Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06696
- Subject:
- XM_006517155.2
- Aligned Length:
- 2259
- Identities:
- 1999
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGAGCGAAGAGCCTGGAGTCTGCAGTGCACTGCTTTCGTCCTCTTTTGCGCTTGGTGTGCACTGAACAGTGC 74
|||||||.|||||..||||.|||||||||.||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1 ATGGAGCAAAGAGGTTGGACTCTGCAGTGTACTGCTTTCGCCTTCTTTTGCGTTTGGTGTGCACTAAACAGTGT 74
Query 75 AAAAGCGAAAAGGCAATTTGTCAATGAATGGGCAGCGGAGATCCCCGGGGGCCCGGAAGCAGCCTCGGCCATCG 148
||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|..|||||.|||||.|||||||
Sbjct 75 AAAAGCAAAGAGGCAGTTTGTTAATGAATGGGCGGCGGAGATCCCCGGAGGGCAAGAAGCTGCCTCTGCCATCG 148
Query 149 CCGAGGAGCTGGGCTATGACCTTTTGGGTCAGATTGGTTCACTTGAAAATCACTACTTATTCAAACATAAAAAC 222
||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||.|
Sbjct 149 CCGAAGAACTGGGGTATGACCTTTTGGGTCAGATTGGATCACTTGAAAATCACTATTTATTCAAACACAAAAGC 222
Query 223 CACCCCAGAAGGTCTCGAAGGAGTGCCTTTCATATCACTAAGAGATTATCTGATGATGATCGTGTGATATGGGC 296
||.||..|.|||||.|||||.||.||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 223 CATCCTCGGAGGTCCCGAAGAAGCGCTCTTCATATCACTAAGAGGTTATCTGATGATGATCGTGTGACGTGGGC 296
Query 297 TGAACAACAGTATGAAAAAGAAAGAAGTAAACGTTCAGCTCTAAGGGACTCAGCACTAAATCTCTTCAATGATC 370
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||..|||||||||.|..|||||||||||||||
Sbjct 297 TGAACAACAGTATGAAAAAGAGAGAAGTAAACGTTCAGTTCAAAAAGACTCAGCATTGGATCTCTTCAATGATC 370
Query 371 CCATGTGGAATCAGCAATGGTACTTGCAAGATACCAGGATGACGGCAGCCCTGCCCAAGCTGGACCTTCATGTG 444
|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 CAATGTGGAATCAGCAGTGGTACTTGCAAGATACCAGAATGACTGCAGCTCTGCCCAAGCTGGACCTTCATGTA 444
Query 445 ATACCTGTTTGGCAAAAAGGCATTACGGGCAAAGGAGTTGTTATCACCGTACTGGATGATGGTTTGGAGTGGAA 518
||||||||||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 ATACCTGTTTGGGAAAAGGGTATTACTGGCAAAGGAGTTGTTATTACTGTACTGGATGATGGCTTGGAGTGGAA 518
Query 519 TCACACGGACATTTATGCCAACTATGATCCAGAGGCTAGCTATGATTTTAATGATAATGACCATGATCCATTTC 592
||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 TCACACAGACATTTATGCCAATTATGATCCAGAGGCTAGCTATGATTTTAACGATAATGATCATGATCCATTTC 592
Query 593 CCCGATATGATCCCACAAACGAGAACAAACACGGGACCAGATGTGCAGGAGAAATTGCCATGCAAGCAAATAAT 666
||||||||||||.||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCGATATGATCTCACAAATGAAAACAAACATGGAACAAGATGTGCAGGTGAAATTGCCATGCAAGCAAATAAT 666
Query 667 CACAAATGCGGGGTTGGAGTTGCATACAATTCCAAAGTTGGAGGCATAAGAATGCTGGATGGCATTGTGACGGA 740
|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 667 CACAAGTGTGGGGTTGGAGTTGCATATAATTCCAAAGTTGGAGGCATAAGAATGCTGGATGGCATTGTAACTGA 740
Query 741 TGCTATTGAGGCCAGTTCAATTGGATTCAATCCTGGACACGTGGATATTTACAGTGCAAGCTGGGGCCCTAATG 814
|||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCCATTGAGGCTAGTTCAATTGGATTCAACCCTGGCCATGTGGATATTTACAGTGCAAGCTGGGGCCCTAATG 814
Query 815 ATGATGGGAAAACTGTGGAGGGGCCTGGCCGGCTAGCCCAGAAGGCTTTTGAATATGGTGTCAAACAGGGGAGA 888
|||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATGATGGAAAAACTGTGGAGGGGCCTGGCAGACTAGCCCAGAAGGCATTTGAATATGGTGTCAAACAGGGGAGA 888
Query 889 CAGGGGAAGGGGTCCATCTTCGTCTGGGCTTCGGGAAACGGGGGGCGTCAGGGAGATAATTGTGACTGTGATGG 962
||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 889 CAAGGGAAAGGCTCCATCTTTGTCTGGGCTTCAGGGAATGGGGGTCGTCAGGGAGATAACTGTGACTGTGATGG 962
Query 963 CTACACAGACAGCATCTACACCATCTCCATCAGCAGTGCCTCCCAGCAAGGCCTATCCCCCTGGTACGCTGAGA 1036
|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct 963 CTACACAGACAGCATTTACACCATCTCTATCAGCAGTGCCTCCCAGCAAGGCCTGTCACCTTGGTATGCAGAGA 1036
Query 1037 AGTGCTCCTCCACACTGGCCACCTCTTACAGCAGCGGAGATTACACCGACCAGAGAATCACGAGCGCTGACCTG 1110
||||.||.||||||.||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||
Sbjct 1037 AGTGTTCTTCCACATTGGCTACCTCCTACAGCAGTGGTGATTACACAGACCAGCGAATAACAAGCGCTGACCTG 1110
Query 1111 CACAATGACTGCACGGAGACGCACACAGGCACCTCGGCCTCTGCACCTCTGGCTGCTGGCATCTTCGCTCTGGC 1184
||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111 CACAATGACTGCACAGAGACCCACACAGGCACCTCGGCTTCAGCACCCCTGGCTGCTGGTATCTTTGCTCTGGC 1184
Query 1185 CCTGGAAGCAAACCCAAATCTCACCTGGCGAGATATGCAGCACCTGGTTGTCTGGACCTCTGAGTATGACCCGC 1258
|.||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..
Sbjct 1185 CTTGGAGGCAAACCCAAATCTTACCTGGAGAGATATGCAGCATCTGGTTGTCTGGACCTCTGAGTACGACCCAT 1258
Query 1259 TGGCCAATAACCCTGGATGGAAAAAGAATGGAGCAGGCTTGATGGTGAATAGTCGATTTGGATTTGGCTTGCTA 1332
||||||.||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGCCAGTAACCCAGGTTGGAAAAAGAATGGGGCAGGCTTGATGGTGAACAGCCGATTTGGATTTGGCTTGCTA 1332
Query 1333 AATGCCAAAGCTCTGGTGGATTTAGCTGACCCCAGGACCTGGAGGAGCGTGCCTGAGAAGAAAGAGTGTGTTGT 1406
|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|..|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333 AATGCCAAAGCTCTGGTGGATTTGGCTGATCCTAGGACCTGGAGAAATGTGCCTGAGAAGAAAGAATGTGTTGT 1406
Query 1407 AAAGGACAATGACTTTGAGCCCAGAGCCCTGAAAGCTAATGGAGAAGTTATCATTGAAATTCCAACAAGAGCTT 1480
|||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407 AAAAGACAATAACTTTGAGCCTAGAGCCCTGAAAGCTAATGGAGAAGTAATTGTTGAAATCCCAACAAGAGCTT 1480
Query 1481 GTGAAGGACAAGAAAATGCTATCAAGTCCCTGGAGCATGTACAATTTGAAGCAACAATTGAATATTCCCGAAGA 1554
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1481 GTGAAGGACAAGAAAATGCTATCAAGTCTCTGGAACATGTGCAATTTGAAGCAACAATTGAATATTCTCGTAGA 1554
Query 1555 GGAGACCTTCATGTCACACTTACTTCTGCTGCTGGAACTAGCACTGTGCTCTTGGCTGAAAGAGAACGGGATAC 1628
||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.|.|||||
Sbjct 1555 GGAGACCTTCATGTCACACTCACTTCTGCTGTTGGAACCAGCACTGTACTGTTGGCTGAAAGGGAAAGAGATAC 1628
Query 1629 ATCTCCTAATGGCTTTAAGAATTGGGACTTCATGTCTGTTCACACATGGGGAGAGAACCCTATAGGTACTTGGA 1702
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||.||||
Sbjct 1629 ATCCCCCAATGGCTTTAAGAATTGGGACTTCATGTCTGTTCATACATGGGGAGAGAATCCTGTAGGCACCTGGA 1702
Query 1703 CTTTGAGAATTACAGACATGTCTGGAAGAATTCAAAATGAAGGAAGAATTGTGAACTGGAAGCTGATTTTGCAC 1776
|.||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1703 CATTGAAAATTACAGACATGTCTGGAAGAATGCAAAATGAAGGAAGGATTGTGAACTGGAAGTTGATTTTGCAT 1776
Query 1777 GGGACCTCTTCTCAGCCAGAGCATATGAAGCAGCCTCGTGTGTACACGTCCTACAACACTGTTCAGAATGACAG 1850
|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1777 GGGACATCTTCTCAACCAGAGCACATGAAGCAGCCTCGTGTGTACACATCCTACAATACAGTCCAGAATGACAG 1850
Query 1851 AAGAGGGGTGGAGAAGATGGTGGATCCAGGGGAGGAGCAGCCCACACAAGAGAACCCTAAGGAGAACACCCTGG 1924
.|||||.|||||.|||||||||.||...|.||||.|||.||||||||||.|||.||..||.|..||...|||||
Sbjct 1851 GAGAGGAGTGGAAAAGATGGTGAATGTTGTGGAGAAGCGGCCCACACAAAAGAGCCTGAATGGCAATCTCCTGG 1924
Query 1925 TGTCCAAAAGCCCCAGCAGCAGCAGCGTAGGGGGCCGGAGGGATGAGTTGGAGGAGGGAGCCCCTTCCGAGGCC 1998
|..||||||.|.||||||||||||..||.|.|||..|.|||||||||..||...|.|||.|.|||||..|||||
Sbjct 1925 TACCCAAAAACTCCAGCAGCAGCAATGTGGAGGGTAGAAGGGATGAGCAGGTACAAGGAACTCCTTCAAAGGCC 1998
Query 1999 ATGCTGCGACTCCTGCAAAGTGCTTTCAGTAAAAACTCACCGCCAAAGCAATCACCAAAGAAGTCCCCAACTGC 2072
||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||..|||...||||.|||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 1999 ATGCTGCGACTCCTACAAAGTGCTTTTAGCAAGAATGCACTTTCAAAACAATCACCAAAGAAGTCTCCAAGTGC 2072
Query 2073 AAAGCTCAACATCCCTTATGAAAACTTCTACGAAGCCCTGGAAAAGCTGAACAAACCTTCCCAGCTTAAAGACT 2146
||||||||.||||||||||||||..|||||.||||||.||||||||||.|||||.||.|||.|||||.|||.||
Sbjct 2073 AAAGCTCAGCATCCCTTATGAAAGTTTCTATGAAGCCTTGGAAAAGCTCAACAAGCCCTCCAAGCTTGAAGGCT 2146
Query 2147 CTGAAGACAGTCTGTATAATGACTATGTTGATGTTTTTTATAACACTAAACCTTACAAGCACAGAGACGACCGG 2220
||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||.||
Sbjct 2147 CTGAAGACAGTCTGTACAGTGACTATGTTGATGTATTCTATAACACAAAACCTTATAAGCATAGAGATGACAGG 2220
Query 2221 CTGCTTCAAGCTCTGGTGGACATTCTGAATGAGGAAAAT 2259
|||||.||||||||..|||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 2221 CTGCTGCAAGCTCTCATGGACATCCTAAATGAGGAGAAT 2259