Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06466
• Subject: XM_017024588.2
• Aligned Length: 2286
• Identities: 2231
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------ATGGAGGTGATGAACCTGATGGA  23
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGACACTGAGGTTCTGTGGGGAGAGGAACTGCCCCAGTATAGCCACGATGGAGGTGATGAACCTGATGGA  74

Query   24  GCAGCCTATCAAGGTGACTGAGTGGCAGCAGACATACACCTACGACTCGGGTATCCACTCGGGCGCCAACACCT  97
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGCCTATCAAGGTGACTGAGTGGCAGCAGACATACACCTACGACTCGGGTATCCACTCGGGCGCCAACACCT  148

Query   98  GCGTGCCCTCCGTCAGCAGCAAGGGCATCATGGAGGAGGATGAGGCCTGCGGGCGCCAGTACACGCTCAAGAAA  171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGTGCCCTCCGTCAGCAGCAAGGGCATCATGGAGGAGGATGAGGCCTGCGGGCGCCAGTACACGCTCAAGAAA  222

Query  172  ACCACCACTTACACCCAGGGGGTGCCCCCCAGCCAAGGTGACCTGGAGTACCAGATGTCCACAACAGCCAGGGC  245
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCACCACTTACACCCAGGGGGTGCCCCCCAGCCAAGGTGATCTGGAGTACCAGATGTCCACAACAGCCAGGGC  296

Query  246  CAAACGGGTGCGGGAGGCCATGTGCCCTGGTGTGTCAGGCGAGGACAGCTCGCTTCTGCTGGCCACCCAGGTGG  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAACGGGTGCGGGAGGCCATGTGCCCTGGTGTGTCAGGCGAGGACAGCTCGCTTCTGCTGGCCACCCAGGTGG  370

Query  320  AGGGGCAGGCCACCAACCTGCAGCGACTGGCCGAGCCGTCCCAGCTGCTCAAGTCGGCCATTGTGCATCTCATC  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGGGCAGGCCACCAACCTGCAGCGACTGGCCGAGCCGTCCCAGCTGCTCAAGTCGGCCATTGTGCATCTCATC  444

Query  394  AACTACCAGGATGATGCCGAGCTGGCCACTCGCGCCCTGCCCGAGCTCACCAAACTGCTCAACGACGAGGACCC  467
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACTACCAGGACGATGCCGAGCTGGCCACTCGCGCCCTGCCCGAGCTCACCAAACTGCTCAACGACGAGGACCC  518

Query  468  GGTGGTGGTGACCAAGGCGGCCATGATTGTGAACCAGCTGTCGAAGAAGGAGGCGTCGCGGCGGGCCCTGATGG  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTGGTGGTGACCAAGGCGGCCATGATTGTGAACCAGCTGTCGAAGAAGGAGGCGTCGCGGCGGGCCCTGATGG  592

Query  542  GCTCGCCCCAGCTGGTGGCCGCTGTCGTGCGTACCATGCAGAATACCAGCGACCTGGACACAGCCCGCTGCACC  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTCGCCCCAGCTGGTGGCCGCTGTCGTGCGTACCATGCAGAATACCAGCGACCTGGACACAGCCCGCTGCACC  666

Query  616  ACCAGCATCCTGCACAACCTCTCCCACCACCGGGAGGGGCTGCTCGCCATCTTCAAGTCGGGTGGCATCCCTGC  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCAGCATCCTGCACAACCTCTCCCACCACCGGGAGGGGCTGCTCGCCATCTTCAAGTCGGGTGGCATCCCTGC  740

Query  690  TCTGGTCCGCATGCTCAGCTCCCCTGTGGAGTCGGTCCTGTTCTATGCCATCACCACGCTGCACAACCTGCTCC  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTGGTCCGCATGCTCAGCTCCCCTGTGGAGTCGGTCCTGTTCTATGCCATCACCACGCTGCACAACCTGCTCC  814

Query  764  TGTACCAGGAGGGCGCCAAGATGGCCGTGCGCCTGGCCGACGGGCTGCAAAAGATGGTGCCCCTGCTCAACAAG  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTACCAGGAGGGCGCCAAGATGGCCGTGCGCCTGGCCGACGGGCTGCAAAAGATGGTGCCCCTGCTCAACAAG  888

Query  838  AACAACCCCAAGTTCCTGGCCATCACCACCGACTGCCTGCAGCTCCTGGCCTACGGCAACCAGGAGAGCAAGCT  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACAACCCCAAGTTCCTGGCCATCACCACCGACTGCCTGCAGCTCCTGGCCTACGGCAACCAGGAGAGCAAGCT  962

Query  912  GATCATCCTGGCCAATGGTGGGCCCCAGGCCCTCGTGCAGATCATGCGTAACTACAGTTATGAAAAGCTGCTCT  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATCATCCTGGCCAATGGTGGGCCCCAGGCCCTCGTGCAGATCATGCGTAACTACAGTTATGAAAAGCTGCTCT  1036

Query  986  GGACCACCAGTCGTGTGCTCAAGGTGCTATCCGTGTGTCCCAGCAATAAGCCTGCCATTGTGGAGGCTGGTGGG  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGACCACCAGTCGTGTGCTCAAGGTGCTATCCGTGTGTCCCAGCAATAAGCCTGCCATTGTGGAGGCTGGTGGG  1110

Query 1060  ATGCAGGCCCTGGGCAAGCACCTGACCAGCAACAGCCCCCGCCTGGTGCAGAACTGCCTGTGGACCCTGCGCAA  1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGCAGGCCCTGGGCAAGCACCTGACCAGCAACAGCCCCCGCCTGGTGCAGAACTGCCTGTGGACCCTGCGCAA  1184

Query 1134  CCTCTCAGATGTGGCCACCAAGCAGGAGGGCCTGGAGAGTGTGCTGAAGATTCTGGTGAATCAGCTGAGTGTGG  1207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTCTCAGATGTGGCCACCAAGCAGGAGGGCCTGGAGAGTGTGCTGAAGATTCTGGTGAATCAGCTGAGTGTGG  1258

Query 1208  ATGACGTCAACGTCCTCACCTGTGCCACGGGCACACTCTCCAACCTGACATGCAACAACAGCAAGAACAAGACG  1281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGACGTCAACGTCCTCACCTGTGCCACGGGCACACTCTCCAACCTGACATGCAACAACAGCAAGAACAAGACG  1332

Query 1282  CTGGTGACACAGAACAGCGGTGTGGAGGCTCTCATCCATGCCATCCTGCGTGCTGGTGACAAGGACGACATCAC  1355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGTGACACAGAACAGCGGTGTGGAGGCTCTCATCCATGCCATCCTGCGTGCTGGTGACAAGGACGACATCAC  1406

Query 1356  GGAGCCTGCCGTCTGCGCTCTGCGCCACCTCACTAGCCGCCACCCTGAGGCCGAGATGGCCCAGAACTCTGTGC  1429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAGCCTGCCGTCTGCGCTCTGCGCCACCTCACTAGCCGCCACCCTGAGGCCGAGATGGCCCAGAACTCTGTGC  1480

Query 1430  GTCTCAACTATGGCATCCCAGCCATCGTGAAGCTGCTCAACCAGCCCAACCAGTGGCCACTGGTCAAGGCAACC  1503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTCTCAACTATGGCATCCCAGCCATCGTGAAGCTGCTCAACCAGCCCAACCAGTGGCCACTGGTCAAGGCAACC  1554

Query 1504  ATCGGCTTGATCAGGAATCTGGCCCTGTGCCCAGCCAACCATGCCCCGCTGCAGGAGGCAGCGGTCATCCCCCG  1577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCGGCTTGATCAGGAATCTGGCCCTGTGCCCAGCCAACCATGCCCCGCTGCAGGAGGCAGCGGTCATCCCCCG  1628

Query 1578  CCTCGTCCAACTGCTGGTGAAGGCCCACCAGGATGCCCAGCGCCACGTAGCTGCAGGCACACAGCAGCCCTACA  1651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCTCGTCCAACTGCTGGTGAAGGCCCACCAGGATGCCCAGCGCCACGTAGCTGCAGGCACACAGCAGCCCTACA  1702

Query 1652  CGGATGGTGTGAGGATGGAGGAGATTGTGGAGGGCTGCACCGGAGCACTGCACATCCTCGCCCGGGACCCCATG  1725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGGATGGTGTGAGGATGGAGGAGATTGTGGAGGGCTGCACCGGAGCACTGCACATCCTCGCCCGGGACCCCATG  1776

Query 1726  AACCGCATGGAGATCTTCCGGCTCAACACCATTCCCCTGTTTGTGCAGCTCCTGTACTCGTCGGTGGAGAACAT  1799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AACCGCATGGAGATCTTCCGGCTCAACACCATTCCCCTGTTTGTGCAGCTCCTGTACTCGTCGGTGGAGAACAT  1850

Query 1800  CCAGCGCGTGGCTGCCGGGGTGCTGTGTGAGCTGGCCCAGGACAAGGAGGCGGCCGACGCCATTGATGCAGAGG  1873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCAGCGCGTGGCTGCCGGGGTGCTGTGTGAGCTGGCCCAGGACAAGGAGGCGGCCGACGCCATTGATGCAGAGG  1924

Query 1874  GGGCCTCGGCCCCACTCATGGAGTTGCTGCACTCCCGCAACGAGGGCACTGCCACCTACGCTGCTGCCGTCCTG  1947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGGCCTCGGCCCCACTCATGGAGTTGCTGCACTCCCGCAACGAGGGCACTGCCACCTACGCTGCTGCCGTCCTG  1998

Query 1948  TTCCGCATCTCCGAGGACAAGAACCCAGACTACCGGAAGCGCGTGTCCGTGGAGCTCACCAACTCCCTCTTCAA  2021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTCCGCATCTCCGAGGACAAGAACCCAGACTACCGGAAGCGCGTGTCCGTGGAGCTCACCAACTCCCTCTTCAA  2072

Query 2022  GCATGACCCGGCTGCCTGGGAGGCTGCCCAGAGCATGATTCCCATCAATGAGCCCTATGGAGATGACTTGGATG  2095
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2073  GCATGACCCGGCTGCCTGGGAGGCTGCCCAGAGCATGATTCCCATCAATGAGCCCTATGGAGATGACATGGATG  2146

Query 2096  CCACCTACCGCCCCATGTACTCCAGCGATGTGCCCCTTGACCCGCTGGAGATGCACATGGACATGGATGGAGAC  2169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCACCTACCGCCCCATGTACTCCAGCGATGTGCCCCTTGACCCGCTGGAGATGCACATGGACATGGATGGAGAC  2220

Query 2170  TACCCCATCGACACCTACAGCGACGGCCTCAGGCCCCCGTACCCCACTGCAAACCACATGCTGGCC  2235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2221  TACCCCATCGACACCTACAGCGACGGCCTCAGGCCCCCGTACCCCACTGCAGACCACATGCTGGCC  2286