Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06449
• Subject: XM_011242405.2
• Aligned Length: 2410
• Identities: 1831
• Gaps: 320

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------AT-----GCGTCCAATGCGAATTTT  20
                                                             ||     ||||||.|||.|||||||
Sbjct    1  ATGGCATTGTATCATCATCACTTCATCACAAGAAGAAGAAGGTTTTCGCATTTCCAGCGTCCCATGAGAATTTT  74

Query   21  TGTGAATGATGACCGCCATGTGATGGCAAAGCATTCTTCCGTTTATCCAACACAAGAGGAGCTGGAGGCAGTCC  94
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct   75  TGTGAATGATGATCGCCACGTGATGGCAAAGCATTCTTCAGTGTACCCAACACAAGAGGAGCTGGAGGCTGTAC  148

Query   95  AGAACATGGTGTCCCACACGGAGCGGGCGCTCAAAGCTGTGTCCGACTGGATAGACGAGCAGGAAAAGGGTAGC  168
            ||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|.|
Sbjct  149  AGAACATGGTGTCCCATACTGAGCGGGCCCTGAAGGCTGTCTCTGACTGGATTGATGAGCAGGAGAAAGGCAAC  222

Query  169  AGCGAGCAGGCAGAGTCCGATAACATGGATGTGCCCCCAGAGGACGACAGTAAAGAAGGGGCTGGGGAACAGAA  242
            |||||||...|.|||.|.||.||.|||||....||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCGAGCTCTCTGAGGCAGAAAATATGGACACACCCCCAGACGATGAGAGCAAAGAAGGGGCTGGGGAACAGAA  296

Query  243  GACGGAGCACATGACCAGAACCCTGCGGGGAGTGATGCGGGTGGGCCTGGTGGCAAAGGGCCTCCTACTCAAGG  316
            |.||||.||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct  297  GGCGGAACACATGACTAGGACCCTGAGGGGCGTGATGCGGGTCGGCCTGGTAGCCAAGGGTCTTCTGCTCAAGG  370

Query  317  GGGACTTGGATCTGGAGCTGGTGCTGCTGTGTAAGGAGAAGCCCACAACCGCCCTCCTGGACAAGGTGGCCGAC  390
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  GGGACTTGGATCTGGAGCTGGTTCTGCTCTGTAAGGAGAAGCCCACAACCGCCCTTCTGGACAAGGTGGCTGAC  444

Query  391  AACCTGGCCATCCAGCTTGCTGCTGTAACAGAAGACAAGTACGAAATACTGCAATCTGTCGACGATGCTGCGAT  464
            |||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  AACCTGGCCATCCAGCTCACTACTGTAACAGAAGACAAGTATGAAATACTCCAGTCTGTGGATGATGCTGCGAT  518

Query  465  TGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCTCCATTGTCCCTGACCATCCACCTGACATCCCCTGTTGTCAGAGAAGAAA  538
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCCCCCTTGTCCTTGACCATCCATCTGACCTCCCCTGTTGTCAGAGAAGAAA  592

Query  539  TGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACGACCCCCCGGACGTTCTGGACAGGCAGAAATGCCTT  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACGATCCCCCGGACGTTCTGGACAGGCAGAAATGCCTT  666

Query  613  GCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAGGCCAGAGCCAACGGGCTGAAGTCTTGTGTCATTGT  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAGGCCAGAGCCAATGGACTGAAGTCATGTGTCATTGT  740

Query  687  GATCCGGGTCTTGAGGGACCTGTGCACTCGCGTGCCCACCTGGGGTCCCCTCCGAGGCTGGCCTCTCGAGCTCC  760
            .|||||.|||.|.||||||.||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  741  CATCCGTGTCCTAAGGGACTTGTGTACCCGAGTGCCCACCTGGGGTCCCCTCAGAGGATGGCCTCTGGAGCTGC  814

Query  761  TGTGTGAGAAATCCATTGGCACGGCCAACAGACCGATGGGTGCTGGCGAGGCCCTGCGGAGAGTGCTGGAGTGC  834
            ||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTGTGAGAAGTCCATCGGCACTGCCAATAGGCCAATGGGTGCTGGTGAAGCCCTGCGGAGAGTGCTGGAGTGC  888

Query  835  CTGGCGTCGGGCATCGTGATGCCAGATGGTTCTGGCATTTATGACCCTTGTGAAAAAGAAGCCACTGATGCTAT  908
            |||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGCATCCGGCATCGTAATGCCAGATGGTTCTGGCATTTATGACCCTTGTGAAAAAGAAGCCACTGATGCTAT  962

Query  909  TGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACAGAGTGCGCAGCACGCACTGCGGCTCGCTGCCTTCG  982
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  963  TGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACAGAGTGCGCAGCATGCTCTGCGGCTTGCTGCCTTTG  1036

Query  983  GCCAGCTCCATAAAGTCCTAGGCATGGACCCTCTGCCTTCCAAGATGCCCAAGAAACCAAAGAATGAAAACCCA  1056
            |.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  GTCAACTCCATAAAGTACTGGGAATGGACCCCCTGCCTTCCAAAATGCCCAAGAAACCAAAGAACGAGAACCCG  1110

Query 1057  GTGGACTACACCGTTCAGATCCCACCAAGCACCACCTATGCCATTACGCCCATGAAACGCCCAATGGAGGAGGA  1130
            |||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  GTGGACTACACTGTTCAAATTCCTCCCAGCACCACCTATGCTATCACACCCATGAAACGCCCTATGGAAGAGGA  1184

Query 1131  CGGGGAGGAGAAGTCGCCCAGCAAAAAGAAGAAGAAGATTCAGAAGAAAGAGGAGAAGGCAGAGCCCCCCCAGG  1204
            .||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct 1185  TGGGGAGGAGAAGTCTCCCAGCAAGAAGAAAAAGAAGATCCAGAAGAAAGAGGAGAAGGCTGATCCTCCTCAAG  1258

Query 1205  CTATGAATGCCCTGATGCGGTTGAACCAGCTGAAGCCAGGGCTGCAGTACAAGCTGGTGTCCCAGACTGGGCCC  1278
            |||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||.||.
Sbjct 1259  CTATGAATGCCCTGATGAGGTTAAATCAGCTGAAGCCAGGGCTGCAGTACAAGCTGATCTCCCAGACAGGCCCT  1332

Query 1279  GTCCATGCCCCCATCTTTACCATGTCTGTGGAGGTTGATGGCAATTCATTCGAGGCCTCTGGGCCCTCCAAAAA  1352
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||.|...|||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1333  GTTCATGCTCCCATCTTCACCATGTCTGTGGAGGTAGACGGCAGTAACTTCGAGGCCTCGGGGCCATCTAAAAA  1406

Query 1353  GACGGCCAAGCTGCACGTGGCCGTTAAGGTGTTACAGGACATGGGCTTGCCGACGGGTGCTGAAGGCAGGGACT  1426
            |||.||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1407  GACTGCCAAGCTTCATGTAGCTGTGAAGGTGTTACAGGACATGGGCTTGCCAACAGGCGCTGAAGGCAGAGACT  1480

Query 1427  CGAGCAAGGGGGAGGACTCGGCTGAGGAGACCGAGGCGAAGCCAGCAGTGGTGGCCCCTGCCCCAGTGGTAGAA  1500
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.|.||||||||||.|.||||||||..||||.|||||.|||
Sbjct 1481  CCAGCAAGGGGGAAGACTCCGCTGAGGAGTCAGATGGGAAGCCAGCAATAGTGGCCCCACCCCCTGTGGTGGAA  1554

Query 1501  GCTGTCTCCACCCCTAGTGCGGCCTTTCCCTCAGATGCCACTGCCGAGAACGTAAAACAGCAGGGGCCGATCCT  1574
            ||||||||||.|||.|||.|.|.|||.||.||||||||||||.|.|            |||||||.|||||..|
Sbjct 1555  GCTGTCTCCAACCCCAGTTCTGTCTTCCCTTCAGATGCCACTACTG------------AGCAGGGACCGATTTT  1616

Query 1575  GACAAAGCACGGCAAGAACCCAGTCATGGAGCTGAACGAGAAGAGGCGTGGGCTCAAGTACGAGCTCATCTCCG  1648
            |||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|
Sbjct 1617  GACTAAGCATGGCAAGAACCCTGTTATGGAGCTTAATGAGAAGAGACGTGGCCTCAAATATGAGCTCATTTCTG  1690

Query 1649  AGACCGGGGGCAGCCACGACAAGCGCTTCGTCATGGAGGTCGAAGTGGATGGACAGAAGTTCCAAGGTGCTGGT  1722
            ||||.|||||||||||||||||..|.||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1691  AGACGGGGGGCAGCCACGACAAAAGGTTTGTTATGGAGGTTGAGGTGGACGGACAGAAGTTTCAAGGTGCTGGT  1764

Query 1723  TCCAACAAAAAGGTGGCGAAGGCCTACGCTGCTCTTGCTGCCCTAGAAAAGCTTTTCCCTGACACCCCTCTCGC  1796
            ||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||..|||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1765  TCAAACAAAAAGGTGGCAAAGGCTTATGCTGCACTTGCCGCATTAGAAAAACTTTTCCCTGATACCCCTCTTGC  1838

Query 1797  CCTTGATGCCAACAAAAAGAAGAGAGCCCCAGTACCCGTCAGAGGGGGACCGAAATTTGCTGCTAAGCCACATA  1870
            .|||||.||||||||||||||.||..||||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1839  TCTTGAAGCCAACAAAAAGAAAAGGACCCCAGTACCTGTCCGAGGTGGACCCAAATTTGCTGCCAAGCCACACA  1912

Query 1871  ACCCTGGCTTCGGCATGGGAGGCCCCATGCACAACGAAGTGCCCCCACCCCCCAACCTTCGAGGGCGGGGAAGA  1944
            |||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||.|.|||||.|||||..||
Sbjct 1913  ACCCTGGTTTTGGCATGGGAGGCCCCATGCATAATGAAGTGCCGCCACCTCCTAACATCCGAGGTCGGGGCCGA  1986

Query 1945  GGCGGGAGCATCCGGGGACGAGGGCGCGGGCGAGGATTTGGTGGCGCCAACCAT---GGAGGCTACATGAATGC  2015
            ||.||.|.||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||
Sbjct 1987  GGAGGTAACATCCGAGGGCGAGGACGGGGGCGAGGATTTGGTGGCGCCAACCATGGAGGAGGCTACATGAATGC  2060

Query 2016  CGGTGCTGGGTATGGAAGCTATGGGTACGGAGGCAACTCTGCGACAGCAGGCTACAGTGACTTTTTCACAG---  2086
            .||||||||.||||||||||||||||||.|..||||.||.||.|||||||||||||   |||     ||||   
Sbjct 2061  TGGTGCTGGATATGGAAGCTATGGGTACAGCAGCAATTCGGCCACAGCAGGCTACA---ACT-----ACAGTGG  2126

Query 2087  -----------------------ACTGCTACGGCT--ATCATGATTTTGGGTCTTCC-----------------  2118
                                   ||.||||.||||  |.|        |||||.||.                 
Sbjct 2127  GAGTGGAGGCCGGAGTGGAGGCAACAGCTATGGCTCCAGC--------GGGTCATCGTCCTACAACACAGGCTC  2192

Query 2119  --------------------------------------------------------------------------  2118
                                                                                      
Sbjct 2193  ACATGGAGGCTATGGCACAGGCTCCGGAGGCAGCTCTTCATACCAAGGCAAACAAGGAGGCTACTCATCACAGT  2266

Query 2119  --------------------------------------------------------------------------  2118
                                                                                      
Sbjct 2267  CAAACTACAGCTCACCTGGGTCCAGCCAGAGCTACAGTGGTCCTGCCAGCTCCTACCAGTCCTCACAGGGTGGC  2340

Query 2119  ------------------------------------------  2118
                                                      
Sbjct 2341  TACAGTCGGAACACAGAGCACAGCATGAACTACCAGTACAGA  2382