Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06654
- Subject:
- NM_008722.3
- Aligned Length:
- 885
- Identities:
- 798
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGGAAGATTCGATGGACATGGACATGAGCCCCCTGAGGCCCCAGAACTATCTTTTCGGTTGTGAACTAAAGGC 74
||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAGACTCGATGGATATGGACATGAGTCCTCTTAGGCCTCAGAACTACCTTTTCGGCTGTGAACTAAAGGC 74
Query 75 CGACAAAGATTATCACTTTAAGGTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTATCTTTAAGAACGGTCAGTTTAG 148
.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGACAAAGACTATCACTTTAAAGTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTGTCATTAAGAACGGTCAGTTTAG 148
Query 149 GGGCTGGTGCAAAGGATGAGTTGCACATTGTTGAAGCAGAGGCAATGAATTACGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA 222
|.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAGCAGGGGCAAAAGATGAGTTACACATCGTAGAGGCAGAAGCAATGAACTATGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA 222
Query 223 ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAGCCAACGGTTTCCCTTGGGGGCTTTGAAATAACACCACCAGTGGT 296
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 223 ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAACCAACAGTTTCCCTAGGGGGCTTTGAAATTACACCACCTGTGGT 296
Query 297 CTTAAGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCAGTGCATATTAGTGGACAGCACTTAGTAGCTGTGGAGGAAGATGCAG 370
||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 CTTACGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCTGTGCACATTAGTGGACAGCATCTAGTAGCTGTAGAGGAAGATGCAG 370
Query 371 AGTCAGAAGATGAAGAGGAGGAGGATGTGAAACTCTTAAGTATATCTGGAAAGCGGTCTGCCCCTGGAGGTGGT 444
||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 371 AGTCTGAAGATGAAGATGAGGAGGACGTAAAACTCTTAGGCATGTCTGGAAAGCGATCTGCTCCTGGAGGTGGT 444
Query 445 AGCAAGGTTCCGCAGAAAAAAGTAAAACTTGCTGCTGATGAAGATGAT---GACGATGATGATGAAGAGGATGA 515
|.|||||||||.||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 445 AACAAGGTTCCACAGAAAAAAGTAAAACT------TGATGAAGATGATGAGGACGATGATGAGGACGATGAGGA 512
Query 516 TGATGAAGATGATGATGATGATGATTTTGATGATGAGGAAGCTGAAGAAAAAGCGCCAGTGAAGAAATCTATAC 589
||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|..|||||||||||||||.|||
Sbjct 513 TGATGAGGATGATGATGATGATGATTTTGATGAAGAGGAAACTGAAGAAAAGGTCCCAGTGAAGAAATCTGTAC 586
Query 590 GAGATACTCCAGCCAAAAATGCACAAAAGTCAAATCAGAATGGAAAAGACTCAAAACCATCATCAACACCAAGA 663
|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||||| ||||||||||.|||
Sbjct 587 GAGATACCCCAGCCAAAAATGCACAAAAATCAAACCAAAATGGAAAAGACTTAAAAC---CATCAACACCGAGA 657
Query 664 TCAAAAGGACAAGAATCCTTCAAGAAACAGGAAAAAACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGA 737
|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 TCAAAGGGTCAAGAGTCCTTCAAAAAACAGGAAAAGACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGA 731
Query 738 CATTAAAGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGTGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAATTCATCAATT 811
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 732 CATTAAGGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGCGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAGTTCATTAATT 805
Query 812 ATGTGAAGAATTGCTTCCGGATGACTGACCAAGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAGTCTCTT 882
|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 806 ATGTGAAGAATTGTTTCCGGATGACTGACCAGGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAATCTCTT 876