Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06449
- Subject:
- XM_006722742.2
- Aligned Length:
- 2576
- Identities:
- 2096
- Gaps:
- 469
Alignment
Query 1 ATGCGTCCAATGCGAATTTTTGTGAATGATGACCGCCATGTGATGGCAAAGCATTCTTCCGTTTATCCAACACA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCGTCCAATGCGAATTTTTGTGAATGATGACCGCCATGTGATGGCAAAGCATTCTTCCGTTTATCCAACACA 74
Query 75 AGAGGAGCTGGAGGCAGTCCAGAACATGGTGTCCCACACGGAGCGGGCGCTCAAAGCTGTGTCCGACTGGATAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGAGGAGCTGGAGGCAGTCCAGAACATGGTGTCCCACACGGAGCGGGCGCTCAAAGCTGTGTCCGACTGGATAG 148
Query 149 ACGAGCAGGAAAAGGGTAGCAGCGAGCAGGCAGAGTCCGATAACATGGATGTGCCCCCAGAGGACGACAGTAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACGAGCAGGAAAAGGGTAGCAGCGAGCAGGCAGAGTCCGATAACATGGATGTGCCCCCAGAGGACGACAGTAAA 222
Query 223 GAAGGGGCTGGGGAACAGAAGACGGAGCACATGACCAGAACCCTGCGGGGAGTGATGCGGGTGGGCCTGGTGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGGGGCTGGGGAACAGAAGACGGAGCACATGACCAGAACCCTGCGGGGAGTGATGCGGGTGGGCCTGGTGGC 296
Query 297 AAAGGGCCTCCTACTCAAGGGGGACTTGGATCTGGAGCTGGTGCTGCTGTGTAAGGAGAAGCCCACAACCGCCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAAGGGCCTCCTACTCAAGGGGGACTTGGATCTGGAGCTGGTGCTGCTGTGTAAGGAGAAGCCCACAACCGCCC 370
Query 371 TCCTGGACAAGGTGGCCGACAACCTGGCCATCCAGCTTGCTGCTGTAACAGAAGACAAGTACGAAATACTGCAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCCTGGACAAGGTGGCCGACAACCTGGCCATCCAGCTTGCTGCTGTAACAGAAGACAAGTACGAAATACTGCAA 444
Query 445 TCTGTCGACGATGCTGCGATTGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCTCCATTGTCCCTGACCATCCACCTGACATC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCTGTCGACGATGCTGCGATTGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCTCCATTGTCCCTGACCATCCACCTGACATC 518
Query 519 CCCTGTTGTCAGAGAAGAAATGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACGACCCCCCGGACGTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCCTGTTGTCAGAGAAGAAATGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACGACCCCCCGGACGTTC 592
Query 593 TGGACAGGCAGAAATGCCTTGCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAGGCCAGAGCCAACGGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGACAGGCAGAAATGCCTTGCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAGGCCAGAGCCAACGGG 666
Query 667 CTGAAGTCTTGTGTCATTGTGATCCGGGTCTTGAGGGACCTGTGCACTCGCGTGCCCACCTGGGGTCCCCTCCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGAAGTCTTGTGTCATTGTGATCCGGGTCTTGAGGGACCTGTGCACTCGCGTGCCCACCTGGGGTCCCCTCCG 740
Query 741 AGGCTGGCCTCTCGAGCTCCTGTGTGAGAAATCCATTGGCACGGCCAACAGACCGATGGGTGCTGGCGAGGCCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGCTGGCCTCTCGAGCTCCTGTGTGAGAAATCCATTGGCACGGCCAACAGACCGATGGGTGCTGGCGAGGCCC 814
Query 815 TGCGGAGAGTGCTGGAGTGCCTGGCGTCGGGCATCGTGATGCCAGATGGTTCTGGCATTTATGACCCTTGTGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCGGAGAGTGCTGGAGTGCCTGGCGTCGGGCATCGTGATGCCAGATGGTTCTGGCATTTATGACCCTTGTGAA 888
Query 889 AAAGAAGCCACTGATGCTATTGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACAGAGTGCGCAGCACGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGAAGCCACTGATGCTATTGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACAGAGTGCGCAGCACGC 962
Query 963 ACTGCGGCTCGCTGCCTTCGGCCAGCTCCATAAAGTCCTAGGCATGGACCCTCTGCCTTCCAAGATGCCCAAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACTGCGGCTCGCTGCCTTCGGCCAGCTCCATAAAGTCCTAGGCATGGACCCTCTGCCTTCCAAGATGCCCAAGA 1036
Query 1037 AACCAAAGAATGAAAACCCAGTGGACTACACCGTTCAGATCCCACCAAGCACCACCTATGCCATTACGCCCATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AACCAAAGAATGAAAACCCAGTGGACTACACCGTTCAGATCCCACCAAGCACCACCTATGCCATTACGCCCATG 1110
Query 1111 AAACGCCCAATGGAGGAGGACGGGGAGGAGAAGTCGCCCAGCAAAAAGAAGAAGAAGATTCAGAAGAAAGAGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAACGCCCAATGGAGGAGGACGGGGAGGAGAAGTCGCCCAGCAAAAAGAAGAAGAAGATTCAGAAGAAAGAGGA 1184
Query 1185 GAAGGCAGAGCCCCCCCAGGCTATGAATGCCCTGATGCGGTTGAACCAGCTGAAGCCAGGGCTGCAGTACAAGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAAGGCAGAGCCCCCCCAGGCTATGAATGCCCTGATGCGGTTGAACCAGCTGAAGCCAGGGCTGCAGTACAAGC 1258
Query 1259 TGGTGTCCCAGACTGGGCCCGTCCATGCCCCCATCTTTACCATGTCTGTGGAGGTTGATGGCAATTCATTCGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGTGTCCCAGACTGGGCCCGTCCATGCCCCCATCTTTACCATGTCTGTGGAGGTTGATGGCAATTCATTCGAG 1332
Query 1333 GCCTCTGGGCCCTCCAAAAAGACGGCCAAGCTGCACGTGGCCGTTAAGGTGTTACAGGACATGGGCTTGCCGAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCCTCTGGGCCCTCCAAAAAGACGGCCAAGCTGCACGTGGCCGTTAAGGTGTTACAGGACATGGGCTTGCCGAC 1406
Query 1407 GGGTGCTGAAGGCAGGGACTCGAGCAAGGGGGAGGACTCGGCTGAGGAGACCGAGGCGAAGCCAGCAGTGGTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGTGCTGAAGGCAGGGACTCGAGCAAGGGGGAGGACTCGGCTGAGGAGACCGAGGCGAAGCCAGCAGTGGTGG 1480
Query 1481 CCCCTGCCCCAGTGGTAGAAGCTGTCTCCACCCCTAGTGCGGCCTTTCCCTCAGATGCCACTGCCGAGAACGTA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCCCTGCCCCAGTGGTAGAAGCTGTCTCCACCCCTAGTGCGGCCTTTCCCTCAGATGCCACTGCCGAGAACGTA 1554
Query 1555 AAACAGCAGGGGCCGATCCTGACAAAGCACGGCAAGAACCCAGTCATGGAGCTGAACGAGAAGAGGCGTGGGCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAACAGCAGGGGCCGATCCTGACAAAGCACGGCAAGAACCCAGTCATGGAGCTGAACGAGAAGAGGCGTGGGCT 1628
Query 1629 CAAGTACGAGCTCATCTCCGAGACCGGGGGCAGCCACGACAAGCGCTTCGTCATGGAGGTCGAAGTGGATGGAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAAGTACGAGCTCATCTCCGAGACCGGGGGCAGCCACGACAAGCGCTTCGTCATGGAGGTCGAAGTGGATGGAC 1702
Query 1703 AGAAGTTCCAAGGTGCTGGTTCCAACAAAAAGGTGGCGAAGGCCTACGCTGCTCTTGCTGCCCTAGAAAAGCTT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGAAGTTCCAAGGTGCTGGTTCCAACAAAAAGGTGGCGAAGGCCTACGCTGCTCTTGCTGCCCTAGAAAAGCTT 1776
Query 1777 TTCCCTGACACCCCTCTCGCCCTTGATGCCAACAAAAAGAAGAGAGCCCCAGTACCCGTCAGAGGGGGACCGAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TTCCCTGACACCCCTCTCGCCCTTGATGCCAACAAAAAGAAGAGAGCCCCAGTACCCGTCAGAGGGGGACCGAA 1850
Query 1851 ATTTGCTGCTAAGCCACATAACCCTGGCTTCGGCATGGGAGGCCCCATGCACAACGAAGTGCCCCCACCCCCCA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATTTGCTGCTAAGCCACATAACCCTGGCTTCGGCATGGGAGGCCCCATGCACAACGAAGTGCCCCCACCCCCCA 1924
Query 1925 ACCTTCGAGGGCGGGGAAGAGGCGGGAGCATCCGGGGACGAGGGCGCGGGCGAGGATTTGGTGGCGCCAACCAT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACCTTCGAGGGCGGGGAAGAGGCGGGAGCATCCGGGGACGAGGGCGCGGGCGAGGATTTGGTGGCGCCAACCAT 1998
Query 1999 GGAGGCTACATGAATGCCGGTGCTGGGTATGGAAGCTATGGGTACGGAGGCAACTCTGCGACAGCAGGCTACAG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1999 GGAGGCTACATGAATGCCGGTGCTGGGTATGGAAGCTATGGGTACGGAGGCAACTCGGCGACAGCAGGCTACAG 2072
Query 2073 TGACTTTTTCACAGACTGCTACGGCTATCATG--ATTTTGGGTCTTCC-------------------------- 2118
|.|.||.| ||.||.|||| |.| |||.||||..|.||
Sbjct 2073 TCAGTTCT------ACAGCAACGG-----AGGGCATTCTGGGAATGCCAGTGGCGGTGGCGGCGGGGGCGGTGG 2135
Query 2119 -------------------------------------------------------------------------- 2118
Sbjct 2136 TGGCTCCTCCGGCTATGGCTCCTACTACCAAGGTGACAACTACAACTCACCGGTGCCCCCAAAACACGCTGGGA 2209
Query 2119 -------------------------------------------------------------------------- 2118
Sbjct 2210 AGAAGCAGCCGCACGGGGGCCAGCAGAAGCCCTCCTACGGCTCGGGCTACCAGTCCCACCAGGGCCAGCAGCAG 2283
Query 2119 -------------------------------------------------------------------------- 2118
Sbjct 2284 TCCTACAACCAGAGCCCCTACAGCAACTATGGCCCTCCACAGGGCAAGCAGAAAGGCTATAACCATGGACAAGG 2357
Query 2119 -------------------------------------------------------------------------- 2118
Sbjct 2358 CAGCTACTCCTACTCGAACTCCTACAACTCTCCCGGGGGCGGGGGCGGATCCGACTACAACTACGAGAGCAAAT 2431
Query 2119 -------------------------------------------------------------------------- 2118
Sbjct 2432 TCAGAGGCTACTCACAGTCGAACTACAACTCCCCGGGGTCCGGCCAGAACTACAGTGGCCCTCCCAGCTCCTAC 2505
Query 2119 ------------------------------------------------------------ 2118
Sbjct 2506 CAGTCCTCACAAGGCGGCTATGGCAGAAACGCAGACCACAGCATGAACTACCAGTACAGA 2565