Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06619
Subject:
NM_001127651.3
Aligned Length:
1578
Identities:
1575
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGTCCCTGGTGGAGGCCATCAGCCTCTGGAATGAAGGGGTGCTGGCAGCGGACAAGAAGGACTGGAAGGGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCTGGTGGAGGCCATCAGCCTCTGGAATGAAGGGGTGCTGGCAGCGGACAAGAAGGACTGGAAGGGAGC  74

Query   75  CCTGGATGCCTTCAGTGCCGTCCAGGACCCCCACTCCCGGATTTGCTTCAACATTGGCTGCATGTACACTATCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGATGCCTTCAGTGCCGTCCAGGACCCCCACTCCCGGATTTGCTTCAACATTGGCTGCATGTACACTATCC  148

Query  149  TGAAGAACATGACTGAAGCAGAGAAGGCCTTTACCAGAAGCATTAACCGAGACAAGCACTTGGCAGTGGCTTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAAGAACATGACTGAAGCAGAGAAGGCCTTTACCAGAAGCATTAACCGAGACAAGCACTTGGCAGTGGCTTAC  222

Query  223  TTCCAACGAGGGATGCTCTACTACCAGACAGAGAAATATGATTTGGCTATCAAAGACCTTAAAGAAGCCTTGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCAACGAGGGATGCTCTACTACCAGACAGAGAAATATGATTTGGCTATCAAAGACCTTAAAGAAGCCTTGAT  296

Query  297  TCAGCTTCGAGGGAACCAGCTGATAGACTATAAGATCCTGGGGCTCCAGTTCAAGCTGTTTGCCTGTGAGGTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCAGCTTCGAGGGAACCAGCTGATAGACTATAAGATCCTGGGGCTCCAGTTCAAGCTGTTTGCCTGTGAGGTGT  370

Query  371  TATATAACATTGCTTTCATGTATGCCAAGAAGGAGGAATGGAAAAAAGCTGAAGAACAGTTAGCATTGGCCACG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATATAACATTGCTTTCATGTATGCCAAGAAGGAGGAATGGAAAAAAGCTGAAGAACAGTTAGCATTGGCCACG  444

Query  445  AGCATGAAGTCTGAGCCCAGACATTCCAAAATCGACAAGGCGATGGAGTGTGTCTGGAAGCAGAAGCTATATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCATGAAGTCTGAGCCCAGACATTCCAAAATCGACAAGGCGATGGAGTGTGTCTGGAAGCAGAAGCTATATGA  518

Query  519  GCCAGTGGTGATCCCTGTGGGCAGGCTGTTTCGACCAAATGAGAGACAAGTGGCTCAGCTGGCCAAGAAGGATT  592
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCAGTGGTGATCCCTGTGGGCAAGCTGTTTCGACCAAATGAGAGACAAGTGGCTCAGCTGGCCAAGAAGGATT  592

Query  593  ACCTAGGCAAGGCAACGGTCGTGGCATCTGTGGTGGATCAAGACAGTTTCTCTGGGTTTGCCCCTCTGCAACCA  666
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTAGGCAAGGCGACGGTCGTGGCATCTGTGGTGGATCAAGACAGTTTCTCTGGGTTTGCCCCTCTGCAACCA  666

Query  667  CAGGCAGCTGAGCCTCCACCCAGACCGAAAACCCCAGAGATCTTCAGGGCTCTGGAAGGGGAGGCTCACCGTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGCAGCTGAGCCTCCACCCAGACCGAAAACCCCAGAGATCTTCAGGGCTCTGGAAGGGGAGGCTCACCGTGT  740

Query  741  GCTATTTGGGTTTGTGCCTGAGACAAAAGAAGAGCTCCAGGTCATGCCAGGGAACATTGTCTTTGTCTTGAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTATTTGGGTTTGTGCCTGAGACAAAAGAAGAGCTCCAGGTCATGCCAGGGAACATTGTCTTTGTCTTGAAGA  814

Query  815  AGGGCAATGATAACTGGGCCACGGTCATGTTCAACGGGCAGAAGGGGCTTGTTCCCTGCAACTACCTTGAACCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGGCAATGATAACTGGGCCACGGTCATGTTCAACGGGCAGAAGGGGCTTGTTCCCTGCAACTACCTTGAACCA  888

Query  889  GTTGAGCTGCGGATCCACCCTCAGCAGCAGCCCCAGGAGGAAAGCTCTCCGCAGTCCGACATCCCAGCTCCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTGAGCTGCGGATCCACCCTCAGCAGCAGCCCCAGGAGGAAAGCTCTCCGCAGTCCGACATCCCAGCTCCTCC  962

Query  963  TAGTTCCAAAGCCCCTGGAAGACCCCAGCTGTCACCAGGCCAGAAACAAAAAGAAGAGCCTAAGGAAGTGAAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAGTTCCAAAGCCCCTGGAAGACCCCAGCTGTCACCAGGCCAGAAACAAAAAGAAGAGCCTAAGGAAGTGAAGC  1036

Query 1037  TCAGTGTTCCCATGCCCTACACACTCAAGGTGCACTACAAGTACACGGTAGTCATGAAGACTCAGCCCGGGCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAGTGTTCCCATGCCCTACACACTCAAGGTGCACTACAAGTACACGGTAGTCATGAAGACTCAGCCCGGGCTC  1110

Query 1111  CCCTACAGCCAGGTCCGGGACATGGTGTCTAAGAAACTGGAGCTCCGGCTGGAACAAACTAAGCTGAGCTATCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCTACAGCCAGGTCCGGGACATGGTGTCTAAGAAACTGGAGCTCCGGCTGGAACACACTAAGCTGAGCTATCG  1184

Query 1185  GCCTCGGGACAGCAATGAGCTGGTGCCCCTTTCAGAAGACAGCATGAAGGATGCCTGGGGCCAGGTGAAAAACT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCTCGGGACAGCAATGAGCTGGTGCCCCTTTCAGAAGACAGCATGAAGGATGCCTGGGGCCAGGTGAAAAACT  1258

Query 1259  ACTGCCTGACTCTGTGGTGTGAGAACACAGTGGGTGACCAAGGCTTTCCAGATGAACCCAAGGAAAGTGAAAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTGCCTGACTCTGTGGTGTGAGAACACAGTGGGTGACCAAGGCTTTCCAGATGAACCCAAGGAAAGTGAAAAA  1332

Query 1333  GCTGATGCTAATAACCAGACAACAGAACCTCAGCTTAAGAAAGGCAGCCAAGTGGAGGCACTCTTCAGTTATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTGATGCTAATAACCAGACAACAGAACCTCAGCTTAAGAAAGGCAGCCAAGTGGAGGCACTCTTCAGTTATGA  1406

Query 1407  GGCTACCCAACCAGAGGACCTGGAGTTTCAGGAAGGGGATATAATCCTGGTGTTATCAAAGGTGAATGAAGAAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCTACCCAACCAGAGGACCTGGAGTTTCAGGAAGGGGATATAATCCTGGTGTTATCAAAGGTGAATGAAGAAT  1480

Query 1481  GGCTGGAAGGGGAGTGCAAAGGGAAGGTGGGCATTTTCCCCAAAGTTTTTGTTGAAGACTGCGCAACTACAGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCTGGAAGGGGAGTGCAAAGGGAAGGTGGGCATTTTCCCCAAAGTTTTTGTTGAAGACTGCGCAACTACAGAT  1554

Query 1555  TTGGAAAGCACTCGGAGAGAAGTC  1578
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTGGAAAGCACTCGGAGAGAAGTC  1578