Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06603
Subject:
NM_001204291.1
Aligned Length:
792
Identities:
695
Gaps:
96

Alignment

Query   1  ATGACACCGGGCACCCAGTCTCCTTTCTTCCTGCTGCTGCTCCTCACAGTGCTT--------------------  54
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct   1  ATGACACCGGGCACCCAGTCTCCTTTCTTCCTGCTGCTGCTCCTCACAGTGCTTACAGCTACCACAGCCCCTAA  74

Query  55  -------ACAGTTGTTACAGGTTCTGGTCATGCAAGCTCTACCCCAGGTGGAGAAAAGGAGACTTCGGCTACCC  121
                  |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ACCCGCAACAGTTGTTACGGGTTCTGGTCATGCAAGCTCTACCCCAGGTGGAGAAAAGGAGACTTCGGCTACCC  148

Query 122  AGAGAAGTTCAGTGCCCAGCTCTACTGAGAAGAATGCTTTTAATTCCTCTCTGGAAGATCCCAGCACCGACTAC  195
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct 149  AGAGAAGTTCAGTGCCCAGCTCTACTGAGAAGAATGCT------------------------------------  186

Query 196  TACCAAGAGCTGCAGAGAGACATTTCTGAAATGTTTTTGCAGATTTATAAACAAGGGGGTTTTCTGGGCCTCTC  269
                                            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187  ---------------------------------TTTTTGCAGATTTATAAACAAGGGGGTTTTCTGGGCCTCTC  227

Query 270  CAATATTAAGTTCAGGCCAGGATCTGTGGTGGTACAATTGACTCTGGCCTTCCGAGAAGGTACCATCAATGTCC  343
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 228  CAATATTAAGTTCAGGCCAGGATCTGTGGTGGTACAATTGACTCTGGCCTTCCGAGAAGGTACCATCAATGTCC  301

Query 344  ACGACGTGGAGACACAGTTCAATCAGTATAAAACGGAAGCAGCCTCTCGATATAACCTGACGATCTCAGACGTC  417
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302  ACGACGTGGAGACACAGTTCAATCAGTATAAAACGGAAGCAGCCTCTCGATATAACCTGACGATCTCAGACGTC  375

Query 418  AGCGTGAGTGATGTGCCATTTCCTTTCTCTGCCCAGTCTGGGGCTGGGGTGCCAGGCTGGGGCATCGCGCTGCT  491
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376  AGCGTGAGTGATGTGCCATTTCCTTTCTCTGCCCAGTCTGGGGCTGGGGTGCCAGGCTGGGGCATCGCGCTGCT  449

Query 492  GGTGCTGGTCTGTGTTCTGGTTGCGCTGGCCATTGTCTATCTCATTGCCTTGGCTGTCTGTCAGTGCCGCCGAA  565
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 450  GGTGCTGGTCTGTGTTCTGGTTGCGCTGGCCATTGTCTATCTCATTGCCTTGGCTGTCTGTCAGTGCCGCCGAA  523

Query 566  AGAACTACGGGCAGCTGGACATCTTTCCAGCCCGGGATACCTACCATCCTATGAGCGAGTACCCCACCTACCAC  639
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524  AGAACTACGGGCAGCTGGACATCTTTCCAGCCCGGGATACCTACCATCCTATGAGCGAGTACCCCACCTACCAC  597

Query 640  ACCCATGGGCGCTATGTGCCCCCTAGCAGTACCGATCGTAGCCCCTATGAGAAGGTTTCTGCAGGTAATGGTGG  713
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598  ACCCATGGGCGCTATGTGCCCCCTAGCAGTACCGATCGTAGCCCCTATGAGAAGGTTTCTGCAGGTAATGGTGG  671

Query 714  CAGCAGCCTCTCTTACACAAACCCAGCAGTGGCAGCCACTTCTGCCAACTTG  765
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672  CAGCAGCCTCTCTTACACAAACCCAGCAGTGGCAGCCACTTCTGCCAACTTG  723