Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06449
- Subject:
- NM_004516.4
- Aligned Length:
- 2118
- Identities:
- 2105
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGCGTCCAATGCGAATTTTTGTGAATGATGACCGCCATGTGATGGCAAAGCATTCTTCCGTTTATCCAACACA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCGTCCAATGCGAATTTTTGTGAATGATGACCGCCATGTGATGGCAAAGCATTCTTCCGTTTATCCAACACA 74
Query 75 AGAGGAGCTGGAGGCAGTCCAGAACATGGTGTCCCACACGGAGCGGGCGCTCAAAGCTGTGTCCGACTGGATAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGAGGAGCTGGAGGCAGTCCAGAACATGGTGTCCCACACGGAGCGGGCGCTCAAAGCTGTGTCCGACTGGATAG 148
Query 149 ACGAGCAGGAAAAGGGTAGCAGCGAGCAGGCAGAGTCCGATAACATGGATGTGCCCCCAGAGGACGACAGTAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACGAGCAGGAAAAGGGTAGCAGCGAGCAGGCAGAGTCCGATAACATGGATGTGCCCCCAGAGGACGACAGTAAA 222
Query 223 GAAGGGGCTGGGGAACAGAAGACGGAGCACATGACCAGAACCCTGCGGGGAGTGATGCGGGTGGGCCTGGTGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGGGGCTGGGGAACAGAAGACGGAGCACATGACCAGAACCCTGCGGGGAGTGATGCGGGTGGGCCTGGTGGC 296
Query 297 AAAGGGCCTCCTACTCAAGGGGGACTTGGATCTGGAGCTGGTGCTGCTGTGTAAGGAGAAGCCCACAACCGCCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAAGGGCCTCCTACTCAAGGGGGACTTGGATCTGGAGCTGGTGCTGCTGTGTAAGGAGAAGCCCACAACCGCCC 370
Query 371 TCCTGGACAAGGTGGCCGACAACCTGGCCATCCAGCTTGCTGCTGTAACAGAAGACAAGTACGAAATACTGCAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCCTGGACAAGGTGGCCGACAACCTGGCCATCCAGCTTGCTGCTGTAACAGAAGACAAGTACGAAATACTGCAA 444
Query 445 TCTGTCGACGATGCTGCGATTGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCTCCATTGTCCCTGACCATCCACCTGACATC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCTGTCGACGATGCTGCGATTGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCTCCATTGTCCCTGACCATCCACCTGACATC 518
Query 519 CCCTGTTGTCAGAGAAGAAATGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACGACCCCCCGGACGTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCCTGTTGTCAGAGAAGAAATGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACGACCCCCCGGACGTTC 592
Query 593 TGGACAGGCAGAAATGCCTTGCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAGGCCAGAGCCAACGGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGACAGGCAGAAATGCCTTGCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAGGCCAGAGCCAACGGG 666
Query 667 CTGAAGTCTTGTGTCATTGTGATCCGGGTCTTGAGGGACCTGTGCACTCGCGTGCCCACCTGGGGTCCCCTCCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGAAGTCTTGTGTCATTGTGATCCGGGTCTTGAGGGACCTGTGCACTCGCGTGCCCACCTGGGGTCCCCTCCG 740
Query 741 AGGCTGGCCTCTCGAGCTCCTGTGTGAGAAATCCATTGGCACGGCCAACAGACCGATGGGTGCTGGCGAGGCCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGCTGGCCTCTCGAGCTCCTGTGTGAGAAATCCATTGGCACGGCCAACAGACCGATGGGTGCTGGCGAGGCCC 814
Query 815 TGCGGAGAGTGCTGGAGTGCCTGGCGTCGGGCATCGTGATGCCAGATGGTTCTGGCATTTATGACCCTTGTGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCGGAGAGTGCTGGAGTGCCTGGCGTCGGGCATCGTGATGCCAGATGGTTCTGGCATTTATGACCCTTGTGAA 888
Query 889 AAAGAAGCCACTGATGCTATTGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACAGAGTGCGCAGCACGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGAAGCCACTGATGCTATTGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACAGAGTGCGCAGCACGC 962
Query 963 ACTGCGGCTCGCTGCCTTCGGCCAGCTCCATAAAGTCCTAGGCATGGACCCTCTGCCTTCCAAGATGCCCAAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACTGCGGCTCGCTGCCTTCGGCCAGCTCCATAAAGTCCTAGGCATGGACCCTCTGCCTTCCAAGATGCCCAAGA 1036
Query 1037 AACCAAAGAATGAAAACCCAGTGGACTACACCGTTCAGATCCCACCAAGCACCACCTATGCCATTACGCCCATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AACCAAAGAATGAAAACCCAGTGGACTACACCGTTCAGATCCCACCAAGCACCACCTATGCCATTACGCCCATG 1110
Query 1111 AAACGCCCAATGGAGGAGGACGGGGAGGAGAAGTCGCCCAGCAAAAAGAAGAAGAAGATTCAGAAGAAAGAGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAACGCCCAATGGAGGAGGACGGGGAGGAGAAGTCGCCCAGCAAAAAGAAGAAGAAGATTCAGAAGAAAGAGGA 1184
Query 1185 GAAGGCAGAGCCCCCCCAGGCTATGAATGCCCTGATGCGGTTGAACCAGCTGAAGCCAGGGCTGCAGTACAAGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAAGGCAGAGCCCCCCCAGGCTATGAATGCCCTGATGCGGTTGAACCAGCTGAAGCCAGGGCTGCAGTACAAGC 1258
Query 1259 TGGTGTCCCAGACTGGGCCCGTCCATGCCCCCATCTTTACCATGTCTGTGGAGGTTGATGGCAATTCATTCGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGTGTCCCAGACTGGGCCCGTCCATGCCCCCATCTTTACCATGTCTGTGGAGGTTGATGGCAATTCATTCGAG 1332
Query 1333 GCCTCTGGGCCCTCCAAAAAGACGGCCAAGCTGCACGTGGCCGTTAAGGTGTTACAGGACATGGGCTTGCCGAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCCTCTGGGCCCTCCAAAAAGACGGCCAAGCTGCACGTGGCCGTTAAGGTGTTACAGGACATGGGCTTGCCGAC 1406
Query 1407 GGGTGCTGAAGGCAGGGACTCGAGCAAGGGGGAGGACTCGGCTGAGGAGACCGAGGCGAAGCCAGCAGTGGTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGTGCTGAAGGCAGGGACTCGAGCAAGGGGGAGGACTCGGCTGAGGAGACCGAGGCGAAGCCAGCAGTGGTGG 1480
Query 1481 CCCCTGCCCCAGTGGTAGAAGCTGTCTCCACCCCTAGTGCGGCCTTTCCCTCAGATGCCACTGCCGAGAACGTA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCCCTGCCCCAGTGGTAGAAGCTGTCTCCACCCCTAGTGCGGCCTTTCCCTCAGATGCCACTGCCG-------- 1546
Query 1555 AAACAGCAGGGGCCGATCCTGACAAAGCACGGCAAGAACCCAGTCATGGAGCTGAACGAGAAGAGGCGTGGGCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 ----AGCAGGGGCCGATCCTGACAAAGCACGGCAAGAACCCAGTCATGGAGCTGAACGAGAAGAGGCGTGGGCT 1616
Query 1629 CAAGTACGAGCTCATCTCCGAGACCGGGGGCAGCCACGACAAGCGCTTCGTCATGGAGGTCGAAGTGGATGGAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 CAAGTACGAGCTCATCTCCGAGACCGGGGGCAGCCACGACAAGCGCTTCGTCATGGAGGTCGAAGTGGATGGAC 1690
Query 1703 AGAAGTTCCAAGGTGCTGGTTCCAACAAAAAGGTGGCGAAGGCCTACGCTGCTCTTGCTGCCCTAGAAAAGCTT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 AGAAGTTCCAAGGTGCTGGTTCCAACAAAAAGGTGGCGAAGGCCTACGCTGCTCTTGCTGCCCTAGAAAAGCTT 1764
Query 1777 TTCCCTGACACCCCTCTCGCCCTTGATGCCAACAAAAAGAAGAGAGCCCCAGTACCCGTCAGAGGGGGACCGAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 TTCCCTGACACCCCTCTCGCCCTTGATGCCAACAAAAAGAAGAGAGCCCCAGTACCCGTCAGAGGGGGACCGAA 1838
Query 1851 ATTTGCTGCTAAGCCACATAACCCTGGCTTCGGCATGGGAGGCCCCATGCACAACGAAGTGCCCCCACCCCCCA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 ATTTGCTGCTAAGCCACATAACCCTGGCTTCGGCATGGGAGGCCCCATGCACAACGAAGTGCCCCCACCCCCCA 1912
Query 1925 ACCTTCGAGGGCGGGGAAGAGGCGGGAGCATCCGGGGACGAGGGCGCGGGCGAGGATTTGGTGGCGCCAACCAT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 ACCTTCGAGGGCGGGGAAGAGGCGGGAGCATCCGGGGACGAGGGCGCGGGCGAGGATTTGGTGGCGCCAACCAT 1986
Query 1999 GGAGGCTACATGAATGCCGGTGCTGGGTATGGAAGCTATGGGTACGGAGGCAACTCTGCGACAGCAGGCTACAG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1987 GGAGGCTACATGAATGCCGGTGCTGGGTATGGAAGCTATGGGTACGGAGGCAACTCGGCGACAGCAGGCTACAG 2060
Query 2073 TGACTTTTTCACAGACTGCTACGGCTATCATGATTTTGGGTCTTCC 2118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061 TGACTTTTTCACAGACTGCTACGGCTATCATGATTTTGGGTCTTCC 2106