Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06683
• Subject: NM_001081454.2
• Aligned Length: 2384
• Identities: 2108
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  ATGGAGCTGAGGCCCTGGTTGCTATGGGTGGTAGCAGCAACAGGAACCTTGGTCCTGCTAGCAGCTGATGCTCA  74
            |||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||.|||||.||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTGAGATCCTGGTTGCTATGGGTGGTCGCAGCAGCAGGAGCCGTGGTCCTGCTGGCAGCTGATGCTCA  74

Query   75  GGGCCAGAAGGTCTTCACCAACACGTGGGCTGTGCGCATCCCTGGAGGCCCAGCGGTGGCCAACAGTGTGGCAC  148
            .|||||||||.|||||||||||||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|||||..|.||.|||||.|
Sbjct   75  AGGCCAGAAGATCTTCACCAACACCTGGGCCGTGCACATTCCTGGAGGCCCAGCTGTGGCTGATAGGGTGGCGC  148

Query  149  GGAAGCATGGGTTCCTCAACCTGGGCCAGATCTTCGGGGACTATTACCACTTCTGGCATCGAGGAGTGACGAAG  222
            .|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||.||||||.|||
Sbjct  149  AGAAGCATGGCTTCCACAACCTGGGCCAGATCTTCGGTGACTATTACCACTTCTGGCACAGAGCAGTGACAAAG  222

Query  223  CGGTCCCTGTCGCCTCACCGCCCGCGGCACAGCCGGCTGCAGAGGGAGCCTCAAGTACAGTGGCTGGAACAGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct  223  CGGTCCCTGTCGCCTCACCGCCCGCGGCACAGCCGGCTACAGAGGGAGCCTCAAGTAAAGTGGCTGGAGCAGCA  296

Query  297  GGTGGCAAAGCGACGGACTAAACGGGACGTGTACCAGGAGCCCACAGACCCCAAGTTTCCTCAGCAGTGGTACC  370
            |||.||.||||||.|..|.||..||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  GGTAGCCAAGCGAAGAGCCAAGAGGGACGTGTATCAGGAGCCCACGGACCCCAAGTTCCCCCAGCAGTGGTACC  370

Query  371  TGTCTGGTGTCACTCAGCGGGACCTGAATGTGAAGGCGGCCTGGGCGCAGGGCTACACAGGGCACGGCATTGTG  444
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  TGTCTGGTGTCACTCAGCGAGACCTGAATGTGAAGGAGGCCTGGGCCCAGGGCTTCACAGGCCATGGCATTGTG  444

Query  445  GTCTCCATTCTGGACGATGGCATCGAGAAGAACCACCCGGACTTGGCAGGCAATTATGATCCTGGGGCCAGTTT  518
            ||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||.|.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  445  GTCTCCATCCTGGATGACGGCATTGAGAAGAATCATCCCGACCTAGCAGGCAATTATGACCCTGGAGCCAGTTT  518

Query  519  TGATGTCAATGACCAGGACCCTGACCCCCAGCCTCGGTACACACAGATGAATGACAACAGGCACGGCACACGGT  592
            |||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  519  TGACGTGAATGACCAGGACCCCGACCCACAGCCTCGGTACACACAGATGAATGACAACAGGCATGGCACTCGCT  592

Query  593  GTGCGGGGGAAGTGGCTGCGGTGGCCAACAACGGTGTCTGTGGTGTAGGTGTGGCCTACAACGCCCGCATTGGA  666
            ||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  593  GTGCCGGGGAAGTGGCAGCAGTGGCCAACAATGGTGTCTGTGGCGTAGGTGTAGCTTACAATGCCCGAATTGGA  666

Query  667  GGGGTGCGCATGCTGGATGGCGAGGTGACAGATGCAGTGGAGGCACGCTCGCTGGGCCTGAACCCCAACCACAT  740
            ||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GGGGTGCGGATGTTGGATGGCGAGGTGACTGATGCAGTAGAGGCACGTTCGCTGGGCCTGAATCCCAACCACAT  740

Query  741  CCACATCTACAGTGCCAGCTGGGGCCCCGAGGATGACGGCAAGACAGTGGATGGGCCAGCCCGCCTCGCCGAGG  814
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  741  CCACATCTACAGCGCCAGCTGGGGCCCTGAGGACGACGGCAAGACCGTGGATGGACCAGCCCGGCTCGCTGAGG  814

Query  815  AGGCCTTCTTCCGTGGGGTTAGCCAGGGCCGAGGGGGGCTGGGCTCCATCTTTGTCTGGGCCTCGGGGAACGGG  888
            ||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  815  AGGCCTTCTTTCGGGGAGTTAGCCAGGGCCGAGGAGGGCTGGGCTCCATCTTTGTCTGGGCCTCAGGGAATGGG  888

Query  889  GGCCGGGAACATGACAGCTGCAACTGCGACGGCTACACCAACAGTATCTACACGCTGTCCATCAGCAGCGCCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCCGGGAACATGACAGCTGCAACTGTGACGGCTACACCAACAGCATCTATACACTGTCCATCAGCAGCGCCAC  962

Query  963  GCAGTTTGGCAACGTGCCGTGGTACAGCGAGGCCTGCTCGTCCACACTGGCCACGACCTACAGCAGTGGCAACC  1036
            .|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  963  ACAGTTCGGCAATGTGCCCTGGTACAGTGAGGCCTGCTCCTCCACACTGGCCACCACCTACAGCAGCGGCAACC  1036

Query 1037  AGAATGAGAAGCAGATCGTGACGACTGACTTGCGGCAGAAGTGCACGGAGTCTCACACGGGCACCTCAGCCTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1037  AGAATGAGAAGCAGATCGTGACAACTGACCTGAGGCAGAAGTGCACAGAATCTCACACAGGCACCTCGGCTTCT  1110

Query 1111  GCCCCCTTAGCAGCCGGCATCATTGCTCTCACCCTGGAGGCCAATAAGAACCTCACATGGCGGGACATGCAACA  1184
            ||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1111  GCCCCCTTGGCAGCTGGTATCATTGCTCTCACCCTGGAGGCCAACAAGAACCTCACCTGGCGGGACATGCAGCA  1184

Query 1185  CCTGGTGGTACAGACCTCGAAGCCAGCCCACCTCAATGCCAACGACTGGGCCACCAATGGTGTGGGCCGGAAAG  1258
            ||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGGTAGTGCAGACCTCAAAGCCAGCCCACCTCAACGCTGATGATTGGGCTACCAACGGCGTGGGCCGGAAAG  1258

Query 1259  TGAGCCACTCATATGGCTACGGGCTTTTGGACGCAGGCGCCATGGTGGCCCTGGCCCAGAATTGGACCACAGTG  1332
            |||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1259  TGAGCCATTCGTATGGCTACGGGCTGTTGGATGCAGGTGCCATGGTGGCTCTGGCCCAGAACTGGACAACAGTG  1332

Query 1333  GCCCCCCAGCGGAAGTGCATCATCGACATCCTCACCGAGCCCAAAGACATCGGGAAACGGCTCGAGGTGCGGAA  1406
            ||||||||||||||||||||..|.||.|||||....||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1333  GCCCCCCAGCGGAAGTGCATTGTTGAAATCCTGGTGGAACCCAAGGACATCGGCAAACGGCTAGAGGTGCGCAA  1406

Query 1407  GACCGTGACCGCGTGCCTGGGCGAGCCCAACCACATCACTCGGCTGGAGCACGCTCAGGCGCGGCTCACCCTGT  1480
            |.|.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  GGCGGTGACAGCATGCCTGGGTGAGCCCAACCACATCACCAGGCTGGAACACGTTCAGGCCCGGCTCACCCTGT  1480

Query 1481  CCTATAATCGCCGTGGCGACCTGGCCATCCACCTGGTCAGCCCCATGGGCACCCGCTCCACCCTGCTGGCAGCC  1554
            |.||.||||||||.||.||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||
Sbjct 1481  CTTACAATCGCCGCGGTGACCTGGCTATCCACCTCATCAGCCCCATGGGCACCCGCTCCACCCTGTTAGCTGCC  1554

Query 1555  AGGCCACATGACTACTCCGCAGATGGGTTTAATGACTGGGCCTTCATGACAACTCATTCCTGGGATGAGGATCC  1628
            ||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGACCACATGACTACTCTGCTGATGGGTTTAATGATTGGGCTTTCATGACAACCCATTCCTGGGATGAGGATCC  1628

Query 1629  CTCTGGCGAGTGGGTCCTAGAGATTGAAAACACCAGCGAAGCCAACAACTATGGGACGCTGACCAAGTTCACCC  1702
            ..|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629  GGCTGGCGAATGGGTCCTAGAGATTGAAAATACCAGTGAAGCCAACAACTATGGGACGCTGACCAAGTTCACTC  1702

Query 1703  TCGTACTCTATGGCACCGCCCCTGAGGGGCTGCCCGTACCTCCAGAAAGCAGTGGCTGCAAGACCCTCACGTCC  1776
            ||||.||.||||||||.|||||.||||||||..|...|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  TCGTTCTGTATGGCACAGCCCCCGAGGGGCTCTCTACACCTCCAGAAAGCAGCGGCTGCAAGACCCTCACATCC  1776

Query 1777  AGTCAGGCCTGTGTGGTGTGCGAGGAAGGCTTCTCCCTGCACCAGAAGAGCTGTGTCCAGCACTGCCCTCCAGG  1850
            ||.||||||||.||||||||.||||||||.|.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1777  AGCCAGGCCTGCGTGGTGTGTGAGGAAGGTTACTCTCTGCACCAGAAAAGCTGTGTCCAGCACTGCCCACCAGG  1850

Query 1851  CTTCGCCCCCCAAGTCCTCGATACGCACTATAGCACCGAGAATGACGTGGAGACCATCCGGGCCAGCGTCTGCG  1924
            ||||..||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||.||||||.|||||||||||..
Sbjct 1851  CTTCATCCCCCAAGTCCTTGATACACACTACAGCACTGAGAATGATGTGGAGATCATCCGTGCCAGCGTCTGTA  1924

Query 1925  CCCCCTGCCACGCCTCATGTGCCACATGCCAGGGGCCGGCCCTGACAGATTGCCTCAGCTGCCCCAGCCACGCC  1998
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1925  CCCCCTGCCACGCCTCATGTGCCACTTGCCAGGGCCCGGCCCCCACAGACTGCCTCAGCTGCCCCAGCCATGCC  1998

Query 1999  TCCTTGGACCCTGTGGAGCAGACTTGCTCCCGGCAAAGCCAGAGCAGCCGAGAGTCCCCGCCACAGCAGCAGCC  2072
            |||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||
Sbjct 1999  TCCCTGGACCCAGTGGAGCAGACCTGCTCCCGGCAAAGCCAGAGCAGCCGGGAGTCTCGGCCTCAGCAGCAGCC  2072

Query 2073  ACCTCGGCTGCCCCCGGAGGTGGAGGCGGGGCAACGGCTGCGGGCAGGGCTGCTGCCCTCACACCTGCCTGAGG  2146
            .|||...||||.|||.|||||||||..||.||..|||||||.|||.||   |.||.||||.||||||||.||||
Sbjct 2073  TCCTGCACTGCGCCCTGAGGTGGAGATGGAGCCCCGGCTGCAGGCTGG---GTTGGCCTCTCACCTGCCCGAGG  2143

Query 2147  TGGTGGCCGGCCTCAGCTGCGCCT--TCATCGTGCTGGTCTTCGTCACTGTCTTCCTGGTCCTGCAGCTGCGCT  2218
            |..|||||||||||||||  ||||  ||||||||||..||||.|.||..|||||||||.|||||||.|.|.|.|
Sbjct 2144  TCCTGGCCGGCCTCAGCT--GCCTTATCATCGTGCTCATCTTTGGCATCGTCTTCCTGTTCCTGCATCGGTGTT  2215

Query 2219  CTGGCTTTAGTTTTCGGGGGGTGAAGGTGTACACCATGGACCGTGGCCTCATCTCCTACAAGGGGCTGCCCCCT  2292
            |.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216  CGGGCTTCAGCTTCCGGGGAGTGAAAGTGTACACCATGGACCGCGGCCTCATCTCCTACAAGGGGCTGCCCCCT  2289

Query 2293  GAAGCCTGGCAGGAGGAGTGCCCGTCTGACTCAGAAGAGGACGAGGGCCGGGGCGAGAGGACCGCCTTTATCAA  2366
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2290  GAAGCCTGGCAGGAGGAGTGCCCATCGGACTCAGAGGAGGACGAGGGCCGGGGCGAGAGGACCGCCTTCATCAA  2363

Query 2367  AGACCAGAGCGCCCTC  2382
            |||||||||||||||.
Sbjct 2364  AGACCAGAGCGCCCTT  2379