Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06660
• Subject: XM_006540692.3
• Aligned Length: 1840
• Identities: 1560
• Gaps: 143

Alignment

Query    1  ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA  74

Query   75  TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG  148

Query  149  ATGGGAACCTCTTCCCCCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGTATCAACATCACG  222
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  149  ATGGGAACCTCTTCCCTCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGCATCAACATTACG  222

Query  223  GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGCAGTCTTCACACGCTCAACGCCGTGGACAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  223  GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGAGGCCTGCACACACTCAATGCTGTGGACAT  296

Query  297  GGAGCTCTACACCGGACTTCAAAAGCTGACCATCAAGAACTCAGGACTTCGGAGCATTCAGCCCAGAGCCTTTG  370
            ||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|
Sbjct  297  GGAGCTCTACACGGGACTCCAGAAGCTGACCATCAAGAATTCTGGACTCCGGAACATCCAGCCCAGAGCCTTCG  370

Query  371  CCAAGAACCCCCATTTGCGTTATATAAACCTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCGTGGCAGCTCTTCCAG  444
            |||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CCAAGAACCCCCACTTGCGTTATATAAACTTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCCTGGCAGCTCTTCCAG  444

Query  445  ACGCTGAGTCTTCGGGAATTGCAG-TTGGAGCAGAACTTTTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGC  517
            ||||||||.|||||||||||| || .|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACGCTGAGCCTTCGGGAATTG-AGACTGGAGCAGAACTTCTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGC  517

Query  518  TCTGGCAGGAGCAGGGGGAGGCCAAGCTCAACAGCCAGAACCTCTACTGCATCAACGCTGATGGCTCCCAGCTT  591
            |.||||||||.|||||||||||...|||..|||||||||.|||.||||||||||..||||||||||||||.||.
Sbjct  518  TGTGGCAGGAACAGGGGGAGGCGCGGCTGGACAGCCAGAGCCTTTACTGCATCAGTGCTGATGGCTCCCAACTC  591

Query  592  CCTCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGACCTTCCTGAGATCAGCGTGAGCCACGTCAACCTGACCGTACG  665
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  592  CCCCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGATCTCCCAGAGATCAGTGTGAGCCACGTCAACCTGACTGTCCG  665

Query  666  AGAGGGTGACAATGCTGTTATCACTTGCAATGGCTCTGGATCACCCCTTCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTG  739
            |||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  AGAAGGAGACAATGCCGTGATCACTTGCAATGGCTCTGGCTCTCCTTTGCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTG  739

Query  740  GGCTGCAGTCCATCAACACTCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTTCATGCCATCAACTTGACGCTGGTG  813
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  740  GGCTGCAGTCCATCAACACCCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTACATGCCATCAACTTGACCCTGGTG  813

Query  814  AATGTGACGAGTGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAG  887
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  AACGTGACGAGCGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAG  887

Query  888  TGTTGCCCTCACTGTCTACTATCCCCCACGTGTGGTGAGCCTGGAGGAGCCTGAGCTGCGCCTGGAGCACTGCA  961
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|.||||||||.||.||||
Sbjct  888  TGTTGCTCTCACTGTCTACTACCCTCCACGTGTGGTGAGCCTGGTGGAGCCTGAGGTACGCCTGGAACATTGCA  961

Query  962  TCGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCCCCACCAACGCTGCACTGGCTGCACAATGGGCAGCCTCTGCGGGAGTCC  1035
            |.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||||||.|||||||.|||||..||.||||||||
Sbjct  962  TTGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCGACACCCACGCTCCACTGGCTGTACAATGGACAGCCATTGAGGGAGTCC  1035

Query 1036  AAGATCATCCATGTGGAATACTACCAAGAGGGAGAGATTTCCGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCA  1109
            ||||||||.||..||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  AAGATCATTCACATGGACTACTACCAGGAGGGGGAGGTCTCAGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCA  1109

Query 1110  CTACAACAATGGCAACTATACCCTCATTGCCAAAAACCCACTGGGCACAGCCAACCAGACCATCAATGGCCACT  1183
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||..|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1110  CTACAACAATGGCAACTACACCCTCATTGCTAAGAATGCCCTGGGCACGGCCAACCAGACCATCAACGGCCACT  1183

Query 1184  TCCTCAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACGGATAACTTTATCTTGTTTGA---CGAAGTGAGTCCCACACCTCCT  1254
            ||||.|||||||||||||||||||||||.|||..||||..|   |||||   .||.|.|||.||.|||||||||
Sbjct 1184  TCCTGAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACAGATTTCTTTGAC---TTTGAGTCTGATGCGAGCCCTACACCTCCT  1254

Query 1255  ATCACTGTGACCCACAAACCAGAAGAAGACACTTTTGGGGTATCCATAGCAGTTGGACTTGCTGCTTTTGCCTG  1328
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1255  ATCACTGTGACCCACAAACCAGAGGAAGACACTTTTGGGGTGTCCATAGCAGTCGGACTTGCTGCCTTTGCCTG  1328

Query 1329  TGTCCTGTTGGTGGTTCTCTTCGTCATGATCAACAAATATGGTCGACGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCCG  1402
            .|||||..|||||||||||||..|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1329  CGTCCTTCTGGTGGTTCTCTTTATCATGATCAACAAGTATGGTCGCCGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCTG  1402

Query 1403  TGGCTGTCATCAGTGGTGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCACCACATCAACCACGGCATCACCACGCCCTCG  1476
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1403  TGGCTGTTATCAGTGGAGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCATCACATCAACCATGGCATCACTACACCATCA  1476

Query 1477  TCACTGGATGCGGGGCCCGACACTGTGGTCATTGGCATGACTCGCATCCCTGTCATTGAGAACCCCCAGTACTT  1550
            ||..|||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  TCGTTGGATGCTGGGCCTGACACAGTGGTCATTGGCATGACCCGCATCCCAGTCATTGAGAACCCCCAGTACTT  1550

Query 1551  CCGTCAGGGACACAACTGCCACAAGCCGGACACGTGGGTCTTTTCAAACATAGACAATCATGGGATATTAAACT  1624
            |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|                                       
Sbjct 1551  CCGTCAGGGTCACAATTGCCACAAGCCAGACACAT---------------------------------------  1585

Query 1625  TGAAGGACAATAGAGATCATCTAGTCCCATCAACTCACTATATATATGAGGAACCTGAGGTCCAGAGTGGGGAA  1698
                                                                                      
Sbjct 1586  --------------------------------------------------------------------------  1585

Query 1699  GTGTCTTACCCAAGGTCACATGGTTTCAGAGAAATTATGTTGAATCCAATAAGCCTTCCCGGACATTCCAAGCC  1772
                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1586  ----------------------GTTTCAGAGAAATTATGTTGAATCCAATAAGCCTTTCCGGACATTCCAAGCC  1637

Query 1773  TCTTAACCATGGCATCTATGTTGAGGATGTCAATGTTTATTTCAGCAAAGGACGTCATGGCTTT  1836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638  TCTTAACCATGGCATCTATGTTGAGGATGTCAATGTTTATTTCAGCAAAGGACGTCATGGCTTT  1701