Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06700
- Subject:
- NM_001159952.1
- Aligned Length:
- 1903
- Identities:
- 1654
- Gaps:
- 38
Alignment
Query 1 ATGGAGTCGCCAACAAAGGAGATTGAAGAATTTGAGAGCAACTCTCTGAAATACCTGCAACCGGAACAGATCGA 74
||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTCTCCAACCAAGGAAATTGAAGAATTCGAGAGCAACTCTCTGAAACACCTGCAACCTGAGCAGATCGA 74
Query 75 GAAAATCTGGCTTCGGCTCCGCGGGCTGAGGAAATATAAGAAAACGTCCCAGAGATTACGGTCTTTGGTCAAAC 148
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||.|
Sbjct 75 GAAAATCTGGCTTCGGCTCCGCGGGCTG---------------------------TTACGGTCTTTGGTCAAGC 121
Query 149 AATTAGAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTAAGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCT 222
|||||||..||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 AATTAGAACGAGGAGAGGCCTCTGTGGTAGACCTTAAGAAGAATCTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCT 195
Query 223 GTGTATATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACAGAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCC 296
||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 196 GTATATATTGATGAAACAAGGCGACTGCTGGATACAGAGGATGAGCTTAGTGACATTCAATCAGATGCTGTGCC 269
Query 297 TTCTGAGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCACGCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGA 370
|||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 270 TTCAGAAGTTCGGGATTGGCTGGCCTCCACCTTCACACGGCAGATGGGGATGATGCTTAGGAGAAGTGATGAGA 343
Query 371 AGCCCCGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGGCTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCA 444
|||||.||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 344 AGCCCAGGTTCAAGAGCATCGTCCATGCGGTGCAAGCTGGGATATTTGTGGAAAGAATGTACAGACGGACATCA 417
Query 445 AACATGGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATTGAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCATTTGACGT 518
|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|.||||||.||.||.||
Sbjct 418 AACATGGTTGGGCTGAGCTATCCACCGGCTGTAATCGATGCATTGAAGGATGTGGATACGTGGTCCTTCGATGT 491
Query 519 CTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACTGAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATC 592
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct 492 CTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGAGATCATGCACTGAAGTTCATTTTCTATGAATTACTCACACGTTATGACC 565
Query 593 TGATCAGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAG 666
|||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 566 TGATCAGCCGTTTTAAGATACCGATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTCGAAGTGGGTTACAGCAAG 639
Query 667 CACAAAAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCCGATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGAC 740
|||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 640 CACAAAAATCCTTACCATAACCTGATGCATGCAGCTGACGTCACACAGACTGTGCATTACCTCCTTTATAAGAC 713
Query 741 AGGAGTGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTTTGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGC 814
||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 714 AGGAGTAGCAAACTGGCTGACAGAGCTGGAGATCTTTGCAATAATCTTTTCGGCTGCCATCCATGACTATGAAC 787
Query 815 ATACCGGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTA 888
||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 788 ATACTGGAACTACAAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCAGATCCAGCTATCCTGTACAATGACAGATCTGTC 861
Query 889 CTGGAGAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTTCTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCT 962
||||||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||.||.|||||||
Sbjct 862 CTGGAGAACCACCACCTGAGTGCAGCCTACCGCCTTCTGCAGGAAGACGAAGAGATGAATATTCTGGTTAACCT 935
Query 963 CTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGTAATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 936 CTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACTTTGGTTATTGAGATGGTAATGGCCACAGATATGTCCTGTCATT 1009
Query 1037 TCCAACAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGCAGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTT 1110
||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1010 TCCAGCAAATCAAAGCCATGAAGACAGCCCTGCAGCAACCAGAAGCAATTGAGAAGCCGAAAGCCTTATCCCTC 1083
Query 1111 ATGCTGCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAAGCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCT 1184
|||.|.||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1084 ATGTTACACACAGCAGACATCAGTCATCCTGCGAAAGCATGGGACCTGCACCACCGCTGGACCATGTCTCTCCT 1157
Query 1185 GGAGGAGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGT 1258
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1158 GGAGGAGTTCTTTAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCATTTTCTCCTCTTTGTGACAGAAAGT 1231
Query 1259 CCACTATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTGATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGAC 1332
|.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1232 CAACCATGGTTGCTCAGTCACAAGTGGGTTTTATTGACTTCATTGTGGAGCCCACCTTCACTGTGCTCACGGAC 1305
Query 1333 ATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAAACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAG 1406
|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||.||||||||||||||.||||||.|.||.||
Sbjct 1306 ATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATTGACGAAAGCTCCCAGACTGGTGGGACAGGGCAGAGGAGATCAAG 1379
Query 1407 TTTGAATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATCAGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGA 1480
||||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||||||||||..|||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1380 TTTGAACAGCATCAACTCATCAGATGCAAAGCGATCCGGTGTCAAGAGTTCTGGGTCAGATGGAAGTGCTCCCA 1453
Query 1481 TCAACAATTCTGTCATCTCC-GTTGACTATAAGAGCTTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCG 1553
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1454 TCAACAATTCTGTCAT-TCCTGTTGACTATAAGAGTTTTAAAGCCACTTGGACTGAGGTGGTGCAGATCAATCG 1526
Query 1554 GGAGAGATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAAGGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCATGGCCG 1627
||||.|.|||.|.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.|
Sbjct 1527 GGAGCGGTGGCGAGCCAAGGTACCCAAAGAAGAAAAAGCCAAGAAGGAAGCTGAAGAGAAGGCTCGCCTGGCTG 1600
Query 1628 CAGAGGAGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAG 1701
|.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||.|..||||||..|||||||||
Sbjct 1601 CTGAGGAAAAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAAGCTGAACAAGGCACAACCAGCAAAGGCGAGAAAAAG 1674
Query 1702 ACGTCTGGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACACGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAATTC 1775
||.||.||||||.|.||.|.|||||||||||||||||| |||..||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1675 ACATCAGGAGAAGCCAAAAGTCAAGTCAATGGAACACG------CAAGGGTGATAACCCTCGTGGGAAGAACTC 1742
Query 1776 CAAAGCCGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAATGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGA 1849
|||||..||.||| .||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1743 CAAAGGAGAAAAG---GCAGGCGAAAAGCAGCAGAACGGTGACTTGAAAGACGGTAAAAATAAGGCAGACAAGA 1813
Query 1850 AGGATCACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAACAGATGATTCACAAGAG 1902
||||||||||.||||.|||||||||.||||||||||||||||||.||.|.|||
Sbjct 1814 AGGATCACTCCAACACCGGAAATGAGTCAAAGAAAACAGATGATCCAGAGGAG 1866