Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06619
• Subject: XM_005245207.1
• Aligned Length: 1578
• Identities: 1469
• Gaps: 108

Alignment

Query    1  ATGTCCCTGGTGGAGGCCATCAGCCTCTGGAATGAAGGGGTGCTGGCAGCGGACAAGAAGGACTGGAAGGGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCTGGTGGAGGCCATCAGCCTCTGGAATGAAGGGGTGCTGGCAGCGGACAAGAAGGACTGGAAGGGAGC  74

Query   75  CCTGGATGCCTTCAGTGCCGTCCAGGACCCCCACTCCCGGATTTGCTTCAACATTGGCTGCATGTACACTATCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGATGCCTTCAGTGCCGTCCAGGACCCCCACTCCCGGATTTGCTTCAACATTGGCTGCATGTACACTATCC  148

Query  149  TGAAGAACATGACTGAAGCAGAGAAGGCCTTTACCAGAAGCATTAACCGAGACAAGCACTTGGCAGTGGCTTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAAGAACATGACTGAAGCAGAGAAGGCCTTTACCAGAAGCATTAACCGAGACAAGCACTTGGCAGTGGCTTAC  222

Query  223  TTCCAACGAGGGATGCTCTACTACCAGACAGAGAAATATGATTTGGCTATCAAAGACCTTAAAGAAGCCTTGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCAACGAGGGATGCTCTACTACCAGACAGAGAAATATGATTTGGCTATCAAAGACCTTAAAGAAGCCTTGAT  296

Query  297  TCAGCTTCGAGGGAACCAGCTGATAGACTATAAGATCCTGGGGCTCCAGTTCAAGCTGTTTGCCTGTGAGGTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCAGCTTCGAGGGAACCAGCTGATAGACTATAAGATCCTGGGGCTCCAGTTCAAGCTGTTTGCCTGTGAGGTGT  370

Query  371  TATATAACATTGCTTTCATGTATGCCAAGAAGGAGGAATGGAAAAAAGCTGAAGAACAGTTAGCATTGGCCACG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATATAACATTGCTTTCATGTATGCCAAGAAGGAGGAATGGAAAAAAGCTGAAGAACAGTTAGCATTGGCCACG  444

Query  445  AGCATGAAGTCTGAGCCCAGACATTCCAAAATCGACAAGGCGATGGAGTGTGTCTGGAAGCAGAAGCTATATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  445  AGCATGAAGTCTGAGCCCAGACATTCCAAAATCGACAAGGCGATGGAGTGTGTCTG------------------  500

Query  519  GCCAGTGGTGATCCCTGTGGGCAGGCTGTTTCGACCAAATGAGAGACAAGTGGCTCAGCTGGCCAAGAAGGATT  592
                                                                                      
Sbjct  501  --------------------------------------------------------------------------  500

Query  593  ACCTAGGCAAGGCAACGGTCGTGGCATCTGTGGTGGATCAAGACAGTTTCTCTGGGTTTGCCCCTCTGCAACCA  666
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  ----------------GGTCGTGGCATCTGTGGTGGATCAAGACAGTTTCTCTGGGTTTGCCCCTCTGCAACCA  558

Query  667  CAGGCAGCTGAGCCTCCACCCAGACCGAAAACCCCAGAGATCTTCAGGGCTCTGGAAGGGGAGGCTCACCGTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  CAGGCAGCTGAGCCTCCACCCAGACCGAAAACCCCAGAGATCTTCAGGGCTCTGGAAGGGGAGGCTCACCGTGT  632

Query  741  GCTATTTGGGTTTGTGCCTGAGACAAAAGAAGAGCTCCAGGTCATGCCAGGGAACATTGTCTTTGTCTTGAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  GCTATTTGGGTTTGTGCCTGAGACAAAAGAAGAGCTCCAGGTCATGCCAGGGAACATTGTCTTTGTCTTGAAGA  706

Query  815  AGGGCAATGATAACTGGGCCACGGTCATGTTCAACGGGCAGAAGGGGCTTGTTCCCTGCAACTACCTTGAACCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  AGGGCAATGATAACTGGGCCACGGTCATGTTCAACGGGCAGAAGGGGCTTGTTCCCTGCAACTACCTTGAACCA  780

Query  889  GTTGAGCTGCGGATCCACCCTCAGCAGCAGCCCCAGGAGGAAAGCTCTCCGCAGTCCGACATCCCAGCTCCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GTTGAGCTGCGGATCCACCCTCAGCAGCAGCCCCAGGAGGAAAGCTCTCCGCAGTCCGACATCCCAGCTCCTCC  854

Query  963  TAGTTCCAAAGCCCCTGGAAGACCCCAGCTGTCACCAGGCCAGAAACAAAAAGAAGAGCCTAAGGAAGTGAAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  TAGTTCCAAAGCCCCTGGAAGACCCCAGCTGTCACCAGGCCAGAAACAAAAAGAAGAGCCTAAGGAAGTGAAGC  928

Query 1037  TCAGTGTTCCCATGCCCTACACACTCAAGGTGCACTACAAGTACACGGTAGTCATGAAGACTCAGCCCGGGCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  TCAGTGTTCCCATGCCCTACACACTCAAGGTGCACTACAAGTACACGGTAGTCATGAAGACTCAGCCCGGGCTC  1002

Query 1111  CCCTACAGCCAGGTCCGGGACATGGTGTCTAAGAAACTGGAGCTCCGGCTGGAACAAACTAAGCTGAGCTATCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1003  CCCTACAGCCAGGTCCGGGACATGGTGTCTAAGAAACTGGAGCTCCGGCTGGAACACACTAAGCTGAGCTATCG  1076

Query 1185  GCCTCGGGACAGCAATGAGCTGGTGCCCCTTTCAGAAGACAGCATGAAGGATGCCTGGGGCCAGGTGAAAAACT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  GCCTCGGGACAGCAATGAGCTGGTGCCCCTTTCAGAAGACAGCATGAAGGATGCCTGGGGCCAGGTGAAAAACT  1150

Query 1259  ACTGCCTGACTCTGTGGTGTGAGAACACAGTGGGTGACCAAGGCTTTCCAGATGAACCCAAGGAAAGTGAAAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  ACTGCCTGACTCTGTGGTGTGAGAACACAGTGGGTGACCAAGGCTTTCCAGATGAACCCAAGGAAAGTGAAAAA  1224

Query 1333  GCTGATGCTAATAACCAGACAACAGAACCTCAGCTTAAGAAAGGCAGCCAAGTGGAGGCACTCTTCAGTTATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225  GCTGATGCTAATAACCAGACAACAGAACCTCAGCTTAAGAAAGGCAGCCAAGTGGAGGCACTCTTCAGTTATGA  1298

Query 1407  GGCTACCCAACCAGAGGACCTGGAGTTTCAGGAAGGGGATATAATCCTGGTGTTATCAAAGGTGAATGAAGAAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299  GGCTACCCAACCAGAGGACCTGGAGTTTCAGGAAGGGGATATAATCCTGGTGTTATCAAAGGTGAATGAAGAAT  1372

Query 1481  GGCTGGAAGGGGAGTGCAAAGGGAAGGTGGGCATTTTCCCCAAAGTTTTTGTTGAAGACTGCGCAACTACAGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373  GGCTGGAAGGGGAGTGCAAAGGGAAGGTGGGCATTTTCCCCAAAGTTTTTGTTGAAGACTGCGCAACTACAGAT  1446

Query 1555  TTGGAAAGCACTCGGAGAGAAGTC  1578
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447  TTGGAAAGCACTCGGAGAGAAGTC  1470