Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06700
- Subject:
- XM_006505734.1
- Aligned Length:
- 2315
- Identities:
- 1657
- Gaps:
- 430
Alignment
Query 1 ---ATGGAGTC--GC--CAACAAAG-GAGATTGAAGAA---TTTGAGAGCAACTCTCTGAAAT----------- 52
|.|||..| || |||.|||| |.|.||.||||| |..|||.||.|||.||.| .||
Sbjct 1 ATGACGGACACCAGCCACAAGAAAGAGGGCTTCAAGAAATGTAGGAGCGCCACTTTCAG-CATCGACGGGTACA 73
Query 53 -----ACC-----TGCAACCGGAACAGATCGAGAAAA----------------TCTGGCTT----CGG------ 90
||| |||||..|.|.||| ||||.|| .||.|||| |||
Sbjct 74 GCTTCACCATCGTTGCAAATGAAGCAG---GAGACAAGAATGCCAGACCACTTGCTCGCTTCTCCCGGTCTAAG 144
Query 91 --------------------CTCCGC--------GGGCTGA--GGAAATAT----------------------- 111
|||| | |||||.| ||.|||||
Sbjct 145 TCACAGAACTGCCTGTGGAACTCC-CTCATTGATGGGCTCACTGGGAATATTAAGGAGAAACCACGGCCAACAA 217
Query 112 ------------------------AAGAAA------------ACGT----------------CCCAG------- 126
|||||| | || |||||
Sbjct 218 TTGTCCAGGACACGCGACCCCCAGAAGAAATTCTGGCAGATGA-GTTGCCACAGCTGGATAGCCCAGAAGCTTT 290
Query 127 ----------------AGATTACGGTCTTTGGTCAAACAATTAGAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTA 184
||.|||||||||||||||||.||||||||..||||.||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 291 GGTGAAGACATCTTTCAGGTTACGGTCTTTGGTCAAGCAATTAGAACGAGGAGAGGCCTCTGTGGTAGACCTTA 364
Query 185 AGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCTGTGTATATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACA 258
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct 365 AGAAGAATCTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCTGTATATATTGATGAAACAAGGCGACTGCTGGATACA 438
Query 259 GAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCCTTCTGAGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCAC 332
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 439 GAGGATGAGCTTAGTGACATTCAATCAGATGCTGTGCCTTCAGAAGTTCGGGATTGGCTGGCCTCCACCTTCAC 512
Query 333 GCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGAAGCCCCGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGG 406
.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 513 ACGGCAGATGGGGATGATGCTTAGGAGAAGTGATGAGAAGCCCAGGTTCAAGAGCATCGTCCATGCGGTGCAAG 586
Query 407 CTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCAAACATGGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATT 480
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 587 CTGGGATATTTGTGGAAAGAATGTACAGACGGACATCAAACATGGTTGGGCTGAGCTATCCACCGGCTGTAATC 660
Query 481 GAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCATTTGACGTCTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACT 554
||.|||||.|||||||||||.|.||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 661 GATGCATTGAAGGATGTGGATACGTGGTCCTTCGATGTCTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGAGATCATGCACT 734
Query 555 GAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATCTGATCAGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTG 628
|||.||.||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 735 GAAGTTCATTTTCTATGAATTACTCACACGTTATGACCTGATCAGCCGTTTTAAGATACCGATTTCTGCACTTG 808
Query 629 TCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAGCACAAAAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCC 702
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||.
Sbjct 809 TCTCATTTGTGGAGGCCCTCGAAGTGGGTTACAGCAAGCACAAAAATCCTTACCATAACCTGATGCATGCAGCT 882
Query 703 GATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGACAGGAGTGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTT 776
||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 883 GACGTCACACAGACTGTGCATTACCTCCTTTATAAGACAGGAGTAGCAAACTGGCTGACAGAGCTGGAGATCTT 956
Query 777 TGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGCATACCGGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTC 850
|||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 TGCAATAATCTTTTCGGCTGCCATCCATGACTATGAACATACTGGAACTACAAACAATTTCCACATTCAGACTC 1030
Query 851 GGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTACTGGAGAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTT 924
||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||..|.||||||||.||.||||||
Sbjct 1031 GGTCAGATCCAGCTATCCTGTACAATGACAGATCTGTCCTGGAGAACCACCACCTGAGTGCAGCCTACCGCCTT 1104
Query 925 CTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCTCTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGT 998
|||||.||.|||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1105 CTGCAGGAAGACGAAGAGATGAATATTCTGGTTAACCTCTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACTTTGGT 1178
Query 999 AATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACTTCCAACAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGC 1072
.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1179 TATTGAGATGGTAATGGCCACAGATATGTCCTGTCATTTCCAGCAAATCAAAGCCATGAAGACAGCCCTGCAGC 1252
Query 1073 AGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTTATGCTGCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAA 1146
|.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1253 AACCAGAAGCAATTGAGAAGCCGAAAGCCTTATCCCTCATGTTACACACAGCAGACATCAGTCATCCTGCGAAA 1326
Query 1147 GCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCTGGAGGAGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGA 1220
|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 GCATGGGACCTGCACCACCGCTGGACCATGTCTCTCCTGGAGGAGTTCTTTAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGA 1400
Query 1221 GCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGTCCACTATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTG 1294
||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1401 GCTGGGGCTGCCATTTTCTCCTCTTTGTGACAGAAAGTCAACCATGGTTGCTCAGTCACAAGTGGGTTTTATTG 1474
Query 1295 ATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGACATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAA 1368
|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1475 ACTTCATTGTGGAGCCCACCTTCACTGTGCTCACGGACATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATTGACGAA 1548
Query 1369 ACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAGTTTGAATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATC 1442
|.|||.||.||||||||||||||.||||||.|.||.||||||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||
Sbjct 1549 AGCTCCCAGACTGGTGGGACAGGGCAGAGGAGATCAAGTTTGAACAGCATCAACTCATCAGATGCAAAGCGATC 1622
Query 1443 AGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGATCAACAATTCTGTCATCTCC-GTTGACTATAAGAGC 1515
.||||||||||..|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||.
Sbjct 1623 CGGTGTCAAGAGTTCTGGGTCAGATGGAAGTGCTCCCATCAACAATTCTGTCAT-TCCTGTTGACTATAAGAGT 1695
Query 1516 TTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCGGGAGAGATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAA 1589
||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||.|.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1696 TTTAAAGCCACTTGGACTGAGGTGGTGCAGATCAATCGGGAGCGGTGGCGAGCCAAGGTACCCAAAGAAGAAAA 1769
Query 1590 GGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCATGGCCGCAGAGGAGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCC 1663
.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770 AGCCAAGAAGGAAGCTGAAGAGAAGGCTCGCCTGGCTGCTGAGGAAAAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCC 1843
Query 1664 AGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAGACGTCTGGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACA 1737
|.||||||.|||||.||.|..||||||..|||||||||||.||.||||||.|.||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1844 AAGCTGAACAAGGCACAACCAGCAAAGGCGAGAAAAAGACATCAGGAGAAGCCAAAAGTCAAGTCAATGGAACA 1917
Query 1738 CGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAATTCCAAAGCCGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAA 1811
|| |||..||||.||||||||||||||.||.|||||||..||.||| .||||.|||.||||.|||||
Sbjct 1918 CG------CAAGGGTGATAACCCTCGTGGGAAGAACTCCAAAGGAGAAAAG---GCAGGCGAAAAGCAGCAGAA 1982
Query 1812 TGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGAAGGATCACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAA 1885
.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 1983 CGGTGACTTGAAAGACGGTAAAAATAAGGCAGACAAGAAGGATCACTCCAACACCGGAAATGAGTCAAAGAAAA 2056
Query 1886 CAGATGATTCACAAGAG--------------------------------------------------------- 1902
||||||.|.|| ||||.
Sbjct 2057 CAGATGGTACA-AAGAAGCGTTCTCATGGCTCACCTGCTCCGAGCACTAGTTCCACAAGTCGCATTACCTTGCC 2129
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 2130 AGTCATCAAGCCTCCTTTGCGTCACTTTAAGCGTCCTGCTTATGCATCTAGCTCCTATGCACCTTCCGTCCCGA 2203
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 2204 AGAAAACTGATGATCATCCTGTAAGATACAAGATGCTGGATCAGCGGATCAAGATGAAAAAGATCCAGAACATC 2277
Query 1903 --------------------- 1902
Sbjct 2278 TCTCATCACTGGAACAAAAAA 2298