Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06660
- Subject:
- NM_008746.5
- Aligned Length:
- 2526
- Identities:
- 1607
- Gaps:
- 741
Alignment
Query 1 ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA 74
Query 75 TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG 148
Query 149 ATGGGAACCTCTTCCCCCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGTATCAACATCACG 222
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 149 ATGGGAACCTCTTCCCTCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGCATCAACATTACG 222
Query 223 GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGCAGTCTTCACACGCTCAACGCCGTGGACAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 223 GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGAGGCCTGCACACACTCAATGCTGTGGACAT 296
Query 297 GGAGCTCTACACCGGACTTCAAAAGCTGACCATCAAGAACTCAGGACTTCGGAGCATTCAGCCCAGAGCCTTTG 370
||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|
Sbjct 297 GGAGCTCTACACGGGACTCCAGAAGCTGACCATCAAGAATTCTGGACTCCGGAACATCCAGCCCAGAGCCTTCG 370
Query 371 CCAAGAACCCCCATTTGCGTTATATAAACCTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCGTGGCAGCTCTTCCAG 444
|||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CCAAGAACCCCCACTTGCGTTATATAAACTTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCCTGGCAGCTCTTCCAG 444
Query 445 ACGCTGAGTCTTCGGGAATTGCAG-TTGGAGCAGAACTTTTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGC 517
||||||||.|||||||||||| || .|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACGCTGAGCCTTCGGGAATTG-AGACTGGAGCAGAACTTCTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGC 517
Query 518 TCTGGCAGGAGCAGGGGGAGGCCAAGCTCAACAGCCAGAACCTCTACTGCATCAACGCTGATGGCTCCCAGCTT 591
|.||||||||.|||||||||||...|||..|||||||||.|||.||||||||||..||||||||||||||.||.
Sbjct 518 TGTGGCAGGAACAGGGGGAGGCGCGGCTGGACAGCCAGAGCCTTTACTGCATCAGTGCTGATGGCTCCCAACTC 591
Query 592 CCTCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGACCTTCCTGAGATCAGCGTGAGCCACGTCAACCTGACCGTACG 665
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 592 CCCCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGATCTCCCAGAGATCAGTGTGAGCCACGTCAACCTGACTGTCCG 665
Query 666 AGAGGGTGACAATGCTGTTATCACTTGCAATGGCTCTGGATCACCCCTTCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTG 739
|||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 AGAAGGAGACAATGCCGTGATCACTTGCAATGGCTCTGGCTCTCCTTTGCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTG 739
Query 740 GGCTGCAGTCCATCAACACTCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTTCATGCCATCAACTTGACGCTGGTG 813
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 740 GGCTGCAGTCCATCAACACCCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTACATGCCATCAACTTGACCCTGGTG 813
Query 814 AATGTGACGAGTGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAG 887
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AACGTGACGAGCGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAG 887
Query 888 TGTTGCCCTCACTGTCTACTATCCCCCACGTGTGGTGAGCCTGGAGGAGCCTGAGCTGCGCCTGGAGCACTGCA 961
||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|.||||||||.||.||||
Sbjct 888 TGTTGCTCTCACTGTCTACTACCCTCCACGTGTGGTGAGCCTGGTGGAGCCTGAGGTACGCCTGGAACATTGCA 961
Query 962 TCGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCCCCACCAACGCTGCACTGGCTGCACAATGGGCAGCCTCTGCGGGAGTCC 1035
|.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||||||.|||||||.|||||..||.||||||||
Sbjct 962 TTGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCGACACCCACGCTCCACTGGCTGTACAATGGACAGCCATTGAGGGAGTCC 1035
Query 1036 AAGATCATCCATGTGGAATACTACCAAGAGGGAGAGATTTCCGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCA 1109
||||||||.||..||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 AAGATCATTCACATGGACTACTACCAGGAGGGGGAGGTCTCAGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCA 1109
Query 1110 CTACAACAATGGCAACTATACCCTCATTGCCAAAAACCCACTGGGCACAGCCAACCAGACCATCAATGGCCACT 1183
||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||..|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1110 CTACAACAATGGCAACTACACCCTCATTGCTAAGAATGCCCTGGGCACGGCCAACCAGACCATCAACGGCCACT 1183
Query 1184 TCCTCAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACGGATAACTTTATCTTGTTTGA---CGAAGTGAGTCCCACACCTCCT 1254
||||.|||||||||||||||||||||||.|||..||||..| ||||| .||.|.|||.||.|||||||||
Sbjct 1184 TCCTGAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACAGATTTCTTTGAC---TTTGAGTCTGATGCGAGCCCTACACCTCCT 1254
Query 1255 ATCACTGTGACCCACAAACCAGAAGAAGACACTTTTGGGGTATCCATAGCAGTTGGACTTGCTGCTTTTGCCTG 1328
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1255 ATCACTGTGACCCACAAACCAGAGGAAGACACTTTTGGGGTGTCCATAGCAGTCGGACTTGCTGCCTTTGCCTG 1328
Query 1329 TGTCCTGTTGGTGGTTCTCTTCGTCATGATCAACAAATATGGTCGACGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCCG 1402
.|||||..|||||||||||||..|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1329 CGTCCTTCTGGTGGTTCTCTTTATCATGATCAACAAGTATGGTCGCCGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCTG 1402
Query 1403 TGGCTGTCATCAGTGGTGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCACCACATCAACCACGGCATCACCACGCCCTCG 1476
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1403 TGGCTGTTATCAGTGGAGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCATCACATCAACCATGGCATCACTACACCATCA 1476
Query 1477 TCACTGGATGCGGGGCCCGACACTGTGGTCATTGGCATGACTCGCATCCCTGTCATTGAGAACCCCCAGTACTT 1550
||..|||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 TCGTTGGATGCTGGGCCTGACACAGTGGTCATTGGCATGACCCGCATCCCAGTCATTGAGAACCCCCAGTACTT 1550
Query 1551 CCGTCAGGGACACAACTGCCACAAGCCGGACACGTGGGTCTTTTCA-AACAT---------AGACAATCATGGG 1614
|||||||||.|||||.|||||||||||.||||| .|.|.|||| .|||| |||| |||.||
Sbjct 1551 CCGTCAGGGTCACAATTGCCACAAGCCAGACAC----ATATGTTCAGCACATCAAGAGGAGAGAC-ATCGTG-- 1617
Query 1615 ATATTAAACTTGAAG-GACAAT------AGAGATC--------------------------------ATCT-AG 1648
|||||| ||.||| ||.||.| |||| ||
Sbjct 1618 ---------TTGAAGAGAGAATTGGGTGAGGGAGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTGGCTGAGTGCTACAATCTAAG 1682
Query 1649 TCCCATCAACTCACTATAT-ATA-------TGAGGAACCTGAGG----------------------------TC 1686
.||||.||| ..||.|.|| .|| |||.|..|||||.| ||
Sbjct 1683 CCCCACCAA-AGACAAGATGCTAGTGGCAGTGAAGGCCCTGAAGGATCCCACCTTGGCTGCCAGGAAGGATTTC 1755
Query 1687 CAGAG---------------------------------------------------TGGGGAAGTGT------- 1702
||||| ||||| .||||
Sbjct 1756 CAGAGGGAGGCTGAGCTGCTCACGAACCTGCAGCATGAGCATATTGTCAAGTTCTATGGGG-TGTGTGGTGATG 1828
Query 1703 CTTACCCAAGGTCA-CATGGTTTCAGAGAAATTATGTTGAATCCAATAAGCCTTCCCGGA---CATTCCAAG-- 1770
.|.||||| .||| ||||||.| ||||||.||..||||.| ||| |.|..||||
Sbjct 1829 GTGACCCA--CTCATCATGGTCT-------------TTGAATACATGAAGCAT----GGAGACCTTAACAAGTT 1883
Query 1771 CCTCTTAA----CCATGG--CA---TCTATG----TTGAGGATG----TCAATGTTTATTTCAG--CAA--AGG 1823
|||| | |||||| || .|.||| |.|.||||| .|.|.| |||| ||| .||
Sbjct 1884 CCTC---AGGGCCCATGGGCCAGATGCCATGATCCTCGTGGATGGACAGCCACG------TCAGGCCAAGGGGG 1948
Query 1824 ACGTCATGGCTTT------------------------------------------------------------- 1836
| |..|.||||.|
Sbjct 1949 A-GCTAGGGCTCTCTCAGATGCTCCACATCGCCAGTCAGATAGCCTCGGGCATGGTGTACCTGGCTTCCCAGCA 2021
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2022 CTTTGTACACCGGGACCTGGCCACGAGGAACTGCCTGGTTGGAGCCAATCTACTAGTGAAGATTGGAGATTTTG 2095
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2096 GCATGTCCAGGGACGTCTACAGTACTGATTACTACAGGGTGGGAGGACACACCATGCTCCCCATCCGCTGGATG 2169
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2170 CCCCCTGAAAGCATAATGTACCGGAAGTTCACCACAGAGAGTGATGTCTGGAGCTTCGGGGTTATTCTTTGGGA 2243
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2244 GATCTTTACCTATGGGAAGCAACCATGGTTCCAGCTTTCCAACACGGAGGTCATTGAATGCATCACCCAAGGCC 2317
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2318 GTGTCTTGGAGAGACCCAGAGTCTGCCCTAAAGAAGTGTATGATGTCATGCTGGGGTGCTGGCAGAGGGAACCA 2391
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2392 CAGCAGCGGCTGAATATTAAGGAGATCTACAAAATCCTCCATGCTTTGGGGAAGGCCACCCCGATCTACCTGGA 2465
Query 1837 ---------- 1836
Sbjct 2466 CATTCTTGGC 2475
