Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06671
• Subject: NM_130837.2
• Aligned Length: 3045
• Identities: 2878
• Gaps: 165

Alignment

Query    1  ATGTGGCGACTACGTCGGGCCGCTGTGGCCTGTGAGGTCTGCCAGTCTTTAGTGAAACACAGCTCTGGAATAAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGCGACTACGTCGGGCCGCTGTGGCCTGTGAGGTCTGCCAGTCTTTAGTGAAACACAGCTCTGGAATAAA  74

Query   75  AGGAAGTTTACCACTACAAAAACTACATCTGGTTTCACGAAGCATTTATCATTCACATCATCCTACCTTAAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGAAGTTTACCACTACAAAAACTACATCTGGTTTCACGAAGCATTTATCATTCACATCATCCTACCTTAAAGC  148

Query  149  TTCAACGACCCCAATTAAGGACATCCTTTCAGCAGTTCTCTTCTCTGACAAACCTTCCTTTACGTAAACTGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCAACGACCCCAATTAAGGACATCCTTTCAGCAGTTCTCTTCTCTGACAAACCTTCCTTTACGTAAACTGAAA  222

Query  223  TTCTCTCCAATTAAATATGGCTACCAGCCTCGCAGGAATTTTTGGCCAGCAAGATTAGCTACGAGACTCTTAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCTCTCCAATTAAATATGGCTACCAGCCTCGCAGGAATTTTTGGCCAGCAAGATTAGCTACGAGACTCTTAAA  296

Query  297  ACTTCGCTATCTCATACTAGGATCGGCTGTTGGGGGTGGCTACACAGCCAAAAAGACTTTTGATCAGTGGAAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTTCGCTATCTCATACTAGGATCGGCTGTTGGGGGTGGCTACACAGCCAAAAAGACTTTTGATCAGTGGAAAG  370

Query  371  ATATGATACCGGACCTTAGTGAATATAAATGGATTGTGCCTGACATTGTGTGGGAAATTGATGAGTATATCGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATGATACCGGACCTTAGTGAATATAAATGGATTGTGCCTGACATTGTGTGGGAAATTGATGAGTATATCGAT  444

Query  445  TTTGAGAAAATTAGAAAAGCCCTTCCTAATTCAGAAGACCTTGTAAAGTTAGCACCAGACTTTGACAAGATTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGAGAAAATTAGAAAAGCCCTTCCTAGTTCAGAAGACCTTGTAAAGTTAGCACCAGACTTTGACAAGATTGT  518

Query  519  TGAAAGCCTTAGCTTATTGAAGGACTTTTTTACCTC--------------------------------------  554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  519  TGAAAGCCTTAGCTTATTGAAGGACTTTTTTACCTCAGGTCACAAATTGGTTAGTGAAGTCATAGGAGCTTCTG  592

Query  555  ----------------AGGTTCTCCGGAAGAAACGGCGTTTAGAGCAACAGATCGTGGATCTGAAAGTGACAAG  612
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTACTTCTCTTGTTAGGTTCTCCGGAAGAAACGGCGTTTAGAGCAACAGATCGTGGATCTGAAAGTGACAAG  666

Query  613  CATTTTAGA-----------------------------------------------------------------  621
            |||||||||                                                                 
Sbjct  667  CATTTTAGAAAGGGTCTGCTTGGTGAGCTCATTCTCTTACAACAACAAATTCAAGAGCATGAAGAGGAAGCGCG  740

Query  622  ----------------------------------------------AAGGTGTCAGACAAAGAGAAAATTGACC  649
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGAGCCGCTGGCCAATATAGCACGAGCTATGCCCAACAGAAGCGCAAGGTGTCAGACAAAGAGAAAATTGACC  814

Query  650  AACTTCAGGAAGAACTTCTGCACACTCAGTTGAAGTATCAGAGAATCTTGGAACGATTAGAAAAGGAGAACAAA  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACTTCAGGAAGAACTTCTGCACACTCAGTTGAAGTATCAGAGAATCTTGGAACGATTAGAAAAGGAGAACAAA  888

Query  724  GAATTGAGAAAATTAGTATTGCAGAAAGATGACAAAGGCATTCATCATAGAAAGCTTAAGAAATCTTTGATTGA  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAATTGAGAAAATTAGTATTGCAGAAAGATGACAAAGGCATTCATCATAGAAAGCTTAAGAAATCTTTGATTGA  962

Query  798  CATGTATTCTGAAGTTCTTGATGTTCTCTCTGATTATGATGCCAGTTATAATACGCAAGATCATCTGCCACGGG  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATGTATTCTGAAGTTCTTGATGTTCTCTCTGATTATGATGCCAGTTATAATACGCAAGATCATCTGCCACGGG  1036

Query  872  TTGTTGTGGTTGGAGATCAGAGTGCTGGAAAGACTAGTGTGTTGGAAATGATTGCCCAAGCTCGAATATTCCCA  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGTTGTGGTTGGAGATCAGAGTGCTGGAAAGACTAGTGTGTTGGAAATGATTGCCCAAGCTCGAATATTCCCA  1110

Query  946  AGAGGATCTGGGGAGATGATGACACGTTCTCCAGTTAAGGTGACTCTGAGTGAAGGTCCTCACCATGTGGCCCT  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAGGATCTGGGGAGATGATGACACGTTCTCCAGTTAAGGTGACTCTGAGTGAAGGTCCTCACCATGTGGCCCT  1184

Query 1020  ATTTAAAGATAGTTCTCGGGAGTTTGATCTTACCAAAGAAGAAGATCTTGCAGCATTAAGACATGAAATAGAAC  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATTTAAAGATAGTTCTCGGGAGTTTGATCTTACCAAAGAAGAAGATCTTGCAGCATTAAGACATGAAATAGAAC  1258

Query 1094  TTCGAATGAGGAAAAATGTGAAAGAAGGCTGTACCGTTAGCCCTGAGACCATATCCTTAAATGTAAAAGGCCCT  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCGAATGAGGAAAAATGTGAAAGAAGGCTGTACCGTTAGCCCTGAGACCATATCCTTAAATGTAAAAGGCCCT  1332

Query 1168  GGACTACAGAGGATGGTGCTTGTTGACTTACCAGGTGTGATTAATACTGTGACATCAGGCATGGCTCCTGACAC  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGACTACAGAGGATGGTGCTTGTTGACTTACCAGGTGTGATTAATACTGTGACATCAGGCATGGCTCCTGACAC  1406

Query 1242  AAAGGAAACTATTTTCAGTATCAGCAAAGCTTACATGCAGAATCCTAATGCCATCATACTGTGTATTCAAGATG  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAAGGAAACTATTTTCAGTATCAGCAAAGCTTACATGCAGAATCCTAATGCCATCATACTGTGTATTCAAGATG  1480

Query 1316  GATCTGTGGATGCTGAACGCAGTATTGTTACAGACTTGGTCAGTCAAATGGACCCTCATGGAAGGAGAACCATA  1389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GATCTGTGGATGCTGAACGCAGTATTGTTACAGACTTGGTCAGTCAAATGGACCCTCATGGAAGGAGAACCATA  1554

Query 1390  TTCGTTTTGACCAAAGTAGACCTGGCAGAGAAAAATGTAGCCAGTCCAAGCAGGATTCAGCAGATAATTGAAGG  1463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCGTTTTGACCAAAGTAGACCTGGCAGAGAAAAATGTAGCCAGTCCAAGCAGGATTCAGCAGATAATTGAAGG  1628

Query 1464  AAAGCTCTTCCCAATGAAAGCTTTAGGTTATTTTGCTGTTGTAACAGGAAAAGGGAACAGCTCTGAAAGCATTG  1537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAAGCTCTTCCCAATGAAAGCTTTAGGTTATTTTGCTGTTGTAACAGGAAAAGGGAACAGCTCTGAAAGCATTG  1702

Query 1538  AAGCTATAAGAGAATATGAAGAAGAGTTTTTTCAGAATTCAAAGCTCCTAAAGACAAGCATGCTAAAGGCACAC  1611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAGCTATAAGAGAATATGAAGAAGAGTTTTTTCAGAATTCAAAGCTCCTAAAGACAAGCATGCTAAAGGCACAC  1776

Query 1612  CAAGTGACTACAAGAAATTTAAGCCTTGCAGTATCAGACTGCTTTTGGAAAATGGTACGAGAGTCTGTTGAACA  1685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAAGTGACTACAAGAAATTTAAGCCTTGCAGTATCAGACTGCTTTTGGAAAATGGTACGAGAGTCTGTTGAACA  1850

Query 1686  ACAGGCTGATAGTTTCAAAGCAACACGTTTTAACCTTGAAACTGAATGGAAGAATAACTATCCTCGCCTGCGGG  1759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACAGGCTGATAGTTTCAAAGCAACACGTTTTAACCTTGAAACTGAATGGAAGAATAACTATCCTCGCCTGCGGG  1924

Query 1760  AACTTGACCGGAATGAACTATTTGAAAAAGCTAAAAATGAAATCCTTGATGAAGTTATCAGTCTGAGCCAGGTT  1833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AACTTGACCGGAATGAACTATTTGAAAAAGCTAAAAATGAAATCCTTGATGAAGTTATCAGTCTGAGCCAGGTT  1998

Query 1834  ACACCAAAACATTGGGAGGAAATCCTTCAACAATCTTTGTGGGAAAGAGTATCAACTCATGTGATTGAAAACAT  1907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACACCAAAACATTGGGAGGAAATCCTTCAACAATCTTTGTGGGAAAGAGTATCAACTCATGTGATTGAAAACAT  2072

Query 1908  CTACCTTCCAGCTGCGCAGACCATGAATTCAGGAACTTTTAACACCACAGTGGATATCAAGCTTAAACAGTGGA  1981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTACCTTCCAGCTGCGCAGACCATGAATTCAGGAACTTTTAACACCACAGTGGATATCAAGCTTAAACAGTGGA  2146

Query 1982  CTGATAAACAACTTCCTAATAAAGCAGTAGAGGTTGCTTGGGAGACCCTACAAGAAGAATTTTCCCGCTTTATG  2055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTGATAAACAACTTCCTAATAAAGCAGTAGAGGTTGCTTGGGAGACCCTACAAGAAGAATTTTCCCGCTTTATG  2220

Query 2056  ACAGAACCGAAAGGGAAAGAGCATGATGACATATTTGATAAACTTAAAGAGGCCGTTAAGGAAGAAAGTATTAA  2129
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACAGAACCGAAAGGGAAAGAGCATGATGACATATTTGATAAACTTAAAGAGGCTGTTAAGGAAGAAAGTATTAA  2294

Query 2130  ACGACACAAGTGGAATGACTTTGCGGAGGACAGCTTGAGGGTTATTCAACACAATGCTTTGGAAGACCGATCCA  2203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ACGACACAAGTGGAATGACTTTGCGGAGGACAGCTTGAGGGTTATTCAACACAATGCTTTGGAAGACCGATCCA  2368

Query 2204  TATCTGATAAACAGCAATGGGATGCAGCTATTTATTTTATGGAAGAGGCTCTGCAGGCTCGTCTCAAGGATACT  2277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TATCTGATAAACAGCAATGGGATGCAGCTATTTATTTTATGGAAGAGGCTCTGCAGGCTCGTCTCAAGGATACT  2442

Query 2278  GAAAATGCAATTGAAAACATGGTGGGTCCAGACTGGAAAAAGAGGTGGTTATACTGGAAGAATCGGACCCAAGA  2351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GAAAATGCAATTGAAAACATGGTGGGTCCAGACTGGAAAAAGAGGTGGTTATACTGGAAGAATCGGACCCAAGA  2516

Query 2352  ACAGTGTGTTCACAATGAAACCAAGAATGAATTGGAGAAGATGTTGAAATGTAATGAGGAGCACCCAGCTTATC  2425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ACAGTGTGTTCACAATGAAACCAAGAATGAATTGGAGAAGATGTTGAAATGTAATGAGGAGCACCCAGCTTATC  2590

Query 2426  TTGCAAGTGATGAAATAACCACAGTCCGGAAGAACCTTGAATCCCGAGGAGTAGAAGTAGATCCAAGCTTGATT  2499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TTGCAAGTGATGAAATAACCACAGTCCGGAAGAACCTTGAATCCCGAGGAGTAGAAGTAGATCCAAGCTTGATT  2664

Query 2500  AAGGATACTTGGCATCAAGTTTATAGAAGACATTTTTTAAAAACAGCTCTAAACCATTGTAACCTTTGTCGAAG  2573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AAGGATACTTGGCATCAAGTTTATAGAAGACATTTTTTAAAAACAGCTCTAAACCATTGTAACCTTTGTCGAAG  2738

Query 2574  AGGTTTTTATTACTACCAAAGGCATTTTGTAGATTCTGAGTTGGAATGCAATGATGTGGTCTTGTTTTGGCGTA  2647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  AGGTTTTTATTACTACCAAAGGCATTTTGTAGATTCTGAGTTGGAATGCAATGATGTGGTCTTGTTTTGGCGTA  2812

Query 2648  TACAGCGCATGCTTGCTATCACCGCAAATACTTTAAGGCAACAACTTACAAATACTGAAGTTAGGCGATTAGAG  2721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TACAGCGCATGCTTGCTATCACCGCAAATACTTTAAGGCAACAACTTACAAATACTGAAGTTAGGCGATTAGAG  2886

Query 2722  AAAAATGTTAAAGAGGTATTGGAAGATTTTGCTGAAGATGGTGAGAAGAAGATTAAATTGCTTACTGGTAAACG  2795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AAAAATGTTAAAGAGGTATTGGAAGATTTTGCTGAAGATGGTGAGAAGAAGATTAAATTGCTTACTGGTAAACG  2960

Query 2796  CGTTCAACTGGCGGAAGACCTCAAGAAAGTTAGAGAAATTCAAGAAAAACTTGATGCTTTCATTGAAGCTCTTC  2869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CGTTCAACTGGCGGAAGACCTCAAGAAAGTTAGAGAAATTCAAGAAAAACTTGATGCTTTCATTGAAGCTCTTC  3034

Query 2870  ATCAGGAGAAA  2880
            |||||||||||
Sbjct 3035  ATCAGGAGAAA  3045