Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06449
- Subject:
- XM_017313144.1
- Aligned Length:
- 2136
- Identities:
- 1851
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ----------AT-----GCGTCCAATGCGAATTTTTGTGAATGATGACCGCCATGTGATGGCAAAGCATTCTTC 59
|| ||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTTTCGCATTTCCAGCGTCCCATGAGAATTTTTGTGAATGATGATCGCCACGTGATGGCAAAGCATTCTTC 74
Query 60 CGTTTATCCAACACAAGAGGAGCTGGAGGCAGTCCAGAACATGGTGTCCCACACGGAGCGGGCGCTCAAAGCTG 133
.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 75 AGTGTACCCAACACAAGAGGAGCTGGAGGCTGTACAGAACATGGTGTCCCATACTGAGCGGGCCCTGAAGGCTG 148
Query 134 TGTCCGACTGGATAGACGAGCAGGAAAAGGGTAGCAGCGAGCAGGCAGAGTCCGATAACATGGATGTGCCCCCA 207
|.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|.||||||||...|.|||.|.||.||.|||||....||||||
Sbjct 149 TCTCTGACTGGATTGATGAGCAGGAGAAAGGCAACAGCGAGCTCTCTGAGGCAGAAAATATGGACACACCCCCA 222
Query 208 GAGGACGACAGTAAAGAAGGGGCTGGGGAACAGAAGACGGAGCACATGACCAGAACCCTGCGGGGAGTGATGCG 281
||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.||||||.||||.||||||||
Sbjct 223 GACGATGAGAGCAAAGAAGGGGCTGGGGAACAGAAGGCGGAACACATGACTAGGACCCTGAGGGGCGTGATGCG 296
Query 282 GGTGGGCCTGGTGGCAAAGGGCCTCCTACTCAAGGGGGACTTGGATCTGGAGCTGGTGCTGCTGTGTAAGGAGA 355
|||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 GGTCGGCCTGGTAGCCAAGGGTCTTCTGCTCAAGGGGGACTTGGATCTGGAGCTGGTTCTGCTCTGTAAGGAGA 370
Query 356 AGCCCACAACCGCCCTCCTGGACAAGGTGGCCGACAACCTGGCCATCCAGCTTGCTGCTGTAACAGAAGACAAG 429
||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCCCACAACCGCCCTTCTGGACAAGGTGGCTGACAACCTGGCCATCCAGCTCACTACTGTAACAGAAGACAAG 444
Query 430 TACGAAATACTGCAATCTGTCGACGATGCTGCGATTGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCTCCATTGTCCCTGAC 503
||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||
Sbjct 445 TATGAAATACTCCAGTCTGTGGATGATGCTGCGATTGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCCCCCTTGTCCTTGAC 518
Query 504 CATCCACCTGACATCCCCTGTTGTCAGAGAAGAAATGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACG 577
||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CATCCATCTGACCTCCCCTGTTGTCAGAGAAGAAATGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACG 592
Query 578 ACCCCCCGGACGTTCTGGACAGGCAGAAATGCCTTGCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAG 651
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATCCCCCGGACGTTCTGGACAGGCAGAAATGCCTTGCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAG 666
Query 652 GCCAGAGCCAACGGGCTGAAGTCTTGTGTCATTGTGATCCGGGTCTTGAGGGACCTGTGCACTCGCGTGCCCAC 725
|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.||||||.||||.||.||.||||||||
Sbjct 667 GCCAGAGCCAATGGACTGAAGTCATGTGTCATTGTCATCCGTGTCCTAAGGGACTTGTGTACCCGAGTGCCCAC 740
Query 726 CTGGGGTCCCCTCCGAGGCTGGCCTCTCGAGCTCCTGTGTGAGAAATCCATTGGCACGGCCAACAGACCGATGG 799
|||||||||||||.||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 741 CTGGGGTCCCCTCAGAGGATGGCCTCTGGAGCTGCTGTGTGAGAAGTCCATCGGCACTGCCAATAGGCCAATGG 814
Query 800 GTGCTGGCGAGGCCCTGCGGAGAGTGCTGGAGTGCCTGGCGTCGGGCATCGTGATGCCAGATGGTTCTGGCATT 873
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGCTGGTGAAGCCCTGCGGAGAGTGCTGGAGTGCCTGGCATCCGGCATCGTAATGCCAGATGGTTCTGGCATT 888
Query 874 TATGACCCTTGTGAAAAAGAAGCCACTGATGCTATTGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACA 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATGACCCTTGTGAAAAAGAAGCCACTGATGCTATTGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACA 962
Query 948 GAGTGCGCAGCACGCACTGCGGCTCGCTGCCTTCGGCCAGCTCCATAAAGTCCTAGGCATGGACCCTCTGCCTT 1021
||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 963 GAGTGCGCAGCATGCTCTGCGGCTTGCTGCCTTTGGTCAACTCCATAAAGTACTGGGAATGGACCCCCTGCCTT 1036
Query 1022 CCAAGATGCCCAAGAAACCAAAGAATGAAAACCCAGTGGACTACACCGTTCAGATCCCACCAAGCACCACCTAT 1095
||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1037 CCAAAATGCCCAAGAAACCAAAGAACGAGAACCCGGTGGACTACACTGTTCAAATTCCTCCCAGCACCACCTAT 1110
Query 1096 GCCATTACGCCCATGAAACGCCCAATGGAGGAGGACGGGGAGGAGAAGTCGCCCAGCAAAAAGAAGAAGAAGAT 1169
||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111 GCTATCACACCCATGAAACGCCCTATGGAAGAGGATGGGGAGGAGAAGTCTCCCAGCAAGAAGAAAAAGAAGAT 1184
Query 1170 TCAGAAGAAAGAGGAGAAGGCAGAGCCCCCCCAGGCTATGAATGCCCTGATGCGGTTGAACCAGCTGAAGCCAG 1243
.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1185 CCAGAAGAAAGAGGAGAAGGCTGATCCTCCTCAAGCTATGAATGCCCTGATGAGGTTAAATCAGCTGAAGCCAG 1258
Query 1244 GGCTGCAGTACAAGCTGGTGTCCCAGACTGGGCCCGTCCATGCCCCCATCTTTACCATGTCTGTGGAGGTTGAT 1317
|||||||||||||||||.|.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1259 GGCTGCAGTACAAGCTGATCTCCCAGACAGGCCCTGTTCATGCTCCCATCTTCACCATGTCTGTGGAGGTAGAC 1332
Query 1318 GGCAATTCATTCGAGGCCTCTGGGCCCTCCAAAAAGACGGCCAAGCTGCACGTGGCCGTTAAGGTGTTACAGGA 1391
||||.|...|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1333 GGCAGTAACTTCGAGGCCTCGGGGCCATCTAAAAAGACTGCCAAGCTTCATGTAGCTGTGAAGGTGTTACAGGA 1406
Query 1392 CATGGGCTTGCCGACGGGTGCTGAAGGCAGGGACTCGAGCAAGGGGGAGGACTCGGCTGAGGAGACCGAGGCGA 1465
||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.|.||
Sbjct 1407 CATGGGCTTGCCAACAGGCGCTGAAGGCAGAGACTCCAGCAAGGGGGAAGACTCCGCTGAGGAGTCAGATGGGA 1480
Query 1466 AGCCAGCAGTGGTGGCCCCTGCCCCAGTGGTAGAAGCTGTCTCCACCCCTAGTGCGGCCTTTCCCTCAGATGCC 1539
||||||||.|.||||||||..||||.|||||.|||||||||||||.|||.|||.|.|.|||.||.|||||||||
Sbjct 1481 AGCCAGCAATAGTGGCCCCACCCCCTGTGGTGGAAGCTGTCTCCAACCCCAGTTCTGTCTTCCCTTCAGATGCC 1554
Query 1540 ACTGCCGAGAACGTAAAACAGCAGGGGCCGATCCTGACAAAGCACGGCAAGAACCCAGTCATGGAGCTGAACGA 1613
|||.|.| |||||||.|||||..||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1555 ACTACTG------------AGCAGGGACCGATTTTGACTAAGCATGGCAAGAACCCTGTTATGGAGCTTAATGA 1616
Query 1614 GAAGAGGCGTGGGCTCAAGTACGAGCTCATCTCCGAGACCGGGGGCAGCCACGACAAGCGCTTCGTCATGGAGG 1687
||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||..|.||.||.|||||||
Sbjct 1617 GAAGAGACGTGGCCTCAAATATGAGCTCATTTCTGAGACGGGGGGCAGCCACGACAAAAGGTTTGTTATGGAGG 1690
Query 1688 TCGAAGTGGATGGACAGAAGTTCCAAGGTGCTGGTTCCAACAAAAAGGTGGCGAAGGCCTACGCTGCTCTTGCT 1761
|.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 1691 TTGAGGTGGACGGACAGAAGTTTCAAGGTGCTGGTTCAAACAAAAAGGTGGCAAAGGCTTATGCTGCACTTGCC 1764
Query 1762 GCCCTAGAAAAGCTTTTCCCTGACACCCCTCTCGCCCTTGATGCCAACAAAAAGAAGAGAGCCCCAGTACCCGT 1835
||..|||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||..||||||||||.||
Sbjct 1765 GCATTAGAAAAACTTTTCCCTGATACCCCTCTTGCTCTTGAAGCCAACAAAAAGAAAAGGACCCCAGTACCTGT 1838
Query 1836 CAGAGGGGGACCGAAATTTGCTGCTAAGCCACATAACCCTGGCTTCGGCATGGGAGGCCCCATGCACAACGAAG 1909
|.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1839 CCGAGGTGGACCCAAATTTGCTGCCAAGCCACACAACCCTGGTTTTGGCATGGGAGGCCCCATGCATAATGAAG 1912
Query 1910 TGCCCCCACCCCCCAACCTTCGAGGGCGGGGAAGAGGCGGGAGCATCCGGGGACGAGGGCGCGGGCGAGGATTT 1983
||||.|||||.||.|||.|.|||||.|||||..||||.||.|.||||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1913 TGCCGCCACCTCCTAACATCCGAGGTCGGGGCCGAGGAGGTAACATCCGAGGGCGAGGACGGGGGCGAGGATTT 1986
Query 1984 GGTGGCGCCAACCAT---GGAGGCTACATGAATGCCGGTGCTGGGTATGGAAGCTATGGGTACGGAGGCAACTC 2054
||||||||||||||| |||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|..||||.||
Sbjct 1987 GGTGGCGCCAACCATGGAGGAGGCTACATGAATGCTGGTGCTGGATATGGAAGCTATGGGTACAGCAGCAATTC 2060
Query 2055 TGCGACAGCAGGCTACAGTGACTTTTTCACAGACTGCTACGGCTATCATGATTTTGGGTCTTCC 2118
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2061 GGCCACAGCAGGCTACAGTGACTTTTTCACAGACTGCTACGGCTATCATGATTTTGGGGCTTCC 2124