Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06700
- Subject:
- NM_001322055.1
- Aligned Length:
- 2127
- Identities:
- 1893
- Gaps:
- 225
Alignment
Query 1 ATGGAGTCGCCAACAAAGGAGATTGAAGAATTTGAGAGCAACTCTCTGAAATACCTGCAACCGGAACAGATCGA 74
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTCGCCAACCAAGGAGATTGAAGAATTTGAGAGCAACTCTCTGAAATACCTGCAACCGGAACAGATCGA 74
Query 75 GAAAATCTGGCTTCGGCTCCGCGGGCTGAGGAAATATAAGAAAACGTCCCAGAGATTACGGTCTTTGGTCAAAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAAATCTGGCTTCGGCTCCGCGGGCTGAGGAAATATAAGAAAACGTCCCAGAGATTACGGTCTTTGGTCAAAC 148
Query 149 AATTAGAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTAAGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AATTAGAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTAAGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCT 222
Query 223 GTGTATATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACAGAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGTATATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACAGAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCC 296
Query 297 TTCTGAGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCACGCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCTGAGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCACGCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGA 370
Query 371 AGCCCCGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGGCTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCCCCGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGGCTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCA 444
Query 445 AACATGGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATTGAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCATTTGACGT 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 AACATGGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATTGAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCCTTTGACGT 518
Query 519 CTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACTGAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACTGAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATC 592
Query 593 TGATCAGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGATCAGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAG 666
Query 667 CACAAAAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCCGATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CACAAAAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCCGATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGAC 740
Query 741 AGGAGTGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTTTGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGAGTGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTTTGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGC 814
Query 815 ATACCGGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATACCGGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTA 888
Query 889 CTGGAGAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTTCTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGGAGAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTTCTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCT 962
Query 963 CTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGTAATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGTAATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACT 1036
Query 1037 TCCAACAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGCAGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCCAACAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGCAGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTT 1110
Query 1111 ATGCTGCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAAGCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGCTGCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAAGCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCT 1184
Query 1185 GGAGGAGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAGGAGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGT 1258
Query 1259 CCACTATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTGATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCACTATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTGATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGAC 1332
Query 1333 ATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAAACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAAACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAG 1406
Query 1407 TTTGAATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATCAGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTTGAATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATCAGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGA 1480
Query 1481 TCAACAATTCTGTCATCTCCGTTGACTATAAGAGCTTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCGG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCAACAATTCTGTCATCTCCGTTGACTATAAGAGCTTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCGG 1554
Query 1555 GAGAGATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAAGGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCATGGCCGC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1555 GAGAGATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAAGGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCCTGGCCGC 1628
Query 1629 AGAGGAGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGAGGAGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAGA 1702
Query 1703 CGTCTGGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACACGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAATTCC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703 CGTCTGGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACACGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAACTCC 1776
Query 1777 AAAGCCGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAATGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAAGCCGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAATGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGAA 1850
Query 1851 GGATCACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAACAGATGATTCACAAGAG---------------------- 1902
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||.||.||
Sbjct 1851 GGATCACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAACAGATGGCACAAAACAGCGTTCTCACGGCTCACCAGCCC 1924
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 1925 CAAGCACCAGCTCCACGTGTCGCCTTACGTTGCCAGTCATCAAGCCTCCTTTGCGTCATTTTAAACGCCCTGCT 1998
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 1999 TACGCATCTAGCTCCTATGCACCTTCAGTCTCAAAGAAAACTGATGAGCATCCTGCAAGGTACAAGATGCTGGA 2072
Query 1903 ------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 2073 TCAGAGGATCAAAATGAAAAAGATTCAGAACATCTCACATAACTGGAACAGAAAA 2127