Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06397
Subject:
NM_005143.5
Aligned Length:
1218
Identities:
1213
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGAGTGCCCTGGGAGCTGTCATTGCCCTCCTGCTCTGGGGACAGCTTTTTGCAGTGGACTCAGGCAATGATGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGCCCTGGGAGCTGTCATTGCCCTCCTGCTCTGGGGACAGCTTTTTGCAGTGGACTCAGGCAATGATGT  74

Query   75  CACGGATATCGCAGATGACGGCTGCCCGAAGCCCCCCGAGATTGCACATGGCTATGTGGAGCACTCGGTTCGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACGGATATCGCAGATGACGGCTGCCCGAAGCCCCCCGAGATTGCACATGGCTATGTGGAGCACTCGGTTCGCT  148

Query  149  ACCAGTGTAAGAACTACTACAAACTGCGCACAGAAGGAGATGGAGTGTACACCTTAAACAATGAGAAGCAGTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||.|||||||||||
Sbjct  149  ACCAGTGTAAGAACTACTACAAACTGCGCACAGAAGGAGATGGAGTATACACCTTAAATGATAAGAAGCAGTGG  222

Query  223  ATAAATAAGGCTGTTGGAGATAAACTTCCTGAATGTGAAGCAGATGACGGCTGCCCGAAGCCCCCCGAGATTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATAAATAAGGCTGTTGGAGATAAACTTCCTGAATGTGAAGCAGATGACGGCTGCCCGAAGCCCCCCGAGATTGC  296

Query  297  ACATGGCTATGTGGAGCACTCGGTTCGCTACCAGTGTAAGAACTACTACAAACTGCGCACAGAAGGAGATGGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACATGGCTATGTGGAGCACTCGGTTCGCTACCAGTGTAAGAACTACTACAAACTGCGCACAGAAGGAGATGGAG  370

Query  371  TGTACACCTTAAACAATGAGAAGCAGTGGATAAATAAGGCTGTTGGAGATAAACTTCCTGAATGTGAAGCAGTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTACACCTTAAACAATGAGAAGCAGTGGATAAATAAGGCTGTTGGAGATAAACTTCCTGAATGTGAAGCAGTA  444

Query  445  TGTGGGAAGCCCAAGAATCCGGCAAACCCAGTGCAGCGGATCCTGGGTGGACACCTGGATGCCAAAGGCAGCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTGGGAAGCCCAAGAATCCGGCAAACCCAGTGCAGCGGATCCTGGGTGGACACCTGGATGCCAAAGGCAGCTT  518

Query  519  TCCCTGGCAGGCTAAGATGGTTTCCCACCATAATCTCACCACAGGTGCCACGCTGATCAATGAACAATGGCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCCTGGCAGGCTAAGATGGTTTCCCACCATAATCTCACCACAGGTGCCACGCTGATCAATGAACAATGGCTGC  592

Query  593  TGACCACGGCTAAAAATCTCTTCCTGAACCATTCAGAAAATGCAACAGCGAAAGACATTGCCCCTACTTTAACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGACCACGGCTAAAAATCTCTTCCTGAACCATTCAGAAAATGCAACAGCGAAAGACATTGCCCCTACTTTAACA  666

Query  667  CTCTATGTGGGGAAAAAGCAGCTTGTAGAGATTGAGAAGGTTGTTCTACACCCTAACTACTCCCAGGTAGATAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCTATGTGGGGAAAAAGCAGCTTGTAGAGATTGAGAAGGTTGTTCTACACCCTAACTACTCCCAGGTAGATAT  740

Query  741  TGGGCTCATCAAACTCAAACAGAAGGTGTCTGTTAATGAGAGAGTGATGCCCATCTGCCTACCTTCAAAGGATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGGCTCATCAAACTCAAACAGAAGGTGTCTGTTAATGAGAGAGTGATGCCCATCTGCCTACCTTCAAAGGATT  814

Query  815  ATGCAGAAGTAGGGCGTGTGGGTTATGTTTCTGGCTGGGGGCGAAATGCCAATTTTAAATTTACTGACCATCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGCAGAAGTAGGGCGTGTGGGTTATGTTTCTGGCTGGGGGCGAAATGCCAATTTTAAATTTACTGACCATCTG  888

Query  889  AAGTATGTCATGCTGCCTGTGGCTGACCAAGACCAATGCATAAGGCATTATGAAGGCAGCACAGTCCCTGAAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  AAGTATGTCATGCTGCCTGTGGCTGACCAAGACCAATGCATAAGGCATTATGAAGGCAGCACAGTCCCCGAAAA  962

Query  963  GAAGACACCGAAGAGCCCTGTAGGGGTGCAGCCCATACTGAATGAACACACCTTCTGTGCTGGCATGTCTAAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGACACCGAAGAGCCCTGTAGGGGTGCAGCCCATACTGAATGAACACACCTTCTGTGCTGGCATGTCTAAGT  1036

Query 1037  ACCAAGAAGACACCTGCTATGGCGATGCGGGCAGTGCCTTTGCCGTTCACGACCTGGAGGAGGACACCTGGTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCAAGAAGACACCTGCTATGGCGATGCGGGCAGTGCCTTTGCCGTTCACGACCTGGAGGAGGACACCTGGTAT  1110

Query 1111  GCGACTGGGATCTTAAGCTTTGATAAGAGCTGTGCTGTGGCTGAGTATGGTGTGTATGTGAAGGTGACTTCCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCGACTGGGATCTTAAGCTTTGATAAGAGCTGTGCTGTGGCTGAGTATGGTGTGTATGTGAAGGTGACTTCCAT  1184

Query 1185  CCAGGACTGGGTTCAGAAGACCATAGCTGAGAAC  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCAGGACTGGGTTCAGAAGACCATAGCTGAGAAC  1218