Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06670
• Subject: NM_010957.4
• Aligned Length: 1049
• Identities: 877
• Gaps: 28

Alignment

Query    1  ATG----------CCTGCCCGCGCGCTTCTGCCCAGGCGCATGGGGCATCGTACTCTAGCCTCCACTCCTGCCC  64
            |||          ||||          .|||||.||..|||||.|.|||||.||.|||..|||||..||.||||
Sbjct    1  ATGTTATTCCGTTCCTG----------GCTGCCTAGCAGCATGAGACATCGCACCCTAAGCTCCAGCCCGGCCC  64

Query   65  TGTGGGCCTCCATCCCGTGCCCTCGCTCTGAGCTGCGCCTGGACCTGGTTCTGCCTTCTGGACAATCTTTCCGG  138
            |.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.|..||||||||||.||.||||||
Sbjct   65  TCTGGGCCTCTATCCCGTGTCCACGCTCTGAGCTGCGTCTGGACTTGGTTTTAGCTTCTGGACAGTCCTTCCGG  138

Query  139  TGGAGGGAGCAAAGTCCTGCACACTGGAGTGGTGTACTAGCGGATCAAGTATGGACACTGACTCAGACTGAGGA  212
            ||||.||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  139  TGGAAGGAGCAGAGCCCTGCTCACTGGAGTGGCGTGCTGGCAGATCAAGTATGGACACTGACTCAGACGGAGGA  212

Query  213  GCAGCTCCACTGCACTGTGTACCGAGGAGACAAGAGCCAGGCTAGCAGGCCCACACCAGACGAGCTGGAGGCCG  286
            .||||||.|.|||||||||||||||||||||.|.|||||||..|||||||||||.|.|||.||||||||..||.
Sbjct  213  CCAGCTCTATTGCACTGTGTACCGAGGAGACGACAGCCAGGTCAGCAGGCCCACCCTAGAGGAGCTGGAAACCC  286

Query  287  TGCGCAAGTACTTCCAGCTAGATGTTACCCTGGCTCAACTGTATCACCACTGGGGTTCCGTGGACTCCCACTTC  360
            |.|.|||||||||.|||||||||||.|.||||||.||.||||||..||||||||.|||.||.||||||||||||
Sbjct  287  TACACAAGTACTTTCAGCTAGATGTCAGCCTGGCACAGCTGTATAGCCACTGGGCTTCTGTAGACTCCCACTTC  360

Query  361  CAAGAG-GTGGCTCAGAAATTCCAAGGTGTGCGACTGCTGCGACAAGACCCCATCGAATGCCTTTTCTCTTTTA  433
            ||| || |||||.||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||..||.||||||||||||||.|
Sbjct  361  CAA-AGAGTGGCCCAGAAATTCCAAGGTGTGAGACTGCTGAGACAAGACCCCACTGAGTGCCTTTTCTCTTTCA  433

Query  434  TCTGTTCCTCCAACAACAACATCGCCCGCATCACTGGCATGGTGGAGCGGCTGTGCCAGGCTTTTGGACCTCGG  507
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  434  TCTGTTCCTCCAACAACAACATTGCTCGCATTACTGGCATGGTGGAACGGCTCTGCCAGGCCTTTGGACCTCGA  507

Query  508  CTCATCCAGCTTGATGATGTCACCTACCATGGCTTCCCCAGCCTGCAGGCCCTGGCTGGGCCAGAGGTGGAGGC  581
            |||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|.|||.||.|||||||||||.|||||.|..|||.|
Sbjct  508  CTCATTCAGCTTGATGATGTCACTTATCATGGCTTCCCAAACCTCCATGCCCTGGCTGGTCCAGAAGCAGAGAC  581

Query  582  TCATCTCAGGAAGCTGGGCCTGGGCTATCGTGCCCGTTACGTGAGTGCCAGTGCCCGAGCCATCCTGGAAGAAC  655
            |||.||.||||||.||||||||||.||.||||||||.||.||..|||||||||||..|||||||||.|||||.|
Sbjct  582  TCACCTGAGGAAGTTGGGCCTGGGGTACCGTGCCCGCTATGTACGTGCCAGTGCCAAAGCCATCCTCGAAGAGC  655

Query  656  AGGGCGGGCTAGCCTGGCTGCAGCAGCTACGAGAGTCCTCATATGAGGAGGCCCACAAGGCCCTCTGCATCCTG  729
            |.||.||||.|||.||||||||||||||.||||.|.||.|.|||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  656  AAGGTGGGCCAGCTTGGCTGCAGCAGCTTCGAGTGGCCCCTTATGAAGAGGCCCACAAGGCCCTCTGCACCCTG  729

Query  730  CCTGGAGTGGGCACCAAGGTGGCTGACTGCATCTGCCTGATGGCCCTAGACAAGCCCCAGGCTGTGCCCGTGGA  803
            ||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  730  CCCGGGGTGGGCGCCAAGGTGGCTGACTGCATCTGCTTAATGGCCCTTGACAAACCCCAGGCTGTGCCCGTGGA  803

Query  804  TGTCCATATGTGGCACATTGCCCAACGTGACTACAGCTGGCACCCTACCACGTCCCAGGCGAAGGGACCGAGCC  877
            |||||||.|.|||||.||||||||.|||||||||.|||||||.||||..||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  804  TGTCCATGTATGGCAGATTGCCCATCGTGACTACGGCTGGCATCCTAAGACATCCCAGGCTAAGGGCCCGAGCC  877

Query  878  CCCAGACCAACAAGGAACTGGGAAACTTTTTCCGGAGCCTGTGGGGACCTTATGCTGGCTGGGCCCAAGCGGTG  951
            |...|.|||||||.||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  878  CTTTGGCCAACAAAGAACTGGGAAACTTTTTCCGGAATCTGTGGGGACCTTATGCTGGCTGGGCCCAAGCAGTG  951

Query  952  CTGTTCAGTGCCGACCTGCGCCAATGCC--GCCATG-CTCAGGAGCCACCAGCAAAGCGCAGAAAGGGTTCCAA  1022
            |||||||||||.|||||.||||||  ||  ||| || |||.||||||||||||||||||||.||||||.||.||
Sbjct  952  CTGTTCAGTGCTGACCTTCGCCAA--CCAAGCC-TGTCTCGGGAGCCACCAGCAAAGCGCAAAAAGGGATCTAA  1022

Query 1023  AGGGCCGGAAGGC  1035
            ..||||.||.|||
Sbjct 1023  GAGGCCAGAGGGC  1035