1037  GGCCCTGGTGCTACGTGGTGAAGGACAGCGCGCTCTCCTGGGAGTACTGCCGCCTGGAGGCCTGCGATTTGGAA  1110

Query 1102  ------------GAATCCCTCACCAGAGTCCAACTGTCACCGGATCTCCTGGCGACCCTGCCTGAGCCAGCCTC  1163
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTGAGGGCAGAGAATCCCTCACCAGAGTCCAACTGTCACCGGATCTCCTGGCGACCCTGCCTGAGCCAGCCTC  1184

Query 1164  CCCGGGGCGCCAGGCCTGCGGCAGGAGGCACAAGAAGAGGACGTTCCTGCGGCCACGTATCATCGGCGGCTCCT  1237
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Sbjct 1185  CCCGGGGCGCCAGGCCTGCGGCAGGAGGCACAAGAAGAGGACGTTCCTGCGGCCACGTATCATCGGCGGCTCCT  1258

Query 1238  CCTCGCTGCCCGGCTCGCACCCCTGGCTGGCCGCCATCTACATCGGGGACAGCTTCTGCGCCGGGAGCCTGGTC  1311
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Sbjct 1259  CCTCGCTGCCCGGCTCGCACCCCTGGCTGGCCGCCATCTACATCGGGGACAGCTTCTGCGCCGGGAGCCTGGTC  1332

Query 1312  CACACCTGCTGGGTGGTGTCGGCCGCCCACTGCTTCTCCCACAGCCCCCCCAGGGACAGCGTCTCCGTGGTGCT  1385
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Sbjct 1333  CACACCTGCTGGGTGGTGTCGGCCGCCCACTGCTTCTCCCACAGCCCCCCCAGGGACAGCGTCTCCGTGGTGCT  1406

Query 1386  GGGCCAGCACTTCTTCAACCGCACGACGGACGTGACGCAGACCTTCGGCATCGAGAAGTACATCCCGTACACCC  1459
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Sbjct 1407  GGGCCAGCACTTCTTCAACCGCACGACGGACGTGACGCAGACCTTCGGCATCGAGAAGTACATCCCGTACACCC  1480

Query 1460  TGTACTCGGTGTTCAACCCCAGCGACCACGACCTCGTCCTGATCCGGCTGAAGAAGAAAGGGGACCGCTGTGCC  1533
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Sbjct 1481  TGTACTCGGTGTTCAACCCCAGCGACCACGACCTCGTCCTGATCCGGCTGAAGAAGAAAGGGGACCGCTGTGCC  1554

Query 1534  ACACGCTCGCAGTTCGTGCAGCCCATCTGCCTGCCCGAGCCCGGCAGCACCTTCCCCGCAGGACACAAGTGCCA  1607
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Sbjct 1555  ACACGCTCGCAGTTCGTGCAGCCCATCTGCCTGCCCGAGCCCGGCAGCACCTTCCCCGCAGGACACAAGTGCCA  1628

Query 1608  GATTGCGGGCTGGGGCCACTTGGATGAGAACGTGAGCGGCTACTCCAGCTCCCTGCGGGAGGCCCTGGTCCCCC  1681
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Sbjct 1629  GATTGCGGGCTGGGGCCACTTGGATGAGAACGTGAGCGGCTACTCCAGCTCCCTGCGGGAGGCCCTGGTCCCCC  1702

Query 1682  TGGTCGCCGACCACAAGTGCAGCAGCCCTGAGGTCTACGGCGCCGACATCAGCCCCAACATGCTCTGTGCCGGC  1755
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Sbjct 1703  TGGTCGCCGACCACAAGTGCAGCAGCCCTGAGGTCTACGGCGCCGACATCAGCCCCAACATGCTCTGTGCCGGC  1776

Query 1756  TACTTCGACTGCAAGTCCGACGCCTGCCAGGGGGACTCAGGGGGGCCCCTGGCCTGCGAGAAGAACGGCGTGGC  1829
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Sbjct 1777  TACTTCGACTGCAAGTCCGACGCCTGCCAGGGGGACTCAGGGGGGCCCCTGGCCTGCGAGAAGAACGGCGTGGC  1850

Query 1830  TTACCTCTACGGCATCATCAGCTGGGGTGACGGCTGCGGGCGGCTCCACAAGCCGGGGGTCTACACCCGCGTGG  1903
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Sbjct 1851  TTACCTCTACGGCATCATCAGCTGGGGTGACGGCTGCGGGCGGCTCCACAAGCCGGGGGTCTACACCCGCGTGG  1924

Query 1904  CCAACTATGTGGACTGGATCAACGACCGGATACGGCCTCCCAGGCGGCTTGTGGCTCCCTCC  1965
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Sbjct 1925  CCAACTATGTGGACTGGATCAACGACCGGATACGGCCTCCCAGGCGGCTTGTGGCTCCCTCC  1986