Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06660
• Subject: NM_001243101.1
• Aligned Length: 836
• Identities: 538
• Gaps: 243

Alignment

Query   1  MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQDSGNSNGNASINIT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQDSGNSNGNASINIT  74

Query  75  DISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQ  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  DISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQ  148

Query 149  TLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVR  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVR  222

Query 223  EGDNAVITCNGSGSPLPDVDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNAS  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  EGDNAVITCNGSGSPLPDVDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNAS  296

Query 297  VALTVYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISEGCLLFNKPTH  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  VALTVYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISEGCLLFNKPTH  370

Query 371  YNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACV  444
           |||||||||||||||||||||||||||||||        .||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  YNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFP--------VDEVSPTPPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACV  436

Query 445  LLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFR  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437  LLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFR  510

Query 519  QGHNCHKPDTWVFSNIDNHGIL-------------------NLKDNRDHLVPSTHYIYEEPEV-------QSGE  566
           ||||||||||.| ..|....|.                   ||....|......... ..|..       ...|
Sbjct 511  QGHNCHKPDTYV-QHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKAL-KDPTLAARKDFQREAE  582

Query 567  VSYPRSHGFREIMLNPISLPGHSKPL-------NHGIYVEDVNVYFSKGRHGF---------------------  612
           ......|   |.........|...||       .||    |.|....  .||.                     
Sbjct 583  LLTNLQH---EHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHG----DLNKFLR--AHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQ  647

Query 613  --------------------------------------------------------------------------  612
                                                                                     
Sbjct 648  MLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIM  721

Query 613  --------------------------------------------------------------------------  612
                                                                                     
Sbjct 722  YRKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNI  795

Query 613  ----------------------  612
                                 
Sbjct 796  KEIYKILHALGKATPIYLDILG  817