Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06700
- Subject:
- NM_001159957.1
- Aligned Length:
- 1911
- Identities:
- 1593
- Gaps:
- 111
Alignment
Query 1 ATGGAGTCGCCAACAAAGGAGATTGAAGAATTTGAGAGCAACTCTCTGAAATACCTGCAACCGGAACAGATCGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAAATCTGGC--------TTCGGCTCCGCGGGCTGAGGAAATATAAGAAAACGTCCCAGAGATTACGGTCTTT 140
.|||| || |.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ------ATGGCCTACAGTATT------------CAGAGGAAATATAAGAAAACGTCCCAGAGGTTACGGTCTTT 56
Query 141 GGTCAAACAATTAGAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTAAGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGC 214
||||||.||||||||..||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 57 GGTCAAGCAATTAGAACGAGGAGAGGCCTCTGTGGTAGACCTTAAGAAGAATCTGGAATATGCAGCCACAGTGC 130
Query 215 TTGAATCTGTGTATATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACAGAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGAT 288
||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 131 TTGAATCTGTATATATTGATGAAACAAGGCGACTGCTGGATACAGAGGATGAGCTTAGTGACATTCAATCAGAT 204
Query 289 GCTGTGCCTTCTGAGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCACGCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAG 362
|||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 205 GCTGTGCCTTCAGAAGTTCGGGATTGGCTGGCCTCCACCTTCACACGGCAGATGGGGATGATGCTTAGGAGAAG 278
Query 363 CGACGAGAAGCCCCGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGGCTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGAC 436
.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 279 TGATGAGAAGCCCAGGTTCAAGAGCATCGTCCATGCGGTGCAAGCTGGGATATTTGTGGAAAGAATGTACAGAC 352
Query 437 GGACATCAAACATGGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATTGAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCA 510
|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|.||||||.
Sbjct 353 GGACATCAAACATGGTTGGGCTGAGCTATCCACCGGCTGTAATCGATGCATTGAAGGATGTGGATACGTGGTCC 426
Query 511 TTTGACGTCTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACTGAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACG 584
||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 427 TTCGATGTCTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGAGATCATGCACTGAAGTTCATTTTCTATGAATTACTCACACG 500
Query 585 TTATGATCTGATCAGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGAT 658
||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 501 TTATGACCTGATCAGCCGTTTTAAGATACCGATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTCGAAGTGGGTT 574
Query 659 ACAGCAAGCACAAAAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCCGATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTC 732
|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 575 ACAGCAAGCACAAAAATCCTTACCATAACCTGATGCATGCAGCTGACGTCACACAGACTGTGCATTACCTCCTT 648
Query 733 TATAAGACAGGAGTGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTTTGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGA 806
||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 649 TATAAGACAGGAGTAGCAAACTGGCTGACAGAGCTGGAGATCTTTGCAATAATCTTTTCGGCTGCCATCCATGA 722
Query 807 CTACGAGCATACCGGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACA 880
|||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 723 CTATGAACATACTGGAACTACAAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCAGATCCAGCTATCCTGTACAATGACA 796
Query 881 GATCTGTACTGGAGAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTTCTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTG 954
|||||||.||||||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||.||
Sbjct 797 GATCTGTCCTGGAGAACCACCACCTGAGTGCAGCCTACCGCCTTCTGCAGGAAGACGAAGAGATGAATATTCTG 870
Query 955 ATTAACCTCTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGTAATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTC 1028
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 871 GTTAACCTCTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACTTTGGTTATTGAGATGGTAATGGCCACAGATATGTC 944
Query 1029 TTGTCACTTCCAACAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGCAGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCT 1102
.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 945 CTGTCATTTCCAGCAAATCAAAGCCATGAAGACAGCCCTGCAGCAACCAGAAGCAATTGAGAAGCCGAAAGCCT 1018
Query 1103 TATCCCTTATGCTGCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAAGCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATG 1176
|||||||.|||.|.||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 1019 TATCCCTCATGTTACACACAGCAGACATCAGTCATCCTGCGAAAGCATGGGACCTGCACCACCGCTGGACCATG 1092
Query 1177 TCACTCCTGGAGGAGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGA 1250
||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1093 TCTCTCCTGGAGGAGTTCTTTAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCATTTTCTCCTCTTTGTGA 1166
Query 1251 CCGAAAGTCCACTATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTGATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGC 1324
|.|||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1167 CAGAAAGTCAACCATGGTTGCTCAGTCACAAGTGGGTTTTATTGACTTCATTGTGGAGCCCACCTTCACTGTGC 1240
Query 1325 TTACGGACATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAAACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGG 1398
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1241 TCACGGACATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATTGACGAAAGCTCCCAGACTGGTGGGACAGGGCAGAGG 1314
Query 1399 CGTTCGAGTTTGAATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATCAGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAG 1472
.|.||.||||||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||||||||||..|||||.|||||.|||||
Sbjct 1315 AGATCAAGTTTGAACAGCATCAACTCATCAGATGCAAAGCGATCCGGTGTCAAGAGTTCTGGGTCAGATGGAAG 1388
Query 1473 TGCCCCGATCAACAATTCTGTCATCTCC-GTTGACTATAAGAGCTTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCAC 1545
|||.||.||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1389 TGCTCCCATCAACAATTCTGTCAT-TCCTGTTGACTATAAGAGTTTTAAAGCCACTTGGACTGAGGTGGTGCAG 1461
Query 1546 ATCAATCGGGAGAGATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAAGGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCG 1619
||||||||||||.|.|||.|.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1462 ATCAATCGGGAGCGGTGGCGAGCCAAGGTACCCAAAGAAGAAAAAGCCAAGAAGGAAGCTGAAGAGAAGGCTCG 1535
Query 1620 CATGGCCGCAGAGGAGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTG 1693
|.||||.||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||.|..||||||..|
Sbjct 1536 CCTGGCTGCTGAGGAAAAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAAGCTGAACAAGGCACAACCAGCAAAGGCG 1609
Query 1694 AGAAAAAGACGTCTGGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACACGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGG 1767
||||||||||.||.||||||.|.||.|.|||||||||||||||||| |||..||||.||||||||||||
Sbjct 1610 AGAAAAAGACATCAGGAGAAGCCAAAAGTCAAGTCAATGGAACACG------CAAGGGTGATAACCCTCGTGGG 1677
Query 1768 AAAAATTCCAAAGCCGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAATGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGAC 1841
||.||.|||||||..||.||| .||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|
Sbjct 1678 AAGAACTCCAAAGGAGAAAAG---GCAGGCGAAAAGCAGCAGAACGGTGACTTGAAAGACGGTAAAAATAAGGC 1748
Query 1842 AGACAAGAAGGATCACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAACAGATGATTCACAAGAG 1902
||||||||||||||||||.||||.|||||||||.||||||||||||||||||.||.|.|||
Sbjct 1749 AGACAAGAAGGATCACTCCAACACCGGAAATGAGTCAAAGAAAACAGATGATCCAGAGGAG 1809