Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06502
• Subject: NM_008466.5
• Aligned Length: 1563
• Identities: 1458
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCGAGAACCCCAGCTTGGAGAACCACCGCATCAAGAGCTTCAAGAACAAGGGCCGCGATGTGGAAACAAT  74
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGCCGAGAACCCCGGCTTGGAGAACCACCGCATCAAGAGCTTCAAGAACAAGGGCCGCGATGTGGAGACGAT  74

Query   75  GCGAAGACATAGAAATGAAGTGACAGTGGAACTGCGGAAGAACAAAAGAGATGAACACTTATTGAAAAAGAGAA  148
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct   75  GCGAAGACACAGAAATGAAGTGACAGTTGAACTCCGGAAGAACAAAAGAGACGAACACTTACTGAAAAAGAGAA  148

Query  149  ATGTTCCCCAAGAAGAAAGTCTAGAAGATTCAGATGTTGATGCTGATTTTAAAGCACAAAATGTAACCCTAGAA  222
            |||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  ATGTTCCCCAAGAAGAAAGCTTAGAAGATTCAGATGTTGATGCTGATTTTAAAGCACAAAATGTAACACTAGAA  222

Query  223  GCTATATTGCAGAATGCCACAAGTGATAACCCAGTGGTCCAATTGAGTGCTGTCCAGGCAGCAAGAAAACTGTT  296
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  223  GCTATATTACAGAATGCCACAAGTGATAATCCTGTAGTCCAGTTGAGTGCTGTGCAGGCAGCAAGGAAACTATT  296

Query  297  ATCCAGTGACAGAAATCCACCGATTGATGACTTAATAAAATCTGGGATTTTACCAATTCTAGTCAAATGTCTAG  370
            |||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCCAGTGACAGAAATCCACCAATTGATGACCTAATAAAATCTGGGATTTTACCAATTCTAGTCAAATGTCTAG  370

Query  371  AAAGGGATGATAATCCTTCATTACAGTTTGAAGCTGCTTGGGCATTAACTAACATAGCATCAGGAACTTCTGCA  444
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  AAAGAGATGATAATCCTTCATTACAGTTTGAAGCTGCTTGGGCACTAACTAATATAGCATCGGGAACTTCTGCA  444

Query  445  CAGACTCAAGATATTGTGCAGTCTAATGCAGTACCTCTTTTTCTGAGACTTCTTCGTTCACCACATCAGAATGT  518
            ||||||||||.|.||||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.|.|||.||||||||||||||
Sbjct  445  CAGACTCAAGCTGTTGTACAGTCTAATGCAGTACCACTTTTTCTGCGACTCCTCCATTCCCCACATCAGAATGT  518

Query  519  TTGTGAACAAGCAGTATGGGCTTTGGGAAACATTATAGGTGATGGTCCTCAATGTAGAGATTATGTCATATCAC  592
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTGTGAACAAGCGGTGTGGGCTTTGGGAAACATTATAGGTGATGGTCCTCAATGTAGAGATTATGTCATATCAC  592

Query  593  TGGGAGTTGTCAAACCTCTTCTGTCCTTCATCAGTCCCTCCATCCCCATCACCTTCCTTCGGAACGTCACATGG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGGAGTTGTCAAACCTCTTCTGTCCTTCATCAATCCCTCCATTCCCATCACCTTCCTTCGGAACGTCACATGG  666

Query  667  GTCATTGTCAATCTCTGCAGGAATAAGGATCCCCCACCGCCTATGGAGACAGTTCAGGAGATTTTGCCAGCTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCATTGTCAATCTCTGCAGGAATAAAGACCCCCCACCGCCTATGGAGACAGTTCAGGAGATTTTGCCAGCTTT  740

Query  741  ATGTGTCCTCATATACCATACAGATATAAACATTCTTGTAGACACTGTTTGGGCTCTGTCATACTTGACAGATG  814
            .|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  741  GTGTGTGCTCATCTACCATACGGACATAAATATTCTTGTAGACACTGTTTGGGCGCTGTCATACTTGACAGACG  814

Query  815  GAGGTAATGAACAGATACAGATGGTTATTGATTCAGGAGTTGTGCCCTTTCTTGTGCCCCTTCTGAGCCATCAG  888
            |.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  815  GGGGAAATGAGCAAATACAGATGGTTATTGATTCAGGGGTTGTACCCTTCCTCGTACCCCTTCTGAGCCACCAG  888

Query  889  GAAGTCAAAGTTCAAACAGCAGCCCTCAGAGCAGTTGGCAACATAGTGACTGGCACCGACGAGCAGACCCAGGT  962
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGTCAAAGTTCAAACTGCAGCACTCAGAGCGGTTGGGAACATAGTGACTGGCACTGATGAGCAGACCCAGGT  962

Query  963  TGTTCTCAATTGTGATGTCCTGTCACACTTCCAAAATCTCTTATCACACCCAAAAGAGAAGATAAATAAGGAAG  1036
            .||||||||.||||||||||||||.|||||||.|||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  GGTTCTCAACTGTGATGTCCTGTCCCACTTCCCAAACCTCTTGTCACACCCAAAAGAGAAAATAAATAAGGAAG  1036

Query 1037  CAGTGTGGTTCCTTTCCAACATAACAGCAGGCAACCAGCAACAAGTTCAAGCTGTAATAGATGCTGGATTAATT  1110
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1037  CAGTATGGTTCCTTTCCAATATAACAGCAGGCAATCAGCAGCAAGTTCAAGCTGTAATAGATGCTGGGTTAATC  1110

Query 1111  CCTATGATAATTCATCAGCTTGCTAAGGGGGACTTTGGAACACAAAAAGAAGCTGCTTGGGCAATCAGCAACTT  1184
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  CCTATGATTATTCATCAGCTCGCTAAGGGGGACTTTGGAACACAAAAGGAAGCTGCTTGGGCAATTAGCAACTT  1184

Query 1185  AACAATAAGTGGCAGAAAAGATCAGGTTGAGTACCTTGTACAGCAGGATGTAATACCACCGTTCTGTAATTTAC  1258
            |||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185  AACGATAAGTGGCAGAAAAGATCAAGTTGAATACCTTGTACAGCAGAACGTAATACCACCATTCTGTAACTTAC  1258

Query 1259  TGTCAGTGAAAGATTCTCAAGTGGTTCAGGTGGTTCTAGATGGTCTAAAAAACATTCTGATAATGGCCGGTGAT  1332
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259  TGTCAGTAAAAGATTCTCAAGTGGTGCAGGTGGTTCTAGATGGTCTTAAAAACATCCTGATAATGGCTGGTGAT  1332

Query 1333  GAAGCAAGCACAATAGCTGAAATAATAGAGGAATGTGGAGGTTTGGAGAAAATTGAAGTTTTACAGCAACATGA  1406
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  GAAGCAAGCACAATAGCTGAGATCATAGAAGAGTGTGGAGGTTTGGAGAAAATTGAAGTTTTGCAGCAACATGA  1406

Query 1407  AAATGAAGACATATATAAATTAGCATTTGAAATCATAGATCAGTATTTCTCTGGTGATGATATTGATGAAGATC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAATGAAGACATATATAAATTAGCATTTGAAATCATAGATCAATATTTCTCTGGTGATGATATTGATGAAGATC  1480

Query 1481  CCTGCCTCATTCCTGAAGCAACACAAGGAGGTACCTACAATTTTGATCCAACAGCCAACCTTCAAACAAAAGAA  1554
            |..||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTAGCCTCATTCCAGAAGCAACACAAGGAGGTACTTACAATTTTGACCCAACAGCCAACCTTCAAACAAAAGAA  1554

Query 1555  TTTAATTTT  1563
            ||||||||.
Sbjct 1555  TTTAATTTC  1563